74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2482 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  100 
 
 
446 aa  908    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  55.47 
 
 
422 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  55.23 
 
 
422 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 
420 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1076  putative oxidoreductase  36.54 
 
 
421 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.374205  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.52 
 
 
399 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.605553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.51 
 
 
543 aa  237  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.3 
 
 
417 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  29.75 
 
 
381 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4613  hypothetical protein  25.47 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3842  hypothetical protein  22.49 
 
 
403 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  28.97 
 
 
478 aa  60.1  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 
504 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  25.06 
 
 
435 aa  53.9  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  24.31 
 
 
488 aa  53.5  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 
459 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.34 
 
 
489 aa  53.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6126  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.15 
 
 
575 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
493 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4356  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.29 
 
 
568 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
477 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
474 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  25.24 
 
 
310 aa  50.4  0.00007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.03 
 
 
492 aa  50.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44774  predicted protein  23.34 
 
 
504 aa  50.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0253106  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1918  hypothetical protein  25.61 
 
 
411 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1425  L-ornithine 5-monooxygenase oxidoreductase protein  22.97 
 
 
445 aa  50.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.901724  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  28.5 
 
 
486 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  28.04 
 
 
486 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5027  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.8 
 
 
563 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2382  cyclic nucleotide-regulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.12 
 
 
573 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.297747  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  27.1 
 
 
486 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  23.59 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.73 
 
 
445 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  25.71 
 
 
419 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 
445 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  22.99 
 
 
492 aa  47.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4421  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.14 
 
 
572 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 
440 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  25.85 
 
 
486 aa  47  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  27.31 
 
 
425 aa  47  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  28.04 
 
 
486 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.06 
 
 
496 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1342  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28 
 
 
556 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.27 
 
 
840 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  25.69 
 
 
326 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2113  mycothione reductase  33.67 
 
 
470 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207955  normal  0.0141084 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0611  hypothetical protein  26.98 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.861753  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1817  putative siderophore biosynthesis oxidoreductase protein  24.4 
 
 
462 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2067  mycothione reductase  33.67 
 
 
470 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0894  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.79 
 
 
570 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410384  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2050  mycothione reductase  33.67 
 
 
470 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  25.59 
 
 
435 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4454  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.89 
 
 
577 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  26.42 
 
 
446 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  27.01 
 
 
470 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43699  predicted protein  21.69 
 
 
619 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0970266  normal  0.410345 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.49 
 
 
448 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.4 
 
 
374 aa  45.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  26.49 
 
 
407 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4746  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.14 
 
 
428 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137781  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4965  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.04 
 
 
466 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  26.34 
 
 
438 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  23.53 
 
 
383 aa  43.5  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0161  thioredoxin-disulfide reductase  20.99 
 
 
312 aa  43.5  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0944  thioredoxin reductase, putative  22.96 
 
 
353 aa  43.5  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6098  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.1 
 
 
553 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.5 
 
 
348 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5196  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.37 
 
 
562 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125456  decreased coverage  0.0027232 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5081  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.37 
 
 
562 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3172  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.37 
 
 
562 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  23.41 
 
 
419 aa  43.1  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0903  thioredoxin reductase  28.3 
 
 
353 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.429485  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>