27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3842 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3842  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  839    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4613  hypothetical protein  57.22 
 
 
397 aa  484  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1918  hypothetical protein  55.94 
 
 
411 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0611  hypothetical protein  30.51 
 
 
399 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.861753  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0945  hypothetical protein  27.96 
 
 
384 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0341788  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0964  hypothetical protein  27.96 
 
 
384 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000255426  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3016  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.15 
 
 
391 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.395777  normal  0.364184 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43699  predicted protein  26.04 
 
 
619 aa  140  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0970266  normal  0.410345 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0531  hypothetical protein  29.37 
 
 
384 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.276764  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4134  hypothetical protein  28.74 
 
 
422 aa  129  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2649  hypothetical protein  27.99 
 
 
431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488002  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44774  predicted protein  24.89 
 
 
504 aa  113  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0253106  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04921  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10680)  24.48 
 
 
592 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.335945  normal  0.271193 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4135  hypothetical protein  25.37 
 
 
416 aa  91.3  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.124119  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31755  predicted protein  22.66 
 
 
655 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0216247 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0533  FAD dependent oxidoreductase  21.74 
 
 
466 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0547  FAD dependent oxidoreductase  21.74 
 
 
466 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0671651 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  25.78 
 
 
422 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  22.72 
 
 
446 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  25.42 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.53 
 
 
543 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.6 
 
 
420 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24 
 
 
407 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1076  putative oxidoreductase  21.27 
 
 
421 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.374205  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.63 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.605553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.03 
 
 
470 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00508796 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.23 
 
 
513 aa  43.1  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>