193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1514 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
543 aa  1093    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1076  putative oxidoreductase  46.53 
 
 
421 aa  355  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.374205  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.45 
 
 
417 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  38.48 
 
 
422 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.64 
 
 
420 aa  273  9e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  38.74 
 
 
422 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.74 
 
 
399 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.605553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  32.51 
 
 
446 aa  230  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  29.74 
 
 
381 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.48 
 
 
381 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.48 
 
 
381 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.48 
 
 
381 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 
504 aa  65.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  31.05 
 
 
486 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4613  hypothetical protein  24 
 
 
397 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  29.91 
 
 
486 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  28.05 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  25.9 
 
 
455 aa  58.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.91 
 
 
442 aa  57  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  27.73 
 
 
417 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0214  thioredoxin-disulfide reductase  23.58 
 
 
312 aa  56.6  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.136255  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 
449 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  27.78 
 
 
419 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4567  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
430 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.469601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.39 
 
 
435 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 
423 aa  55.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 
642 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 
642 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  41.03 
 
 
640 aa  54.7  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
459 aa  53.9  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2098  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 
430 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 
380 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238024 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7583  flavin-containing monooxygenase  27.43 
 
 
423 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0603  thioredoxin reductase  21.59 
 
 
309 aa  53.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00896552  hitchhiker  0.000000000102753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  28.51 
 
 
435 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0647  flavin-containing monooxygenase FMO  23.17 
 
 
460 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
445 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  29.57 
 
 
470 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  28.88 
 
 
428 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.32 
 
 
335 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 
493 aa  51.6  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  28.08 
 
 
371 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2625  hypothetical protein  27.07 
 
 
415 aa  51.2  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623222  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3795  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.47 
 
 
326 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000252573  hitchhiker  0.00000000266911 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.83 
 
 
448 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  23.58 
 
 
315 aa  50.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2147  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.57 
 
 
331 aa  50.8  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00308891  normal  0.0129855 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 
440 aa  50.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  21.56 
 
 
318 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  26.07 
 
 
364 aa  50.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  21.56 
 
 
318 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  21.56 
 
 
318 aa  50.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  21.56 
 
 
318 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.14 
 
 
427 aa  50.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  21.56 
 
 
318 aa  50.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  26.17 
 
 
501 aa  50.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3842  hypothetical protein  22.53 
 
 
403 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  26.89 
 
 
320 aa  50.4  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0633  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 
424 aa  50.4  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1550  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.24 
 
 
326 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  35.56 
 
 
318 aa  50.1  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3815  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.63 
 
 
505 aa  50.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  21.47 
 
 
321 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  21.47 
 
 
321 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  21.47 
 
 
321 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0893  hypothetical protein  22.66 
 
 
446 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.23 
 
 
374 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  27.73 
 
 
446 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  25.58 
 
 
344 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.57 
 
 
505 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.25 
 
 
330 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3060  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  25.62 
 
 
439 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2654  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.17 
 
 
445 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000731675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  21.56 
 
 
318 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0142  thioredoxin-disulfide reductase  23.83 
 
 
312 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27 
 
 
422 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  25.81 
 
 
334 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  36.05 
 
 
486 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  36.26 
 
 
309 aa  48.9  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1422  Flavin-containing monooxygenase  22.42 
 
 
434 aa  48.5  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1778  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 
337 aa  48.9  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.721481  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0182  thioredoxin-disulfide reductase  22.9 
 
 
312 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.68776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5135  flavin-containing monooxygenase  24.28 
 
 
447 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0161  thioredoxin-disulfide reductase  23.36 
 
 
312 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1869  thioredoxin reductase  22.12 
 
 
314 aa  48.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0723907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.5 
 
 
358 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0296  thioredoxin-disulfide reductase  24.65 
 
 
314 aa  47.8  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  28.02 
 
 
396 aa  47.4  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.05 
 
 
326 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00734465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  24.17 
 
 
320 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  23.14 
 
 
318 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  34.51 
 
 
304 aa  47.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  27.95 
 
 
450 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
473 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0862  hypothetical protein  22.38 
 
 
446 aa  47.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.32 
 
 
427 aa  47  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3065  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 
500 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.713679 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  39.77 
 
 
323 aa  47  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 
477 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0446  HI0933 family protein  24.21 
 
 
330 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>