75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1759 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  86.05 
 
 		 504 aa  797    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  67.98 
 
 		 491 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  75.69 
 
 		 486 aa  711    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  69.31 
 
 		 504 aa  676    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 499 aa  1012    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  67.79 
 
 		 489 aa  643    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  96.39 
 
 		 499 aa  934    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  66.52 
 
 		 493 aa  629  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  65.69 
 
 		 492 aa  622  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  65.48 
 
 		 492 aa  622  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  65.13 
 
 		 486 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  63.66 
 
 		 486 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  60.77 
 
 		 477 aa  561  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  60.34 
 
 		 486 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  59.91 
 
 		 486 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  59.41 
 
 		 474 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  59.62 
 
 		 474 aa  548  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  57.2 
 
 		 498 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  56.24 
 
 		 485 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.3 
 
 		 496 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  51.58 
 
 		 488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  41.88 
 
 		 484 aa  327  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  38.86 
 
 		 478 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  36.96 
 
 		 493 aa  279  8e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  38.06 
 
 		 473 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  35.55 
 
 		 480 aa  246  8e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  38.14 
 
 		 480 aa  243  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  38 
 
 		 479 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  37.26 
 
 		 482 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  37.14 
 
 		 505 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  34.14 
 
 		 482 aa  193  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  49.58 
 
 		 230 aa  116  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.59 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.36 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  28.92 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  25.97 
 
 		 465 aa  50.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  30.43 
 
 		 438 aa  51.2  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.17 
 
 		 377 aa  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0853  flavin-binding family monooxygenase  25.33 
 
 		 527 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  28.7 
 
 		 610 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2304  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.55 
 
 		 572 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.095773  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  30.17 
 
 		 573 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0128  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.77 
 
 		 364 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000127351  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.41 
 
 		 442 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0369  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.82 
 
 		 567 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4391  putative potassium transport flavoprotein  28.28 
 
 		 598 aa  47.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.87 
 
 		 399 aa  47  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4506  cyclohexanone monooxygenase  26.91 
 
 		 661 aa  47  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  24.89 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2138  putative oxidoreductase  30.45 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  44.64 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  44.64 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.21 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.46 
 
 		 543 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  32.54 
 
 		 363 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0813  cyclohexanone monooxygenase  30.92 
 
 		 543 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322706  normal  0.777116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  26.85 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  28.51 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  46.43 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1667  putative oxidoreductase  41.3 
 
 		 483 aa  44.3  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.882058  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  27.31 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0248  putative oxidoreductase  33.62 
 
 		 478 aa  44.3  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0374  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  27.88 
 
 		 495 aa  43.9  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  39.08 
 
 		 469 aa  43.9  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7650  flavin-containing monooxygenase  33.08 
 
 		 600 aa  43.9  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6282  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  28.83 
 
 		 495 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03590  monooxygenase protein, putative  23.58 
 
 		 648 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  36.49 
 
 		 469 aa  43.5  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2382  cyclic nucleotide-regulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.36 
 
 		 573 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  28.57 
 
 		 671 aa  43.5  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4569  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 479 aa  43.5  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0074  monooxygenase flavin-binding family protein  26.02 
 
 		 484 aa  43.5  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3513  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 494 aa  43.5  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3323  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  28.04 
 
 		 600 aa  43.5  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>