More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5228 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5155  flavin-containing monooxygenase FMO  86.44 
 
 		 506 aa  920    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3670  FAD dependent oxidoreductase  74.12 
 
 		 504 aa  744    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.483411 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5228  putative monooxygenase (flavin-binding family)  100 
 
 		 509 aa  1059    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13100  monooxygenase  60.62 
 
 		 495 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3830  cyclohexanone monooxygenase  56.07 
 
 		 508 aa  584  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0853  flavin-binding family monooxygenase  55.49 
 
 		 527 aa  561  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4170  hypothetical protein  55.3 
 
 		 499 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3682  FAD dependent oxidoreductase  56.43 
 
 		 493 aa  563  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0374  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  56.09 
 
 		 495 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1481  flavin-binding family monooxygenase  57.86 
 
 		 500 aa  550  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0344357  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48680  hypothetical protein  54.83 
 
 		 499 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.495007  hitchhiker  0.000481845 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4935  cyclohexanone monooxygenase  55.56 
 
 		 509 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5044  FAD dependent oxidoreductase  53.42 
 
 		 520 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.611983 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2444  K+ transport flavoprotein  53.2 
 
 		 524 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3568  FAD dependent oxidoreductase  52.27 
 
 		 520 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310917  hitchhiker  0.00379062 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4698  FAD dependent oxidoreductase  52.77 
 
 		 530 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5412  FAD dependent oxidoreductase  52.47 
 
 		 520 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3664  FAD dependent oxidoreductase  52.77 
 
 		 530 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3857  FAD dependent oxidoreductase  52.98 
 
 		 530 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.416953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5690  putative flavin-containing monooxygenase  55.21 
 
 		 486 aa  535  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0569686  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2413  FAD dependent oxidoreductase  54.7 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0445  FAD dependent oxidoreductase  53.8 
 
 		 516 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.899914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2545  FAD dependent oxidoreductase  55.81 
 
 		 494 aa  534  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000454873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0433  FAD dependent oxidoreductase  53.24 
 
 		 516 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.266425  hitchhiker  0.0000000915051 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1261  FAD-dependent oxidoreductase  52.89 
 
 		 532 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1075  monooxygenase flavin-binding family protein  52.67 
 
 		 532 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1538  FAD-dependent oxidoreductase  52.67 
 
 		 532 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2821  arylesterase/monoxygenase  52.67 
 
 		 532 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2674  FAD-dependent oxidoreductase  52.67 
 
 		 532 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290977  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0119  FAD-dependent oxidoreductase  52.67 
 
 		 532 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0100  hypothetical protein  52.47 
 
 		 532 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0403  arylesterase/monoxygenase  52.48 
 
 		 532 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1012  cyclohexanone monooxygenase  52.76 
 
 		 505 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2397  FAD dependent oxidoreductase  54.04 
 
 		 494 aa  520  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2103  FAD dependent oxidoreductase  53.22 
 
 		 505 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.712269  normal  0.0291228 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1138  monooxygenase flavin-binding family protein  52.06 
 
 		 497 aa  520  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139531  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5683  hypothetical protein  49.7 
 
 		 491 aa  514  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00144248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3065  FAD dependent oxidoreductase  51.57 
 
 		 500 aa  512  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.713679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0962  monooxygenase, flavin-binding family protein  49.9 
 
 		 491 aa  509  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1071  FAD dependent oxidoreductase  52.07 
 
 		 503 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4569  FAD dependent oxidoreductase  52.8 
 
 		 479 aa  508  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  49.19 
 
 		 494 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1968  FAD dependent oxidoreductase  52.7 
 
 		 485 aa  503  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2342  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  51.38 
 
 		 544 aa  502  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109518 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6845  flavin-containing monooxygenase FMO  51.02 
 
 		 508 aa  500  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.373013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6459  flavin binding monooxygenase  52.62 
 
 		 510 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5251  normal  0.105992 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13890  monooxygenase ethA  52.51 
 
 		 498 aa  500  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4462  flavin-containing monooxygenase FMO  49.59 
 
 		 508 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1543  FAD dependent oxidoreductase  50.62 
 
 		 489 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00915558  normal  0.0198569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5145  FAD dependent oxidoreductase  48.17 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5436  FAD dependent oxidoreductase  48.17 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2805  monooxygenase flavin-binding family protein  49.37 
 
 		 508 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5057  FAD dependent oxidoreductase  48.17 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1842  monooxygenase flavin-binding family protein  48.7 
 
 		 522 aa  475  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.418098  normal  0.080497 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0840  flavin-containing monooxygenase FMO  47.82 
 
 		 507 aa  475  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2290  flavin-containing monooxygenase FMO  47.78 
 
 		 540 aa  477  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.229134 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2206  FAD dependent oxidoreductase  49.06 
 
 		 493 aa  475  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5628  putative monooxygenase  48.88 
 
 		 494 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2638  FAD dependent oxidoreductase  49.79 
 
 		 477 aa  468  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753344  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0715  monooxygenase flavin-binding family protein  48.12 
 
 		 503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01354  putative aromatic-ring hydroxylase  48.85 
 
 		 491 aa  468  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684675  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2358  FAD dependent oxidoreductase  49.59 
 
 		 498 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00284909  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0072  flavin-containing monooxygenase FMO  49.48 
 
 		 510 aa  458  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10575  monooxygenase  48.48 
 
 		 486 aa  449  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1528  FAD dependent oxidoreductase  50.54 
 
 		 494 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.240611  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1558  FAD dependent oxidoreductase  50.43 
 
 		 494 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.898255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1582  FAD dependent oxidoreductase  50.43 
 
 		 494 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4499  FAD dependent oxidoreductase  47.51 
 
 		 509 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0521039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0074  monooxygenase flavin-binding family protein  47.53 
 
 		 484 aa  428  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1683  FAD dependent oxidoreductase  43.39 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1867  FAD dependent oxidoreductase  46.08 
 
 		 509 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.379734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3870  putative monooxygenase  47.02 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6776  flavin-containing monooxygenase FMO  43.31 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2891  putative monooxygenase  45.16 
 
 		 503 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.532899  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08898  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02570)  42.58 
 
 		 486 aa  395  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0651  putative flavin-containing monooxygenase  42.03 
 
 		 500 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3782  putative monooxygenase  43.62 
 
 		 514 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1542  putative monooxygenase  41.41 
 
 		 502 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.906051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1040  FAD dependent oxidoreductase  40.46 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1565  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 		 510 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4028  flavin-containing monooxygenase FMO  42.98 
 
 		 508 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03248  conserved hypothetical protein  41.28 
 
 		 514 aa  361  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1819  flavin-containing monooxygenase FMO  39.58 
 
 		 505 aa  347  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802985  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3530  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.83 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  27.67 
 
 		 505 aa  163  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.264104 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01877  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  28.64 
 
 		 570 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6279  flavin-containing monooxygenase FMO  28.36 
 
 		 508 aa  160  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  29.02 
 
 		 650 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07228  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  28.15 
 
 		 565 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.25292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  28.98 
 
 		 514 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  28.99 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 642 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13773  oxidoreductase  40.71 
 
 		 224 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 642 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.84 
 
 		 818 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1834  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.48 
 
 		 484 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3649  flavin-containing monooxygenase FMO  26.79 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.33 
 
 		 816 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.61 
 
 		 816 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.1 
 
 		 816 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>