90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1796 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
485 aa  981    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  60.38 
 
 
474 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  60.17 
 
 
477 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  59.87 
 
 
486 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  60.17 
 
 
474 aa  551  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  59.03 
 
 
486 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  60.59 
 
 
496 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  57.87 
 
 
498 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  57.14 
 
 
486 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.09 
 
 
499 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  58.47 
 
 
504 aa  497  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  53.11 
 
 
488 aa  495  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  53.85 
 
 
504 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  56 
 
 
499 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  53.53 
 
 
486 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.88 
 
 
489 aa  478  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  52.14 
 
 
493 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  52.81 
 
 
492 aa  474  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  53.62 
 
 
486 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.68 
 
 
491 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.39 
 
 
492 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  45.3 
 
 
484 aa  368  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  41.9 
 
 
478 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  39.5 
 
 
473 aa  297  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  38.28 
 
 
493 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  41.55 
 
 
479 aa  273  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  39.68 
 
 
482 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  40.37 
 
 
505 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  38.15 
 
 
480 aa  253  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  40.61 
 
 
480 aa  247  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  35.84 
 
 
482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  55.74 
 
 
230 aa  121  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.77 
 
 
417 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.94 
 
 
420 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
419 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.9 
 
 
369 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  31.06 
 
 
573 aa  58.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.49 
 
 
348 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3359  Cyclohexanone monooxygenase  29.58 
 
 
548 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562542  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1464  Flavin-containing monooxygenase  29.33 
 
 
448 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3012  Cyclohexanone monooxygenase  29.17 
 
 
540 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  26.99 
 
 
419 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1820  flavin-containing monooxygenase FMO  26.88 
 
 
466 aa  51.2  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.22 
 
 
435 aa  50.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  24.23 
 
 
445 aa  50.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  33.09 
 
 
443 aa  50.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  25.37 
 
 
347 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0128  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.78 
 
 
364 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000127351  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.85 
 
 
375 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 
459 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44560  putative flavin-containing monooxygenase  29.25 
 
 
527 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  29.02 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  25.74 
 
 
444 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  28.19 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  24.86 
 
 
438 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  28.19 
 
 
439 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4944  flavin-containing monooxygenase FMO  25.68 
 
 
455 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310384  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
439 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  25 
 
 
347 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  25 
 
 
347 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  23.46 
 
 
425 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2070  Flavin-containing monooxygenase  30.69 
 
 
432 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  25 
 
 
347 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  25 
 
 
347 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1887  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.94 
 
 
377 aa  47  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05338  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14280)  24.29 
 
 
519 aa  47  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.97 
 
 
422 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.75 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1908  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.13 
 
 
357 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  27.68 
 
 
610 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  25 
 
 
347 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  23.53 
 
 
347 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  24.51 
 
 
347 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1519  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
483 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4752  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  29.55 
 
 
601 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.44 
 
 
506 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.685298  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 
358 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08351  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  25.15 
 
 
614 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1951  flavin-containing monooxygenase  42.68 
 
 
458 aa  44.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183741  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.79 
 
 
457 aa  44.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  27.14 
 
 
363 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.86 
 
 
543 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3504  flavin-containing monooxygenase FMO  29.33 
 
 
468 aa  44.3  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  46 
 
 
465 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.18 
 
 
348 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9081  Foxred2; FAD-dependent oxidoreductase domain containing 2  28.72 
 
 
532 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.646835  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  28.85 
 
 
524 aa  43.5  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  25.89 
 
 
637 aa  43.5  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3795  putative flavin-containing monooxygenase  29.13 
 
 
514 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1414  hypothetical protein  28.23 
 
 
429 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>