More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0153 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0153  putative signal peptide protein  100 
 
 
314 aa  631  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700817  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  86.31 
 
 
314 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  86.17 
 
 
314 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  55.91 
 
 
319 aa  340  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  57.09 
 
 
284 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  47.04 
 
 
291 aa  256  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  46.12 
 
 
311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  50.63 
 
 
280 aa  242  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  46.15 
 
 
305 aa  242  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  51.53 
 
 
281 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  47.7 
 
 
284 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  48.95 
 
 
288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  42.86 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  48.48 
 
 
316 aa  222  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  45.42 
 
 
302 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0153  peptidase M48, Ste24p  49.16 
 
 
280 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0497682  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4392  hypothetical protein  42.86 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863393  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0332  peptidase M48 Ste24p  42.45 
 
 
422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0058  peptidase M48 Ste24p  41.8 
 
 
404 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3099  peptidase M48 Ste24p  44.49 
 
 
349 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3157  peptidase M48, Ste24p  43.27 
 
 
344 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3040  peptidase M48 Ste24p  42.86 
 
 
344 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359784  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6453  peptidase M48, Ste24p  42.86 
 
 
353 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2488  peptidase M48, Ste24p  42.45 
 
 
350 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3102  peptidase M48, Ste24p  42.45 
 
 
350 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  42.67 
 
 
272 aa  198  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3118  peptidase M48 Ste24p  42.04 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  39.27 
 
 
274 aa  196  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  42.24 
 
 
282 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  43.78 
 
 
271 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  44.07 
 
 
273 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  43.78 
 
 
273 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3243  hypothetical protein  43.22 
 
 
316 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2904  hypothetical protein  43.22 
 
 
344 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2185  hypothetical protein  43.22 
 
 
347 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3444  hypothetical protein  43.22 
 
 
347 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  44.35 
 
 
273 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  41.74 
 
 
280 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0179  hypothetical protein  43.22 
 
 
351 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0374  M48 family peptidase  43.22 
 
 
350 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  43.35 
 
 
272 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0189  hypothetical protein  43.22 
 
 
350 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  40.46 
 
 
272 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  42.13 
 
 
271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0154  M48 family peptidase  42.37 
 
 
346 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  41.7 
 
 
272 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  41.7 
 
 
279 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  42.55 
 
 
289 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  40.85 
 
 
272 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  38.72 
 
 
267 aa  186  6e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  42.17 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  40.6 
 
 
270 aa  183  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  39.57 
 
 
270 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  40.17 
 
 
270 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  37.24 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  36.84 
 
 
267 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  39.06 
 
 
268 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  40 
 
 
258 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  37.33 
 
 
285 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  32.64 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  37.8 
 
 
293 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  37.8 
 
 
275 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  32.22 
 
 
254 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  34.84 
 
 
266 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  36.96 
 
 
270 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  39.23 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  32.38 
 
 
262 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  40.48 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  32.14 
 
 
267 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  37.23 
 
 
268 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  31.6 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  32.65 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  31.98 
 
 
269 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  31.98 
 
 
269 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  40.33 
 
 
272 aa  132  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  31.98 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  36.92 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  32.52 
 
 
266 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  39.75 
 
 
264 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 
269 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  30.89 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  30.39 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2760  peptidase M48 Ste24p  41.62 
 
 
298 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.293753  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  42.2 
 
 
231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  32.89 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  37.37 
 
 
262 aa  126  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  32.79 
 
 
269 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  39.23 
 
 
271 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  32.11 
 
 
273 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  31.3 
 
 
266 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  37.87 
 
 
263 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  37.14 
 
 
255 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  38.29 
 
 
284 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  34.41 
 
 
320 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  39.9 
 
 
259 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  37 
 
 
268 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  35.61 
 
 
262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  32 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>