26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0547 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0533  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
466 aa  936    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0547  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
466 aa  936    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0671651 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0964  hypothetical protein  24.01 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000255426  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0945  hypothetical protein  24.01 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0341788  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0531  hypothetical protein  26.78 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.276764  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0611  hypothetical protein  28.5 
 
 
399 aa  84  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.861753  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4613  hypothetical protein  24.69 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1918  hypothetical protein  25 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4135  hypothetical protein  26.73 
 
 
416 aa  76.6  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.124119  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2649  hypothetical protein  27.36 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488002  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3842  hypothetical protein  21.19 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3016  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 
391 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.395777  normal  0.364184 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4134  hypothetical protein  25.18 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04921  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10680)  26.57 
 
 
592 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.335945  normal  0.271193 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43699  predicted protein  21.98 
 
 
619 aa  62.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0970266  normal  0.410345 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44774  predicted protein  27.14 
 
 
504 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0253106  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  26.84 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  24.1 
 
 
437 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  25.46 
 
 
488 aa  47  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  24.58 
 
 
467 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.7 
 
 
367 aa  46.6  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.55 
 
 
425 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.730683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  26.33 
 
 
486 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  26.24 
 
 
361 aa  44.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13401  putative thioredoxin reductase  23.51 
 
 
458 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327116  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  25.74 
 
 
486 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>