More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3782 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0651  putative flavin-containing monooxygenase  75.41 
 
 		 500 aa  768    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4028  flavin-containing monooxygenase FMO  87.5 
 
 		 508 aa  905    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3782  putative monooxygenase  100 
 
 		 514 aa  1060    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1565  FAD dependent oxidoreductase  65.2 
 
 		 510 aa  699    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1542  putative monooxygenase  71.34 
 
 		 502 aa  740    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.906051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1683  FAD dependent oxidoreductase  85.43 
 
 		 513 aa  879    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1819  flavin-containing monooxygenase FMO  60.62 
 
 		 505 aa  625  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1040  FAD dependent oxidoreductase  56.06 
 
 		 503 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6776  flavin-containing monooxygenase FMO  54.53 
 
 		 496 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0853  flavin-binding family monooxygenase  51.29 
 
 		 527 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5690  putative flavin-containing monooxygenase  51.73 
 
 		 486 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0569686  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0445  FAD dependent oxidoreductase  49.68 
 
 		 516 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.899914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0433  FAD dependent oxidoreductase  48.25 
 
 		 516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.266425  hitchhiker  0.0000000915051 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1012  cyclohexanone monooxygenase  50.11 
 
 		 505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3682  FAD dependent oxidoreductase  50.21 
 
 		 493 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2444  K+ transport flavoprotein  46.31 
 
 		 524 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5044  FAD dependent oxidoreductase  46.08 
 
 		 520 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.611983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4170  hypothetical protein  47.84 
 
 		 499 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48680  hypothetical protein  47.64 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.495007  hitchhiker  0.000481845 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0403  arylesterase/monoxygenase  47.75 
 
 		 532 aa  458  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2397  FAD dependent oxidoreductase  48.4 
 
 		 494 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5412  FAD dependent oxidoreductase  45.07 
 
 		 520 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3857  FAD dependent oxidoreductase  46.6 
 
 		 530 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.416953 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3568  FAD dependent oxidoreductase  45.07 
 
 		 520 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310917  hitchhiker  0.00379062 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0100  hypothetical protein  47.22 
 
 		 532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1075  monooxygenase flavin-binding family protein  47.22 
 
 		 532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1538  FAD-dependent oxidoreductase  47.22 
 
 		 532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1261  FAD-dependent oxidoreductase  47.22 
 
 		 532 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659914  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2821  arylesterase/monoxygenase  47.22 
 
 		 532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0119  FAD-dependent oxidoreductase  47.22 
 
 		 532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4698  FAD dependent oxidoreductase  46.41 
 
 		 530 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6459  flavin binding monooxygenase  46.68 
 
 		 510 aa  455  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5251  normal  0.105992 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2674  FAD-dependent oxidoreductase  47.22 
 
 		 532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290977  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2545  FAD dependent oxidoreductase  49.79 
 
 		 494 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000454873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1481  flavin-binding family monooxygenase  49.18 
 
 		 500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0344357  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3664  FAD dependent oxidoreductase  46.41 
 
 		 530 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4935  cyclohexanone monooxygenase  49.36 
 
 		 509 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5145  FAD dependent oxidoreductase  46.63 
 
 		 489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4462  flavin-containing monooxygenase FMO  47.4 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5436  FAD dependent oxidoreductase  46.82 
 
 		 489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5057  FAD dependent oxidoreductase  46.63 
 
 		 489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0962  monooxygenase, flavin-binding family protein  45.1 
 
 		 491 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6845  flavin-containing monooxygenase FMO  46.61 
 
 		 508 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.373013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0374  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  45.19 
 
 		 495 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2103  FAD dependent oxidoreductase  45.55 
 
 		 505 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.712269  normal  0.0291228 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3830  cyclohexanone monooxygenase  46.06 
 
 		 508 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5683  hypothetical protein  44.58 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00144248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2638  FAD dependent oxidoreductase  47.43 
 
 		 477 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753344  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1138  monooxygenase flavin-binding family protein  48.31 
 
 		 497 aa  441  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139531  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4569  FAD dependent oxidoreductase  48.16 
 
 		 479 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2413  FAD dependent oxidoreductase  45.34 
 
 		 500 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1543  FAD dependent oxidoreductase  47.16 
 
 		 489 aa  438  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00915558  normal  0.0198569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13890  monooxygenase ethA  47.4 
 
 		 498 aa  438  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1071  FAD dependent oxidoreductase  45.96 
 
 		 503 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3065  FAD dependent oxidoreductase  43.83 
 
 		 500 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.713679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  45.49 
 
 		 494 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2358  FAD dependent oxidoreductase  47.64 
 
 		 498 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00284909  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0840  flavin-containing monooxygenase FMO  45.55 
 
 		 507 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1968  FAD dependent oxidoreductase  44.14 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0072  flavin-containing monooxygenase FMO  45.13 
 
 		 510 aa  418  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5155  flavin-containing monooxygenase FMO  44.35 
 
 		 506 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5228  putative monooxygenase (flavin-binding family)  43.62 
 
 		 509 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13100  monooxygenase  44.54 
 
 		 495 aa  412  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0715  monooxygenase flavin-binding family protein  45.19 
 
 		 503 aa  411  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1842  monooxygenase flavin-binding family protein  43.78 
 
 		 522 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.418098  normal  0.080497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5628  putative monooxygenase  43.44 
 
 		 494 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2805  monooxygenase flavin-binding family protein  43.12 
 
 		 508 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3670  FAD dependent oxidoreductase  45.47 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.483411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3870  putative monooxygenase  44.54 
 
 		 499 aa  389  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01354  putative aromatic-ring hydroxylase  41.78 
 
 		 491 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684675  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10575  monooxygenase  43.41 
 
 		 486 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2206  FAD dependent oxidoreductase  40.57 
 
 		 493 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2290  flavin-containing monooxygenase FMO  39.2 
 
 		 540 aa  361  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.229134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0074  monooxygenase flavin-binding family protein  41.49 
 
 		 484 aa  360  5e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4499  FAD dependent oxidoreductase  40.99 
 
 		 509 aa  359  6e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0521039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2891  putative monooxygenase  42.24 
 
 		 503 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.532899  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2342  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  39.84 
 
 		 544 aa  348  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1867  FAD dependent oxidoreductase  40.42 
 
 		 509 aa  346  6e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.379734  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08898  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02570)  37.87 
 
 		 486 aa  338  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1582  FAD dependent oxidoreductase  42.03 
 
 		 494 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1558  FAD dependent oxidoreductase  42.03 
 
 		 494 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.898255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1528  FAD dependent oxidoreductase  42.03 
 
 		 494 aa  336  7e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.240611  normal  0.501091 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03248  conserved hypothetical protein  38.11 
 
 		 514 aa  315  9e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 642 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 642 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1881  cyclohexanone monooxygenase  31.17 
 
 		 513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296412  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  31.03 
 
 		 514 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4430  flavin-containing monooxygenase FMO  30.53 
 
 		 487 aa  150  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0263565  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4320  flavin-containing monooxygenase FMO  30.53 
 
 		 487 aa  150  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.936959  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4506  cyclohexanone monooxygenase  30.02 
 
 		 661 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3325  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.83 
 
 		 529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1789  flavin-binding monooxygenase  28.14 
 
 		 531 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000161654 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  28.85 
 
 		 489 aa  147  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0184  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.09 
 
 		 495 aa  147  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3649  flavin-containing monooxygenase FMO  29.14 
 
 		 488 aa  147  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6774  flavin-containing monooxygenase FMO  29.4 
 
 		 464 aa  143  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.651237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3703  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 662 aa  143  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.82 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.685298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0316  cyclohexanone monooxygenase  26.67 
 
 		 656 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140448  normal  0.328483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4879  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491968  normal  0.91768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>