124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1540 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1179  l-ornithine 5-monooxygenase  74.68 
 
 
468 aa  688    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0820477  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2090  l-ornithine 5-monooxygenase  75.11 
 
 
495 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869348  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4789  lysine/ornithine N-monooxygenase  94.32 
 
 
458 aa  877    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00013329  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2416  l-ornithine 5-monooxygenase  74.64 
 
 
504 aa  704    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0539899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0527  l-ornithine 5-monooxygenase  73.48 
 
 
456 aa  678    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  94.54 
 
 
458 aa  877    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1540  lysine/ornithine N-monooxygenase  100 
 
 
458 aa  925    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.310035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  94.54 
 
 
458 aa  877    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1623  l-ornithine 5-monooxygenase  74.89 
 
 
468 aa  691    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0286  l-ornithine 5-monooxygenase  74.89 
 
 
517 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0287172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  75.11 
 
 
468 aa  692    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1944  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  75.11 
 
 
468 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0875  l-ornithine 5-monooxygenase  74.89 
 
 
468 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635923  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  87.34 
 
 
454 aa  788    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1618  lysine/ornithine N-monooxygenase  94.1 
 
 
458 aa  874    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00185713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1561  lysine/ornithine N-monooxygenase  99.13 
 
 
458 aa  916    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000104933  normal  0.191057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4074  L-ornithine 5-monooxygenase  72.83 
 
 
456 aa  678    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0146729  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4036  lysine/ornithine N-monooxygenase  67.24 
 
 
462 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33810  L-ornithine N5-oxygenase  51.59 
 
 
443 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000120742  normal  0.0105626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  53.19 
 
 
438 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2874  L-ornithine N5-oxygenase  50 
 
 
443 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2120  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  50.57 
 
 
444 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0401511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2095  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  50.12 
 
 
444 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25600  L-ornithine N5-oxygenase-PvdA-like protein  48.05 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50.72 
 
 
432 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3796  L-ornithine N5-oxygenase  49.32 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902122  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1973  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  49.09 
 
 
444 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0295223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1859  L-ornithine N5-oxygenase  49.64 
 
 
445 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.886808  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3740  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  51.76 
 
 
439 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3723  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  49.42 
 
 
452 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1825  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  48.82 
 
 
435 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  51.18 
 
 
443 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  48.68 
 
 
458 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1345  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  45.28 
 
 
446 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865314  normal  0.202415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1869  putative peptide monooxygenase  43.03 
 
 
438 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3463  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.68 
 
 
444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23385  hitchhiker  0.00214354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5066  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.98 
 
 
442 aa  302  9e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3691  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.6 
 
 
432 aa  298  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05823  Ornithine monooxygenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8P5]  40.49 
 
 
498 aa  293  5e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2654  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.36 
 
 
445 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000731675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  42.82 
 
 
455 aa  283  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4488  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.6 
 
 
422 aa  283  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3060  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  42.92 
 
 
439 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3622  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.55 
 
 
445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5949  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.53 
 
 
463 aa  266  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2660  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.77 
 
 
448 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2151  lysine/ornithine N-monooxygenase  37.65 
 
 
431 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.115188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.89 
 
 
444 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0367243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4206  L-ornithine 5-monooxygenase oxidoreductase protein  34.92 
 
 
451 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1425  L-ornithine 5-monooxygenase oxidoreductase protein  36.43 
 
 
445 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.901724  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2961  L-lysine 6-monooxygenase, putative  35.8 
 
 
440 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.480954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3655  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  33.56 
 
 
446 aa  223  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4362  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  37.12 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141166  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2746  L-lysine 6-monooxygenase, putative  34.11 
 
 
439 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0296167  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6165  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  33.95 
 
 
434 aa  200  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0211  L-lysine 6-monooxygenase  34.04 
 
 
427 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0659  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.59 
 
 
471 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0408  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.82 
 
 
431 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2362  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  29.16 
 
 
421 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.528948  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0286  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.8 
 
 
455 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0197  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.47 
 
 
456 aa  183  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0156088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4219  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.56 
 
 
457 aa  180  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6320  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.57 
 
 
446 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.58 
 
 
428 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0592  lysine/ornithine N-monooxygenase  34.13 
 
 
447 aa  177  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301691  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2739  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.58 
 
 
428 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1073  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.77 
 
 
502 aa  176  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118854  normal  0.903474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2835  monooxygenase  30.19 
 
 
427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.86 
 
 
505 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  31.37 
 
 
438 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3030  siderophore biosynthesis protein  30.77 
 
 
498 aa  170  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1946  hypothetical protein  30.32 
 
 
445 aa  170  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4294  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.15 
 
 
432 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093868  hitchhiker  0.0000660921 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0217  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.3 
 
 
502 aa  170  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.11 
 
 
442 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0571  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.27 
 
 
434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1054  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.03 
 
 
463 aa  166  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.71 
 
 
495 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.9 
 
 
437 aa  166  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1454  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.43 
 
 
496 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0919  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.38 
 
 
442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.245016  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1510  siderophore biosynthesis protein  30.86 
 
 
496 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1656  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.66 
 
 
501 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130755 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3333  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.24 
 
 
449 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.12 
 
 
435 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.41 
 
 
444 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2411  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.25 
 
 
505 aa  157  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1802  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.72 
 
 
496 aa  156  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000066726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.99 
 
 
501 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.242413 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0513  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.39 
 
 
458 aa  156  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1811  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.4 
 
 
426 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2708  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.2 
 
 
501 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2730  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.2 
 
 
501 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.100586  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0135  siderophore biosynthetis protein  27.21 
 
 
442 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  28.64 
 
 
437 aa  155  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1810  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.56 
 
 
442 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2447  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  28.09 
 
 
432 aa  154  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.55 
 
 
425 aa  154  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.730683 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3189  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  28.09 
 
 
432 aa  154  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.603333  normal  0.0134512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2546  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.09 
 
 
432 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>