More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1012 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4935  cyclohexanone monooxygenase  83.1 
 
 		 509 aa  857    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5690  putative flavin-containing monooxygenase  63.54 
 
 		 486 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0569686  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3682  FAD dependent oxidoreductase  62.45 
 
 		 493 aa  641    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1012  cyclohexanone monooxygenase  100 
 
 		 505 aa  1039    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0853  flavin-binding family monooxygenase  61.38 
 
 		 527 aa  649    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0445  FAD dependent oxidoreductase  60.9 
 
 		 516 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.899914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0433  FAD dependent oxidoreductase  60.2 
 
 		 516 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.266425  hitchhiker  0.0000000915051 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1261  FAD-dependent oxidoreductase  59.76 
 
 		 532 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1075  monooxygenase flavin-binding family protein  59.96 
 
 		 532 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2821  arylesterase/monoxygenase  59.96 
 
 		 532 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0119  FAD-dependent oxidoreductase  59.96 
 
 		 532 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1538  FAD-dependent oxidoreductase  59.96 
 
 		 532 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2674  FAD-dependent oxidoreductase  59.96 
 
 		 532 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290977  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0100  hypothetical protein  59.76 
 
 		 532 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0403  arylesterase/monoxygenase  60.04 
 
 		 532 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1138  monooxygenase flavin-binding family protein  57.95 
 
 		 497 aa  588  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139531  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3568  FAD dependent oxidoreductase  58.99 
 
 		 520 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310917  hitchhiker  0.00379062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5412  FAD dependent oxidoreductase  58.99 
 
 		 520 aa  588  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2444  K+ transport flavoprotein  56.87 
 
 		 524 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5044  FAD dependent oxidoreductase  58.64 
 
 		 520 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.611983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1071  FAD dependent oxidoreductase  57.61 
 
 		 503 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2103  FAD dependent oxidoreductase  56.37 
 
 		 505 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.712269  normal  0.0291228 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4698  FAD dependent oxidoreductase  58.44 
 
 		 530 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3664  FAD dependent oxidoreductase  58.44 
 
 		 530 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1968  FAD dependent oxidoreductase  57.41 
 
 		 485 aa  580  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3065  FAD dependent oxidoreductase  55.62 
 
 		 500 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.713679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2413  FAD dependent oxidoreductase  54.38 
 
 		 500 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3857  FAD dependent oxidoreductase  58.51 
 
 		 530 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.416953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1481  flavin-binding family monooxygenase  59.71 
 
 		 500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0344357  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2545  FAD dependent oxidoreductase  57.92 
 
 		 494 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000454873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0374  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  56.39 
 
 		 495 aa  568  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4170  hypothetical protein  56.6 
 
 		 499 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48680  hypothetical protein  56.9 
 
 		 499 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.495007  hitchhiker  0.000481845 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4569  FAD dependent oxidoreductase  57.44 
 
 		 479 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5683  hypothetical protein  54.04 
 
 		 491 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00144248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2397  FAD dependent oxidoreductase  56.88 
 
 		 494 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5145  FAD dependent oxidoreductase  54.96 
 
 		 489 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5436  FAD dependent oxidoreductase  54.96 
 
 		 489 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0962  monooxygenase, flavin-binding family protein  53.21 
 
 		 491 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6459  flavin binding monooxygenase  56.11 
 
 		 510 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5251  normal  0.105992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5057  FAD dependent oxidoreductase  54.96 
 
 		 489 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  54.23 
 
 		 494 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1842  monooxygenase flavin-binding family protein  55.04 
 
 		 522 aa  546  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.418098  normal  0.080497 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6845  flavin-containing monooxygenase FMO  54.47 
 
 		 508 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.373013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1543  FAD dependent oxidoreductase  56.16 
 
 		 489 aa  544  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00915558  normal  0.0198569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13890  monooxygenase ethA  56.14 
 
 		 498 aa  533  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2358  FAD dependent oxidoreductase  54.75 
 
 		 498 aa  527  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00284909  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5228  putative monooxygenase (flavin-binding family)  52.76 
 
 		 509 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3830  cyclohexanone monooxygenase  50.83 
 
 		 508 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5155  flavin-containing monooxygenase FMO  51.3 
 
 		 506 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0840  flavin-containing monooxygenase FMO  53.97 
 
 		 507 aa  514  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4462  flavin-containing monooxygenase FMO  51.65 
 
 		 508 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2805  monooxygenase flavin-binding family protein  50 
 
 		 508 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2638  FAD dependent oxidoreductase  53.04 
 
 		 477 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753344  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0715  monooxygenase flavin-binding family protein  52.25 
 
 		 503 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0072  flavin-containing monooxygenase FMO  50.73 
 
 		 510 aa  501  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5628  putative monooxygenase  51.48 
 
 		 494 aa  497  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2206  FAD dependent oxidoreductase  48.11 
 
 		 493 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1683  FAD dependent oxidoreductase  50.53 
 
 		 513 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01354  putative aromatic-ring hydroxylase  47.4 
 
 		 491 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684675  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3670  FAD dependent oxidoreductase  49.58 
 
 		 504 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.483411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13100  monooxygenase  48.55 
 
 		 495 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1565  FAD dependent oxidoreductase  45.04 
 
 		 510 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10575  monooxygenase  46.99 
 
 		 486 aa  456  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3782  putative monooxygenase  50.11 
 
 		 514 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1528  FAD dependent oxidoreductase  48.52 
 
 		 494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.240611  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1558  FAD dependent oxidoreductase  48.31 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.898255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1582  FAD dependent oxidoreductase  48.31 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0651  putative flavin-containing monooxygenase  48.19 
 
 		 500 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2342  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  45.14 
 
 		 544 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1542  putative monooxygenase  45.17 
 
 		 502 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.906051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4028  flavin-containing monooxygenase FMO  47.84 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1867  FAD dependent oxidoreductase  46.71 
 
 		 509 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.379734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3870  putative monooxygenase  48.6 
 
 		 499 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4499  FAD dependent oxidoreductase  45.16 
 
 		 509 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0521039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0074  monooxygenase flavin-binding family protein  45.4 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1040  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 503 aa  428  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1819  flavin-containing monooxygenase FMO  45.73 
 
 		 505 aa  428  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802985  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2290  flavin-containing monooxygenase FMO  44.66 
 
 		 540 aa  426  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.229134 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08898  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02570)  44.35 
 
 		 486 aa  422  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6776  flavin-containing monooxygenase FMO  44.59 
 
 		 496 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2891  putative monooxygenase  46.01 
 
 		 503 aa  415  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.532899  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03248  conserved hypothetical protein  42.38 
 
 		 514 aa  404  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4506  cyclohexanone monooxygenase  28.98 
 
 		 661 aa  157  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6279  flavin-containing monooxygenase FMO  25.65 
 
 		 508 aa  157  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01877  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  28.25 
 
 		 570 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0184  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.03 
 
 		 495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  27.8 
 
 		 524 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13773  oxidoreductase  47.02 
 
 		 224 aa  154  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1789  flavin-binding monooxygenase  26.05 
 
 		 531 aa  154  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000161654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.37 
 
 		 506 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.685298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  28.61 
 
 		 514 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 642 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 642 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0316  cyclohexanone monooxygenase  27.83 
 
 		 656 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140448  normal  0.328483 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1471  flavin-binding monooxygenase-like protein  26.74 
 
 		 524 aa  150  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3530  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.88 
 
 		 500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4879  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491968  normal  0.91768 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  28.44 
 
 		 816 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.3 
 
 		 816 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>