More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1040 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6776  flavin-containing monooxygenase FMO  59.19 
 
 
496 aa  634    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1040  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
503 aa  1036    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1542  putative monooxygenase  56 
 
 
502 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.906051  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1683  FAD dependent oxidoreductase  58.26 
 
 
513 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0651  putative flavin-containing monooxygenase  54.44 
 
 
500 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3782  putative monooxygenase  56.06 
 
 
514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1565  FAD dependent oxidoreductase  52.64 
 
 
510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377781  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4028  flavin-containing monooxygenase FMO  56.06 
 
 
508 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1819  flavin-containing monooxygenase FMO  51.04 
 
 
505 aa  511  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0853  flavin-binding family monooxygenase  46.39 
 
 
527 aa  475  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2545  FAD dependent oxidoreductase  47.31 
 
 
494 aa  458  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000454873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6459  flavin binding monooxygenase  47.01 
 
 
510 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5251  normal  0.105992 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0445  FAD dependent oxidoreductase  44.4 
 
 
516 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.899914  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4698  FAD dependent oxidoreductase  43.97 
 
 
530 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2103  FAD dependent oxidoreductase  44.92 
 
 
505 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.712269  normal  0.0291228 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3664  FAD dependent oxidoreductase  43.97 
 
 
530 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427417  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3857  FAD dependent oxidoreductase  44.94 
 
 
530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.416953 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1261  FAD-dependent oxidoreductase  44.54 
 
 
532 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659914  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0403  arylesterase/monoxygenase  44.54 
 
 
532 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0962  monooxygenase, flavin-binding family protein  46.5 
 
 
491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5044  FAD dependent oxidoreductase  43.74 
 
 
520 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.611983 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2821  arylesterase/monoxygenase  44.33 
 
 
532 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0100  hypothetical protein  44.33 
 
 
532 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1075  monooxygenase flavin-binding family protein  44.33 
 
 
532 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2674  FAD-dependent oxidoreductase  44.33 
 
 
532 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290977  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3568  FAD dependent oxidoreductase  43.37 
 
 
520 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310917  hitchhiker  0.00379062 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1538  FAD-dependent oxidoreductase  44.33 
 
 
532 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2397  FAD dependent oxidoreductase  48.15 
 
 
494 aa  445  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5690  putative flavin-containing monooxygenase  45.21 
 
 
486 aa  445  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0569686  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0119  FAD-dependent oxidoreductase  44.33 
 
 
532 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5412  FAD dependent oxidoreductase  42.97 
 
 
520 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0433  FAD dependent oxidoreductase  43.81 
 
 
516 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.266425  hitchhiker  0.0000000915051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48680  hypothetical protein  45.57 
 
 
499 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.495007  hitchhiker  0.000481845 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1481  flavin-binding family monooxygenase  46.19 
 
 
500 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0344357  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2638  FAD dependent oxidoreductase  47.01 
 
 
477 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753344  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4569  FAD dependent oxidoreductase  46.52 
 
 
479 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4170  hypothetical protein  44.74 
 
 
499 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2444  K+ transport flavoprotein  42.89 
 
 
524 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3682  FAD dependent oxidoreductase  44.51 
 
 
493 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63888  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2358  FAD dependent oxidoreductase  48.45 
 
 
498 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00284909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2413  FAD dependent oxidoreductase  44.95 
 
 
500 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.182818  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6845  flavin-containing monooxygenase FMO  44.25 
 
 
508 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.373013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13890  monooxygenase ethA  46.42 
 
 
498 aa  431  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1012  cyclohexanone monooxygenase  44.44 
 
 
505 aa  428  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5683  hypothetical protein  43.83 
 
 
491 aa  432  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00144248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5145  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 
489 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4935  cyclohexanone monooxygenase  44.1 
 
 
509 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4462  flavin-containing monooxygenase FMO  46.96 
 
 
508 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5057  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 
489 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0374  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  43.71 
 
 
495 aa  425  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3065  FAD dependent oxidoreductase  43.92 
 
 
500 aa  425  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.713679 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1543  FAD dependent oxidoreductase  47.32 
 
 
489 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00915558  normal  0.0198569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5436  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 
489 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1071  FAD dependent oxidoreductase  44.86 
 
 
503 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0072  flavin-containing monooxygenase FMO  45.76 
 
 
510 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3830  cyclohexanone monooxygenase  41.86 
 
 
508 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1138  monooxygenase flavin-binding family protein  44.19 
 
 
497 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139531  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  43.53 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13100  monooxygenase  41.89 
 
 
495 aa  411  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5155  flavin-containing monooxygenase FMO  42.44 
 
 
506 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1842  monooxygenase flavin-binding family protein  43.95 
 
 
522 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.418098  normal  0.080497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2805  monooxygenase flavin-binding family protein  42.24 
 
 
508 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0840  flavin-containing monooxygenase FMO  42.47 
 
 
507 aa  405  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01354  putative aromatic-ring hydroxylase  42.62 
 
 
491 aa  402  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5628  putative monooxygenase  43.62 
 
 
494 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5228  putative monooxygenase (flavin-binding family)  40.46 
 
 
509 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0715  monooxygenase flavin-binding family protein  40.9 
 
 
503 aa  391  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1968  FAD dependent oxidoreductase  41.37 
 
 
485 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3670  FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 
504 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.483411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2206  FAD dependent oxidoreductase  41.83 
 
 
493 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3870  putative monooxygenase  42.44 
 
 
499 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08898  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02570)  40.42 
 
 
486 aa  373  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0074  monooxygenase flavin-binding family protein  42.3 
 
 
484 aa  363  3e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4499  FAD dependent oxidoreductase  40.04 
 
 
509 aa  352  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0521039  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10575  monooxygenase  40.09 
 
 
486 aa  350  4e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2891  putative monooxygenase  41.83 
 
 
503 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.532899  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1528  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 
494 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.240611  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1582  FAD dependent oxidoreductase  41.39 
 
 
494 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1558  FAD dependent oxidoreductase  41.39 
 
 
494 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.898255  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1867  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 
509 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.379734  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2290  flavin-containing monooxygenase FMO  37.3 
 
 
540 aa  340  4e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.229134 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03248  conserved hypothetical protein  37.68 
 
 
514 aa  339  5.9999999999999996e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2342  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  37.29 
 
 
544 aa  333  3e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.109518 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01877  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  28.82 
 
 
570 aa  172  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326089  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07228  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  25.99 
 
 
565 aa  161  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.25292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  30.17 
 
 
505 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13065  monooxygenase  29.58 
 
 
524 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.118559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4608  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 
556 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 
642 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 
642 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1881  cyclohexanone monooxygenase  28.96 
 
 
513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296412  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  29.16 
 
 
650 aa  153  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.11 
 
 
506 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.685298  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  30.63 
 
 
489 aa  149  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3203  putative monooxygenase  27.29 
 
 
505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0255813  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3194  putative monooxygenase  27.29 
 
 
505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3256  putative monooxygenase  27.29 
 
 
505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3815  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.4 
 
 
505 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  29.26 
 
 
514 aa  147  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0184  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.56 
 
 
495 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>