26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0531 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0531  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  802    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.276764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0964  hypothetical protein  54.59 
 
 
384 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000255426  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0945  hypothetical protein  54.59 
 
 
384 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0341788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0611  hypothetical protein  33.08 
 
 
399 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.861753  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3016  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.82 
 
 
391 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.395777  normal  0.364184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4613  hypothetical protein  26.9 
 
 
397 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3842  hypothetical protein  29.37 
 
 
403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2649  hypothetical protein  25.85 
 
 
431 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488002  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4134  hypothetical protein  26.72 
 
 
422 aa  132  9e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1918  hypothetical protein  27.27 
 
 
411 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4135  hypothetical protein  27.05 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.124119  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44774  predicted protein  22.98 
 
 
504 aa  89.7  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0253106  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0533  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 
466 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0547  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 
466 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0671651 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04921  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10680)  25.84 
 
 
592 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.335945  normal  0.271193 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43699  predicted protein  23.77 
 
 
619 aa  62  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0970266  normal  0.410345 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3333  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  24.68 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07793  conserved hypothetical protein  26.36 
 
 
717 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.185522 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  25.6 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  24.31 
 
 
347 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4303  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.59 
 
 
405 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0647  flavin-containing monooxygenase FMO  23.11 
 
 
460 aa  42.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.85 
 
 
543 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>