178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6858 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
417 aa  848    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1076  putative oxidoreductase  42.42 
 
 
421 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.374205  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.92 
 
 
420 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.45 
 
 
543 aa  274  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  36.12 
 
 
422 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  35.94 
 
 
422 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.15 
 
 
399 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.605553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  34.3 
 
 
446 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  30.65 
 
 
381 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1918  hypothetical protein  25.12 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.71 
 
 
381 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 
445 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  27.43 
 
 
486 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.71 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.71 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  26.77 
 
 
478 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.1 
 
 
330 aa  61.6  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  28.36 
 
 
486 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 
474 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 
477 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4613  hypothetical protein  23.81 
 
 
397 aa  60.1  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
473 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0211  L-lysine 6-monooxygenase  25.61 
 
 
427 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606934  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  33.02 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1464  Flavin-containing monooxygenase  26.6 
 
 
448 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  25.49 
 
 
486 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 
382 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 
382 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  25 
 
 
438 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.05 
 
 
422 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  28.1 
 
 
486 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 
485 aa  56.6  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.05 
 
 
348 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  28.09 
 
 
474 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.83 
 
 
491 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  26.39 
 
 
498 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.73 
 
 
489 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  26.73 
 
 
486 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1342  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.36 
 
 
466 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4033  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.81 
 
 
527 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909721  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  26.7 
 
 
419 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1998  putative potassium transport flavoprotein  28.85 
 
 
434 aa  54.3  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  29.8 
 
 
371 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  22.86 
 
 
488 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.14 
 
 
499 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
493 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.71 
 
 
362 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 
459 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30 
 
 
840 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2127  monooxygenase FAD-binding protein  25.39 
 
 
524 aa  53.5  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00953551  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  29.46 
 
 
493 aa  53.9  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.48 
 
 
492 aa  53.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  22.74 
 
 
378 aa  53.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4354  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.23 
 
 
516 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.64 
 
 
422 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  26.34 
 
 
419 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4106  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.59 
 
 
536 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7583  flavin-containing monooxygenase  25.6 
 
 
423 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0603  flavin-containing monooxygenase  26.57 
 
 
447 aa  52.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2852  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.37 
 
 
748 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0132054  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  30.33 
 
 
407 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  32.11 
 
 
480 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  22.72 
 
 
435 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
504 aa  50.4  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
422 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  28.64 
 
 
428 aa  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
492 aa  49.7  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2667  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.91 
 
 
748 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
449 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2758  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.37 
 
 
745 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  27.52 
 
 
335 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  24.03 
 
 
480 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0399  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.21 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  28.9 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  28.71 
 
 
318 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0332  hypothetical protein  25.52 
 
 
349 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.382291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.21 
 
 
362 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 
642 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 
642 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0128  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.96 
 
 
364 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000127351  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.91 
 
 
377 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.3 
 
 
496 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4240  putative flavoprotein  24.88 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.12 
 
 
442 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  34.31 
 
 
505 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0919  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  24.64 
 
 
442 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.245016  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.78 
 
 
335 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4440  cyclic nucleotide-binding protein  28.5 
 
 
575 aa  47  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0105368  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1905  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.23 
 
 
350 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0071584  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4608  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 
556 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.28 
 
 
470 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00508796 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  27.34 
 
 
321 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000254011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  28.16 
 
 
331 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  27.34 
 
 
321 aa  46.6  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000126981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  27.34 
 
 
321 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000016798  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  30.89 
 
 
323 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  27.34 
 
 
321 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000108143  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2216  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.34 
 
 
368 aa  46.6  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00232984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>