170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03790 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.33 
 
 		 489 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  44.91 
 
 		 498 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  60.55 
 
 		 292 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.23 
 
 		 492 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  56.07 
 
 		 478 aa  124  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  46.79 
 
 		 477 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  53.23 
 
 		 492 aa  122  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 		 474 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  46.15 
 
 		 486 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  53.51 
 
 		 484 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  46.15 
 
 		 474 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  41.29 
 
 		 488 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  45.51 
 
 		 486 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  52.94 
 
 		 493 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.58 
 
 		 499 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.41 
 
 		 496 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2832  transthyretin  58.72 
 
 		 121 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  49.12 
 
 		 486 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  44.87 
 
 		 486 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  45.04 
 
 		 473 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1390  hydroxyisourate hydrolase  56.14 
 
 		 118 aa  105  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177512  normal  0.143867 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  49.54 
 
 		 486 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  54.35 
 
 		 499 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  56.12 
 
 		 485 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.54 
 
 		 491 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3721  hydroxyisourate hydrolase  53.15 
 
 		 115 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  43.44 
 
 		 480 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1555  transthyretin-like protein  53.98 
 
 		 117 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552439  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  55.42 
 
 		 504 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  35.62 
 
 		 482 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  55.42 
 
 		 504 aa  97.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0207  transthyretin  53.1 
 
 		 117 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.384919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  41.09 
 
 		 480 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0356  transthyretin  51.75 
 
 		 118 aa  95.9  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470514  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3340  hydroxyisourate hydrolase  49.12 
 
 		 118 aa  95.9  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3291  hydroxyisourate hydrolase  48.67 
 
 		 117 aa  95.9  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.379415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0779  putative purine catabolism-related protein  51.33 
 
 		 117 aa  95.1  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1934  putative transthyretin-like protein  48.67 
 
 		 117 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3036  transthyretin  48.67 
 
 		 117 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3915  transthyretin  49.07 
 
 		 116 aa  92  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.471177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2324  hydroxyisourate hydrolase  47.79 
 
 		 117 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.511264  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4387  transthyretin  50.91 
 
 		 116 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1346  hydroxyisourate hydrolase  44.64 
 
 		 116 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49301  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2121  hydroxyisourate hydrolase  48.18 
 
 		 116 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156864 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  37.4 
 
 		 493 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1102  hydroxyisourate hydrolase  49.12 
 
 		 118 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.155476 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3148  hydroxyisourate hydrolase  50 
 
 		 118 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300279  normal  0.943913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0695  hydroxyisourate hydrolase  46.49 
 
 		 118 aa  89.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1294  hydroxyisourate hydrolase  47.79 
 
 		 117 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1123  transthyretin  50 
 
 		 116 aa  88.6  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.424087  normal  0.392641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1043  hydroxyisourate hydrolase  50 
 
 		 116 aa  88.6  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6121  transthyretin  45.13 
 
 		 117 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1957  transthyretin  45.13 
 
 		 117 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1981  hydroxyisourate hydrolase  45.13 
 
 		 117 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_004310  BR0508  hypothetical protein  48.25 
 
 		 118 aa  87.8  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3476  transthyretin  50 
 
 		 118 aa  88.2  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44820  putative transthyretin family protein  45.13 
 
 		 126 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal  0.119551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  35.29 
 
 		 482 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5268  transthyretin  44.25 
 
 		 117 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1426  transthyretin  48.65 
 
 		 117 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2884  hydroxyisourate hydrolase  50 
 
 		 118 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.11874 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0511  hydroxyisourate hydrolase  48.25 
 
 		 118 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1312  hydroxyisourate hydrolase  45.13 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965379 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3925  hydroxyisourate hydrolase  48.18 
 
 		 116 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3816  hydroxyisourate hydrolase  45.13 
 
 		 127 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2116  putative transthyretin-like protein precursor  46.9 
 
 		 117 aa  86.3  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.851558 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2072  transthyretin family protein  46.02 
 
 		 194 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835202  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2609  transthyretin  47.27 
 
 		 118 aa  86.3  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.846937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21140  hydroxyisourate hydrolase, transthyretin family protein  42.86 
 
 		 116 aa  86.3  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1116  transthyretin  49.09 
 
 		 116 aa  86.3  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  39.71 
 
 		 505 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2383  hydroxyisourate hydrolase  48.72 
 
 		 117 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.514314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2425  hydroxyisourate hydrolase  48.72 
 
 		 117 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1872  hydroxyisourate hydrolase  43.36 
 
 		 117 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  0.0980153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2434  transthyretin  47.37 
 
 		 117 aa  85.1  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2527  putative purine catabolism-related protein  48.72 
 
 		 117 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0546176  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1945  transthyretin  43.36 
 
 		 117 aa  85.1  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4492  hydroxyisourate hydrolase  47.27 
 
 		 120 aa  85.1  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.182838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1745  hydroxyisourate hydrolase  47.83 
 
 		 131 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2256  hydroxyisourate hydrolase  46.02 
 
 		 117 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3733  transthyretin  45.05 
 
 		 113 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4619  hydroxyisourate hydrolase  47.27 
 
 		 123 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437716 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2064  hydroxyisourate hydrolase  47.83 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0057415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1810  transthyretin  42.48 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  44.14 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5277  transthyretin  50 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0719  hydroxyisourate hydrolase  48.21 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0068  transthyretin  49.12 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1933  hydroxyisourate hydrolase  45.13 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0633664 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4870  hypothetical protein  45.13 
 
 		 113 aa  81.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3665  hypothetical protein  42.48 
 
 		 123 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0861  hydroxyisourate hydrolase  44.25 
 
 		 117 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0885  transthyretin  45.61 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0621325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5250  OHCU decarboxylase  43.64 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00421596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0450  hydroxyisourate hydrolase  41.8 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2684  putative transthyretin-like protein  45.45 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.427872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0842  transthyretin  49.12 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7200  putative transthyretin-like protein  42.74 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3205  hydroxyisourate hydrolase  44.04 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.429089 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>