More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1565 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1542  putative monooxygenase  64.27 
 
 		 502 aa  692    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.906051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1683  FAD dependent oxidoreductase  66.4 
 
 		 513 aa  702    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4028  flavin-containing monooxygenase FMO  65.7 
 
 		 508 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3782  putative monooxygenase  65.2 
 
 		 514 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1565  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 510 aa  1058    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0651  putative flavin-containing monooxygenase  62.88 
 
 		 500 aa  669    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1819  flavin-containing monooxygenase FMO  59.96 
 
 		 505 aa  617  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1040  FAD dependent oxidoreductase  52.64 
 
 		 503 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6776  flavin-containing monooxygenase FMO  49.7 
 
 		 496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0853  flavin-binding family monooxygenase  48.93 
 
 		 527 aa  495  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5690  putative flavin-containing monooxygenase  47.66 
 
 		 486 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0569686  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1012  cyclohexanone monooxygenase  45.04 
 
 		 505 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3682  FAD dependent oxidoreductase  46.91 
 
 		 493 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4935  cyclohexanone monooxygenase  44.99 
 
 		 509 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48680  hypothetical protein  46.68 
 
 		 499 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.495007  hitchhiker  0.000481845 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0445  FAD dependent oxidoreductase  43.87 
 
 		 516 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.899914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3857  FAD dependent oxidoreductase  42.34 
 
 		 530 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.416953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4170  hypothetical protein  45.82 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0374  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  45.84 
 
 		 495 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4698  FAD dependent oxidoreductase  42.14 
 
 		 530 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2103  FAD dependent oxidoreductase  42.74 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.712269  normal  0.0291228 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5412  FAD dependent oxidoreductase  41.17 
 
 		 520 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0433  FAD dependent oxidoreductase  42.22 
 
 		 516 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.266425  hitchhiker  0.0000000915051 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3664  FAD dependent oxidoreductase  42.14 
 
 		 530 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1481  flavin-binding family monooxygenase  46.28 
 
 		 500 aa  437  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0344357  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3568  FAD dependent oxidoreductase  41.97 
 
 		 520 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310917  hitchhiker  0.00379062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2413  FAD dependent oxidoreductase  44.38 
 
 		 500 aa  435  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0100  hypothetical protein  41.53 
 
 		 532 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2674  FAD-dependent oxidoreductase  41.53 
 
 		 532 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1075  monooxygenase flavin-binding family protein  41.53 
 
 		 532 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2444  K+ transport flavoprotein  41.41 
 
 		 524 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1538  FAD-dependent oxidoreductase  41.53 
 
 		 532 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0119  FAD-dependent oxidoreductase  41.53 
 
 		 532 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2821  arylesterase/monoxygenase  41.53 
 
 		 532 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1261  FAD-dependent oxidoreductase  41.53 
 
 		 532 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659914  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5044  FAD dependent oxidoreductase  42.71 
 
 		 520 aa  428  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.611983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0962  monooxygenase, flavin-binding family protein  44.47 
 
 		 491 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0403  arylesterase/monoxygenase  41.13 
 
 		 532 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3065  FAD dependent oxidoreductase  44.02 
 
 		 500 aa  425  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.713679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6459  flavin binding monooxygenase  43.03 
 
 		 510 aa  423  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5251  normal  0.105992 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1138  monooxygenase flavin-binding family protein  44.14 
 
 		 497 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139531  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13890  monooxygenase ethA  44.18 
 
 		 498 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1071  FAD dependent oxidoreductase  43.34 
 
 		 503 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6845  flavin-containing monooxygenase FMO  42.09 
 
 		 508 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.373013 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4462  flavin-containing monooxygenase FMO  44.11 
 
 		 508 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2358  FAD dependent oxidoreductase  45.92 
 
 		 498 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00284909  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4569  FAD dependent oxidoreductase  44.17 
 
 		 479 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1842  monooxygenase flavin-binding family protein  42.57 
 
 		 522 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.418098  normal  0.080497 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2397  FAD dependent oxidoreductase  45.09 
 
 		 494 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3830  cyclohexanone monooxygenase  41.41 
 
 		 508 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2545  FAD dependent oxidoreductase  45.94 
 
 		 494 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000454873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1968  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 		 485 aa  412  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5683  hypothetical protein  42.64 
 
 		 491 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00144248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  43.5 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5436  FAD dependent oxidoreductase  43.59 
 
 		 489 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5145  FAD dependent oxidoreductase  43.16 
 
 		 489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5057  FAD dependent oxidoreductase  43.16 
 
 		 489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5155  flavin-containing monooxygenase FMO  42.62 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0840  flavin-containing monooxygenase FMO  41.28 
 
 		 507 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2638  FAD dependent oxidoreductase  41.6 
 
 		 477 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753344  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3670  FAD dependent oxidoreductase  43.33 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.483411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2805  monooxygenase flavin-binding family protein  41.58 
 
 		 508 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0072  flavin-containing monooxygenase FMO  41.49 
 
 		 510 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5228  putative monooxygenase (flavin-binding family)  40.91 
 
 		 509 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0715  monooxygenase flavin-binding family protein  40.91 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1543  FAD dependent oxidoreductase  43.52 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00915558  normal  0.0198569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13100  monooxygenase  38.98 
 
 		 495 aa  375  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5628  putative monooxygenase  41.01 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3870  putative monooxygenase  42.07 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4499  FAD dependent oxidoreductase  40.47 
 
 		 509 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0521039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10575  monooxygenase  40.43 
 
 		 486 aa  359  8e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01354  putative aromatic-ring hydroxylase  40.34 
 
 		 491 aa  358  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684675  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0074  monooxygenase flavin-binding family protein  40.3 
 
 		 484 aa  352  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03248  conserved hypothetical protein  37.87 
 
 		 514 aa  342  1e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2206  FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 		 493 aa  341  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1867  FAD dependent oxidoreductase  39.92 
 
 		 509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.379734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2891  putative monooxygenase  40.43 
 
 		 503 aa  338  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.532899  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1528  FAD dependent oxidoreductase  39.87 
 
 		 494 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.240611  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1582  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1558  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.898255  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2342  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  35.59 
 
 		 544 aa  327  3e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109518 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2290  flavin-containing monooxygenase FMO  35.23 
 
 		 540 aa  327  5e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.229134 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08898  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02570)  36.52 
 
 		 486 aa  320  3.9999999999999996e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6279  flavin-containing monooxygenase FMO  29.85 
 
 		 508 aa  156  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1881  cyclohexanone monooxygenase  29.07 
 
 		 513 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3325  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.24 
 
 		 529 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  28.31 
 
 		 514 aa  153  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 642 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  26.84 
 
 		 650 aa  150  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 642 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07063  conserved hypothetical protein  28.35 
 
 		 551 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01877  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  27.32 
 
 		 570 aa  146  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5449  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.2 
 
 		 488 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0459  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 520 aa  143  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0671859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3649  flavin-containing monooxygenase FMO  27.23 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1789  flavin-binding monooxygenase  26.39 
 
 		 531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000161654 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1145  flavin-containing monooxygenase FMO  27.99 
 
 		 529 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854282  normal  0.14107 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4320  flavin-containing monooxygenase FMO  28.13 
 
 		 487 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.936959  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4430  flavin-containing monooxygenase FMO  28.13 
 
 		 487 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0263565  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1842  hypothetical protein  25.86 
 
 		 645 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>