85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5315 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  92.83 
 
 		 474 aa  868    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 474 aa  947    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  70.66 
 
 		 498 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  95.99 
 
 		 486 aa  911    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  96.65 
 
 		 477 aa  917    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  95.36 
 
 		 486 aa  904    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.61 
 
 		 496 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  60.38 
 
 		 485 aa  531  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  59.41 
 
 		 499 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  57.73 
 
 		 486 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  59.48 
 
 		 486 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.39 
 
 		 489 aa  520  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  57.69 
 
 		 504 aa  518  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  57.93 
 
 		 492 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  56.56 
 
 		 493 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  60.85 
 
 		 504 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  55.79 
 
 		 486 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  59.41 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.87 
 
 		 492 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.87 
 
 		 491 aa  495  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  51.59 
 
 		 488 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  43.48 
 
 		 478 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  44.18 
 
 		 484 aa  335  7.999999999999999e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  40.22 
 
 		 473 aa  312  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  37.27 
 
 		 493 aa  286  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  39.12 
 
 		 480 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  40.29 
 
 		 479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  39.91 
 
 		 480 aa  253  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  39.68 
 
 		 505 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  38.56 
 
 		 482 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  36.46 
 
 		 482 aa  219  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  46.15 
 
 		 230 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  31.37 
 
 		 573 aa  62.4  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.73 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  29.58 
 
 		 637 aa  59.7  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  31.11 
 
 		 610 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  34.06 
 
 		 443 aa  57  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.7 
 
 		 348 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.65 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  29.67 
 
 		 491 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  29.33 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  29.19 
 
 		 422 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03590  monooxygenase protein, putative  26.27 
 
 		 648 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  28.97 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  22.92 
 
 		 445 aa  51.2  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.92 
 
 		 375 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  23.41 
 
 		 425 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.856954 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08351  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  26.54 
 
 		 614 aa  50.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  30.22 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2958  flavin-containing monooxygenase, putative  29.25 
 
 		 600 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.39 
 
 		 427 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  24.3 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05338  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14280)  24.86 
 
 		 519 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0977  putative flavin-binding monooxygenase  27.54 
 
 		 499 aa  47.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  30.92 
 
 		 448 aa  47.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4752  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  31.16 
 
 		 601 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.9 
 
 		 369 aa  47.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3323  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  29.14 
 
 		 600 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4506  cyclohexanone monooxygenase  28.05 
 
 		 661 aa  47  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3575  hypothetical protein  28.57 
 
 		 600 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.656903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4048  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  29.14 
 
 		 600 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3104  cyclohexanone monooxygenase  29.59 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452732  normal  0.352064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2301  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  26.42 
 
 		 496 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4033  putative monooxygenase protein  30.07 
 
 		 600 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7650  flavin-containing monooxygenase  30.07 
 
 		 600 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2542  monooxygenase protein, putative  27.21 
 
 		 603 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2143  hypothetical protein  29.64 
 
 		 607 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.941743  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0624  hypothetical protein  28.34 
 
 		 633 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0826  flavin-containing monooxygenase FMO  28.36 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0637  hypothetical protein  28.34 
 
 		 633 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0615  cyclohexanone monooxygenase  28.11 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0617  hypothetical protein  28.34 
 
 		 612 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.72 
 
 		 543 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.14 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0184  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.12 
 
 		 495 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  27.65 
 
 		 364 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  29.55 
 
 		 450 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0126  hypothetical protein  29.71 
 
 		 567 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.622475  normal  0.638978 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1869  putative peptide monooxygenase  28.74 
 
 		 438 aa  44.3  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4106  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.88 
 
 		 536 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.41 
 
 		 348 aa  43.1  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5449  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.69 
 
 		 488 aa  43.1  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.33 
 
 		 377 aa  43.1  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>