More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3870 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3870  putative monooxygenase  100 
 
 
499 aa  1028    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0072  flavin-containing monooxygenase FMO  63.69 
 
 
510 aa  624  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2358  FAD dependent oxidoreductase  58.91 
 
 
498 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00284909  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4462  flavin-containing monooxygenase FMO  53.35 
 
 
508 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01354  putative aromatic-ring hydroxylase  54.43 
 
 
491 aa  536  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684675  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2891  putative monooxygenase  55.92 
 
 
503 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.532899  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6845  flavin-containing monooxygenase FMO  55.11 
 
 
508 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.373013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2805  monooxygenase flavin-binding family protein  53.14 
 
 
508 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1481  flavin-binding family monooxygenase  51.48 
 
 
500 aa  504  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0344357  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4569  FAD dependent oxidoreductase  50.64 
 
 
479 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  48.19 
 
 
494 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0853  flavin-binding family monooxygenase  49.17 
 
 
527 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0962  monooxygenase, flavin-binding family protein  49.25 
 
 
491 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6459  flavin binding monooxygenase  49.25 
 
 
510 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5251  normal  0.105992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5683  hypothetical protein  48.28 
 
 
491 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00144248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2103  FAD dependent oxidoreductase  49.58 
 
 
505 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.712269  normal  0.0291228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2413  FAD dependent oxidoreductase  48.85 
 
 
500 aa  487  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.182818  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1543  FAD dependent oxidoreductase  48.84 
 
 
489 aa  485  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00915558  normal  0.0198569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48680  hypothetical protein  49.79 
 
 
499 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.495007  hitchhiker  0.000481845 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0433  FAD dependent oxidoreductase  49.27 
 
 
516 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.266425  hitchhiker  0.0000000915051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2638  FAD dependent oxidoreductase  49.03 
 
 
477 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753344  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0445  FAD dependent oxidoreductase  49.27 
 
 
516 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.899914  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3682  FAD dependent oxidoreductase  48.28 
 
 
493 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63888  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3065  FAD dependent oxidoreductase  48.85 
 
 
500 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.713679 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13890  monooxygenase ethA  46.97 
 
 
498 aa  480  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3857  FAD dependent oxidoreductase  47.87 
 
 
530 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.416953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1071  FAD dependent oxidoreductase  48.07 
 
 
503 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5628  putative monooxygenase  48.2 
 
 
494 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4698  FAD dependent oxidoreductase  47.36 
 
 
530 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3664  FAD dependent oxidoreductase  47.36 
 
 
530 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427417  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5145  FAD dependent oxidoreductase  47.57 
 
 
489 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5436  FAD dependent oxidoreductase  47.57 
 
 
489 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3830  cyclohexanone monooxygenase  49.68 
 
 
508 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3568  FAD dependent oxidoreductase  47.15 
 
 
520 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310917  hitchhiker  0.00379062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5057  FAD dependent oxidoreductase  47.57 
 
 
489 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5412  FAD dependent oxidoreductase  47.15 
 
 
520 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4170  hypothetical protein  49.15 
 
 
499 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0403  arylesterase/monoxygenase  48.18 
 
 
532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5044  FAD dependent oxidoreductase  46.53 
 
 
520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.611983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2397  FAD dependent oxidoreductase  47.2 
 
 
494 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2444  K+ transport flavoprotein  45.23 
 
 
524 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1012  cyclohexanone monooxygenase  48.6 
 
 
505 aa  461  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5690  putative flavin-containing monooxygenase  47.33 
 
 
486 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0569686  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2545  FAD dependent oxidoreductase  48.49 
 
 
494 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000454873 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0100  hypothetical protein  46.9 
 
 
532 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0119  FAD-dependent oxidoreductase  47.11 
 
 
532 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1075  monooxygenase flavin-binding family protein  47.11 
 
 
532 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2674  FAD-dependent oxidoreductase  46.9 
 
 
532 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290977  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1538  FAD-dependent oxidoreductase  47.11 
 
 
532 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2821  arylesterase/monoxygenase  47.11 
 
 
532 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1138  monooxygenase flavin-binding family protein  46.92 
 
 
497 aa  459  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139531  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1261  FAD-dependent oxidoreductase  46.68 
 
 
532 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0374  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  46.68 
 
 
495 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1968  FAD dependent oxidoreductase  46.42 
 
 
485 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4935  cyclohexanone monooxygenase  47.36 
 
 
509 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0715  monooxygenase flavin-binding family protein  45.67 
 
 
503 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0074  monooxygenase flavin-binding family protein  46.62 
 
 
484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1842  monooxygenase flavin-binding family protein  44.95 
 
 
522 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.418098  normal  0.080497 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0840  flavin-containing monooxygenase FMO  46.65 
 
 
507 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13100  monooxygenase  46.43 
 
 
495 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5228  putative monooxygenase (flavin-binding family)  47.02 
 
 
509 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5155  flavin-containing monooxygenase FMO  45.38 
 
 
506 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2206  FAD dependent oxidoreductase  45.67 
 
 
493 aa  431  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08898  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02570)  44.97 
 
 
486 aa  426  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1542  putative monooxygenase  45.08 
 
 
502 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.906051  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1582  FAD dependent oxidoreductase  46.35 
 
 
494 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6776  flavin-containing monooxygenase FMO  45.29 
 
 
496 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1558  FAD dependent oxidoreductase  46.35 
 
 
494 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.898255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1528  FAD dependent oxidoreductase  45.96 
 
 
494 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.240611  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2290  flavin-containing monooxygenase FMO  44.55 
 
 
540 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.229134 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3670  FAD dependent oxidoreductase  47.2 
 
 
504 aa  415  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.483411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10575  monooxygenase  43.64 
 
 
486 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2342  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  44.51 
 
 
544 aa  411  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.109518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1683  FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 
513 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1867  FAD dependent oxidoreductase  46.02 
 
 
509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.379734  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1040  FAD dependent oxidoreductase  42.44 
 
 
503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4499  FAD dependent oxidoreductase  42.58 
 
 
509 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0521039  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0651  putative flavin-containing monooxygenase  43.04 
 
 
500 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4028  flavin-containing monooxygenase FMO  43.88 
 
 
508 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3782  putative monooxygenase  44.54 
 
 
514 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1565  FAD dependent oxidoreductase  42.07 
 
 
510 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377781  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03248  conserved hypothetical protein  41.18 
 
 
514 aa  383  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1819  flavin-containing monooxygenase FMO  42.14 
 
 
505 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802985  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13773  oxidoreductase  51.2 
 
 
224 aa  169  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  27.5 
 
 
489 aa  143  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0316  cyclohexanone monooxygenase  25.44 
 
 
656 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140448  normal  0.328483 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1273  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  29.4 
 
 
493 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1881  cyclohexanone monooxygenase  27.29 
 
 
513 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296412  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 
484 aa  136  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6279  flavin-containing monooxygenase FMO  27.61 
 
 
508 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0459  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 
520 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0671859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 
642 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  27.69 
 
 
505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 
642 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0043  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.52 
 
 
487 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.37 
 
 
506 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.685298  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2059  putative monooxygenase  28.85 
 
 
506 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.587027 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1471  flavin-binding monooxygenase-like protein  26.29 
 
 
524 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  25.49 
 
 
650 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  25.81 
 
 
524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>