126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2537 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  89.48 
 
 
486 aa  894    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  100 
 
 
486 aa  979    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.66 
 
 
499 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  63.09 
 
 
486 aa  591  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  61.39 
 
 
504 aa  581  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  64.82 
 
 
504 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  63.03 
 
 
499 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  57.69 
 
 
493 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.9 
 
 
492 aa  546  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  58.47 
 
 
492 aa  541  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.42 
 
 
489 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  57.73 
 
 
474 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.44 
 
 
491 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  57.51 
 
 
477 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  57.48 
 
 
486 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  57.26 
 
 
486 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  56.44 
 
 
474 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  55.39 
 
 
498 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.62 
 
 
496 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  53.53 
 
 
485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  48.09 
 
 
488 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  39.96 
 
 
478 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  39.54 
 
 
484 aa  299  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  36.86 
 
 
473 aa  259  9e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  35.32 
 
 
480 aa  250  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  38.06 
 
 
479 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  36.45 
 
 
493 aa  240  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  38.81 
 
 
480 aa  233  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  36.67 
 
 
505 aa  226  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  34.64 
 
 
482 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  35.96 
 
 
482 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  49.54 
 
 
230 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.17 
 
 
420 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.05 
 
 
543 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.45 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.61 
 
 
427 aa  61.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.49 
 
 
417 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  28.44 
 
 
610 aa  57.4  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  26.22 
 
 
438 aa  57  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 
419 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.72 
 
 
442 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  23.53 
 
 
480 aa  54.3  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  24.4 
 
 
422 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4106  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 
536 aa  53.9  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  25.29 
 
 
425 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3568  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 
520 aa  53.5  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310917  hitchhiker  0.00379062 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  24.4 
 
 
422 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  24.24 
 
 
344 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1577  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  29.09 
 
 
474 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.975611  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  25.29 
 
 
445 aa  52.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5412  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 
520 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  26.47 
 
 
347 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  26.84 
 
 
640 aa  50.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01611  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  27.27 
 
 
629 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0641774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  28.04 
 
 
446 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2444  K+ transport flavoprotein  26.7 
 
 
524 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.98 
 
 
435 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3091  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  23.71 
 
 
454 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.169338  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.38 
 
 
372 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  28.87 
 
 
428 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3857  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
530 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.416953 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4698  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
530 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3664  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
530 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427417  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  24.67 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5044  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
520 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.611983 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  26.34 
 
 
472 aa  48.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1908  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.9 
 
 
357 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2582  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.83 
 
 
457 aa  47.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5228  putative monooxygenase (flavin-binding family)  23.29 
 
 
509 aa  47.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  50 
 
 
688 aa  47.4  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  31.55 
 
 
363 aa  47  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.7 
 
 
367 aa  47  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  26.92 
 
 
637 aa  47  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  23.77 
 
 
437 aa  47  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.38 
 
 
470 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00508796 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  25 
 
 
347 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2295  putative oxidoreductase  56.1 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0445  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 
516 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.899914  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.24 
 
 
515 aa  46.6  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.5 
 
 
349 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0813  cyclohexanone monooxygenase  28.91 
 
 
543 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322706  normal  0.777116 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.81 
 
 
369 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  22.54 
 
 
437 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  24.57 
 
 
347 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  25 
 
 
347 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  25 
 
 
347 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  25 
 
 
347 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0369  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.56 
 
 
567 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.96 
 
 
348 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1887  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.15 
 
 
377 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1076  putative oxidoreductase  28.71 
 
 
421 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.374205  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1906  hypothetical protein  28.05 
 
 
379 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  27.27 
 
 
472 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0840  flavin-containing monooxygenase FMO  25.22 
 
 
507 aa  45.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  26.41 
 
 
650 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2304  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.28 
 
 
572 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.095773  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5196  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.86 
 
 
562 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125456  decreased coverage  0.0027232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.21 
 
 
399 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.605553 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  27.07 
 
 
472 aa  45.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.4 
 
 
422 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>