74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2767 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  100 
 
 
482 aa  944    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  44.42 
 
 
480 aa  340  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  45.49 
 
 
505 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  45.24 
 
 
482 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  44.42 
 
 
480 aa  332  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  45.89 
 
 
479 aa  329  7e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  39.83 
 
 
484 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 
473 aa  257  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.9 
 
 
496 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 
477 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 
493 aa  249  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 
474 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  35.15 
 
 
478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  32.82 
 
 
488 aa  240  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  36.17 
 
 
486 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  36.72 
 
 
474 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  35.96 
 
 
486 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  36.73 
 
 
486 aa  232  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  35.96 
 
 
486 aa  232  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  35.48 
 
 
498 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.71 
 
 
492 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  35.84 
 
 
485 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
492 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.21 
 
 
489 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.58 
 
 
491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  32.71 
 
 
493 aa  212  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  34.67 
 
 
486 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 
504 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.22 
 
 
499 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  35.59 
 
 
504 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 
499 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  35.29 
 
 
230 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4106  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.96 
 
 
536 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9081  Foxred2; FAD-dependent oxidoreductase domain containing 2  29.09 
 
 
532 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.646835  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 
417 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4268  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.66 
 
 
527 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11422  monoxygenase  29.5 
 
 
491 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.178527  normal  0.251324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2127  monooxygenase FAD-binding protein  26.54 
 
 
524 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00953551  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.28 
 
 
420 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2098  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
430 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16420  predicted flavoprotein involved in K+ transport  26.02 
 
 
525 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
419 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 
330 aa  51.2  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  25.37 
 
 
347 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  25.37 
 
 
347 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  25.37 
 
 
347 aa  50.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  25.37 
 
 
347 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1699  putative flavin-binding monooxygenase  29.5 
 
 
492 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2686  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.19 
 
 
330 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493272  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  23.21 
 
 
484 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  25.49 
 
 
347 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  27.62 
 
 
428 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  25 
 
 
347 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 
445 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  26.67 
 
 
516 aa  48.5  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1882  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 
487 aa  47.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2129  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 
517 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.788233  normal  0.83266 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2758  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.8 
 
 
745 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  27.57 
 
 
489 aa  47.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2671  cyclohexanone monooxygenase  30.35 
 
 
498 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  27.56 
 
 
491 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4607  cyclohexanone monooxygenase  27.51 
 
 
529 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  24.2 
 
 
347 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  26.46 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  24.53 
 
 
637 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05570  predicted flavoprotein involved in K+ transport  30.57 
 
 
480 aa  45.8  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4287  putative monooxygenase  23.55 
 
 
506 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691811  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2852  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.41 
 
 
748 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0132054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1528  FAD-binding monooxygenase, putative  27.03 
 
 
496 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149589  normal  0.0289416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1839  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.88 
 
 
528 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.918547  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.08 
 
 
377 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1076  putative oxidoreductase  29.41 
 
 
421 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.374205  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44560  putative flavin-containing monooxygenase  24.22 
 
 
527 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03590  monooxygenase protein, putative  24.88 
 
 
648 aa  43.1  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>