79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2082 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 499 aa  1011    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  96.39 
 
 		 499 aa  956    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  84.85 
 
 		 504 aa  790    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  70.12 
 
 		 504 aa  682    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  67.7 
 
 		 491 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  75.05 
 
 		 486 aa  707    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  66.74 
 
 		 489 aa  634  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  65.67 
 
 		 493 aa  626  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.78 
 
 		 492 aa  618  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  64.92 
 
 		 486 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  64.57 
 
 		 492 aa  617  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  63.03 
 
 		 486 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  60.55 
 
 		 477 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  60.55 
 
 		 486 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  60.13 
 
 		 486 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  59.53 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  59.41 
 
 		 474 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  57.63 
 
 		 498 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.3 
 
 		 496 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  56 
 
 		 485 aa  488  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  51.37 
 
 		 488 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  41.97 
 
 		 484 aa  330  5.0000000000000004e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  39.96 
 
 		 478 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  38.71 
 
 		 473 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  37.41 
 
 		 493 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  39.21 
 
 		 480 aa  250  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  35.79 
 
 		 480 aa  249  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  38.53 
 
 		 479 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  38.21 
 
 		 482 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  37.77 
 
 		 505 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  35.46 
 
 		 482 aa  190  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  50.42 
 
 		 230 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.8 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.14 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  30.57 
 
 		 438 aa  54.3  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  28.92 
 
 		 381 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  29.74 
 
 		 610 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.27 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  25.33 
 
 		 640 aa  50.4  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  30.08 
 
 		 573 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0853  flavin-binding family monooxygenase  25.55 
 
 		 527 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  32.54 
 
 		 363 aa  47.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0128  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.07 
 
 		 364 aa  47.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000127351  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  27.31 
 
 		 422 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.29 
 
 		 348 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  28.24 
 
 		 422 aa  47  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.46 
 
 		 543 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2304  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.55 
 
 		 572 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.095773  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.44 
 
 		 369 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.52 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0369  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.79 
 
 		 567 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0374  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  27.48 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  31.84 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0813  cyclohexanone monooxygenase  30.92 
 
 		 543 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322706  normal  0.777116 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  44.64 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.24 
 
 		 442 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0817  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  33.67 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0219172  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  44.64 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  28.33 
 
 		 465 aa  44.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  32.56 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05338  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14280)  25.57 
 
 		 519 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  27.4 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.46 
 
 		 372 aa  44.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4391  putative potassium transport flavoprotein  27.87 
 
 		 598 aa  44.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2382  cyclic nucleotide-regulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.96 
 
 		 573 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  28.99 
 
 		 446 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2778  putative oxidoreductase  39.08 
 
 		 475 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.903592 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58800  NADH dehydrogenase, internal, ubiquinone  25.94 
 
 		 423 aa  44.3  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4048  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  29.03 
 
 		 600 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  38.89 
 
 		 465 aa  44.3  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2138  putative oxidoreductase  30.45 
 
 		 480 aa  44.3  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1667  putative oxidoreductase  43.21 
 
 		 483 aa  43.9  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.882058  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  48.21 
 
 		 455 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  36.25 
 
 		 469 aa  43.9  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.21 
 
 		 330 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  26.48 
 
 		 477 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  27.15 
 
 		 466 aa  43.5  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.39 
 
 		 361 aa  43.5  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  39.08 
 
 		 469 aa  43.1  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>