126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02550 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  100 
 
 
455 aa  927    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5066  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  62.5 
 
 
442 aa  518  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3463  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  59.1 
 
 
444 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23385  hitchhiker  0.00214354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1869  putative peptide monooxygenase  56.26 
 
 
438 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2654  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  56.13 
 
 
445 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000731675  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5949  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  54.98 
 
 
463 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4488  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  52.22 
 
 
422 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3060  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  51.08 
 
 
439 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3691  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  49.05 
 
 
432 aa  359  6e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  45.41 
 
 
444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0367243  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  41.15 
 
 
443 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  41.74 
 
 
458 aa  293  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.19 
 
 
432 aa  292  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4789  lysine/ornithine N-monooxygenase  42.41 
 
 
458 aa  292  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00013329  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  41.55 
 
 
454 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  40.8 
 
 
438 aa  289  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1618  lysine/ornithine N-monooxygenase  40.93 
 
 
458 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00185713 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  40.71 
 
 
458 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  40.71 
 
 
458 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1540  lysine/ornithine N-monooxygenase  41.81 
 
 
458 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.310035  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1561  lysine/ornithine N-monooxygenase  41.59 
 
 
458 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000104933  normal  0.191057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3740  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.68 
 
 
439 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1345  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  39.45 
 
 
446 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865314  normal  0.202415 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0527  l-ornithine 5-monooxygenase  38.9 
 
 
456 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2095  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  38.94 
 
 
444 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4036  lysine/ornithine N-monooxygenase  40.23 
 
 
462 aa  279  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2416  l-ornithine 5-monooxygenase  40.08 
 
 
504 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0539899  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4074  L-ornithine 5-monooxygenase  38.85 
 
 
456 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0146729  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2090  l-ornithine 5-monooxygenase  41.07 
 
 
495 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869348  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25600  L-ornithine N5-oxygenase-PvdA-like protein  39.1 
 
 
453 aa  276  7e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0286  l-ornithine 5-monooxygenase  40.84 
 
 
517 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0287172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  41.07 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1944  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  41.07 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1973  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  38.7 
 
 
444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0295223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2120  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  38.22 
 
 
444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0401511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1859  L-ornithine N5-oxygenase  39.15 
 
 
445 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.886808  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1623  l-ornithine 5-monooxygenase  40.84 
 
 
468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0875  l-ornithine 5-monooxygenase  40.84 
 
 
468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635923  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3796  L-ornithine N5-oxygenase  38.46 
 
 
444 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902122  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1179  l-ornithine 5-monooxygenase  40.6 
 
 
468 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0820477  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3723  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.81 
 
 
452 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1825  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.44 
 
 
435 aa  266  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33810  L-ornithine N5-oxygenase  37.64 
 
 
443 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000120742  normal  0.0105626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2874  L-ornithine N5-oxygenase  37.41 
 
 
443 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123675  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05823  Ornithine monooxygenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8P5]  36.32 
 
 
498 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2660  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.97 
 
 
448 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4206  L-ornithine 5-monooxygenase oxidoreductase protein  35.39 
 
 
451 aa  226  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1425  L-ornithine 5-monooxygenase oxidoreductase protein  35.27 
 
 
445 aa  226  9e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.901724  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2151  lysine/ornithine N-monooxygenase  36.65 
 
 
431 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.115188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3622  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.92 
 
 
445 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3655  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  32.51 
 
 
446 aa  210  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2961  L-lysine 6-monooxygenase, putative  34.45 
 
 
440 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.480954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0211  L-lysine 6-monooxygenase  36.1 
 
 
427 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2746  L-lysine 6-monooxygenase, putative  32.62 
 
 
439 aa  203  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0296167  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6165  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  32.41 
 
 
434 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573981 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0592  lysine/ornithine N-monooxygenase  33.1 
 
 
447 aa  186  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301691  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2362  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  29.14 
 
 
421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.528948  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0659  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.35 
 
 
471 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4362  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  32.85 
 
 
451 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141166  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0197  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.03 
 
 
456 aa  176  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0156088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1073  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.49 
 
 
502 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118854  normal  0.903474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0571  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.89 
 
 
434 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.39 
 
 
425 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.730683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4219  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.71 
 
 
457 aa  169  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0286  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.26 
 
 
455 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0408  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.16 
 
 
431 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2835  monooxygenase  29.05 
 
 
427 aa  166  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1946  hypothetical protein  29.2 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02102  hypothetical protein  29.58 
 
 
468 aa  162  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.43 
 
 
435 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0513  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.63 
 
 
458 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.1 
 
 
452 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.79 
 
 
442 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.64 
 
 
505 aa  159  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1046  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.02 
 
 
437 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2739  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.07 
 
 
428 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.43 
 
 
445 aa  157  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3460  L-lysine 6-monooxygenase  30.35 
 
 
434 aa  156  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  30.97 
 
 
438 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  27.31 
 
 
437 aa  156  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.37 
 
 
428 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.66 
 
 
437 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  30.95 
 
 
425 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3333  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30 
 
 
449 aa  155  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.17 
 
 
501 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.242413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1802  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.57 
 
 
496 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000066726  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2708  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.93 
 
 
501 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2411  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.85 
 
 
505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0217  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.67 
 
 
502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1656  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.93 
 
 
501 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130755 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3091  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.31 
 
 
454 aa  153  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.169338  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3030  siderophore biosynthesis protein  26.41 
 
 
498 aa  153  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.65 
 
 
444 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1054  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.41 
 
 
463 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2730  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.7 
 
 
501 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.100586  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2546  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.9 
 
 
432 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3173  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.57 
 
 
440 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1630  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.76 
 
 
445 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2447  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  27.68 
 
 
432 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3189  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  27.68 
 
 
432 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.603333  normal  0.0134512 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>