122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_33810 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1859  L-ornithine N5-oxygenase  74.72 
 
 
445 aa  707    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.886808  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33810  L-ornithine N5-oxygenase  100 
 
 
443 aa  914    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000120742  normal  0.0105626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2874  L-ornithine N5-oxygenase  83.75 
 
 
443 aa  783    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25600  L-ornithine N5-oxygenase-PvdA-like protein  68.78 
 
 
453 aa  614  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2120  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  65.65 
 
 
444 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0401511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2095  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  65.65 
 
 
444 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3796  L-ornithine N5-oxygenase  63.87 
 
 
444 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902122  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1973  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  63.87 
 
 
444 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0295223 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  51.69 
 
 
432 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1618  lysine/ornithine N-monooxygenase  51.59 
 
 
458 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00185713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4789  lysine/ornithine N-monooxygenase  51.36 
 
 
458 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00013329  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  51.59 
 
 
458 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1540  lysine/ornithine N-monooxygenase  51.59 
 
 
458 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.310035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  51.59 
 
 
458 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  52.21 
 
 
454 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1561  lysine/ornithine N-monooxygenase  51.25 
 
 
458 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000104933  normal  0.191057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  49.28 
 
 
443 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3740  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50.12 
 
 
439 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3723  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50.95 
 
 
452 aa  411  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1825  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  46.84 
 
 
435 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4074  L-ornithine 5-monooxygenase  49.41 
 
 
456 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0146729  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1179  l-ornithine 5-monooxygenase  48.13 
 
 
468 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0820477  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2090  l-ornithine 5-monooxygenase  47.91 
 
 
495 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869348  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2416  l-ornithine 5-monooxygenase  47.63 
 
 
504 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0539899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1623  l-ornithine 5-monooxygenase  48.13 
 
 
468 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0286  l-ornithine 5-monooxygenase  48.13 
 
 
517 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0287172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  47.91 
 
 
468 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1944  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  47.91 
 
 
468 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0875  l-ornithine 5-monooxygenase  48.13 
 
 
468 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  48.56 
 
 
438 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  46.86 
 
 
458 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0527  l-ornithine 5-monooxygenase  48.6 
 
 
456 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4036  lysine/ornithine N-monooxygenase  50.35 
 
 
462 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1345  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  43.36 
 
 
446 aa  339  7e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865314  normal  0.202415 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05823  Ornithine monooxygenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8P5]  40.61 
 
 
498 aa  306  7e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1869  putative peptide monooxygenase  39.91 
 
 
438 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3691  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.75 
 
 
432 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2654  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.53 
 
 
445 aa  279  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000731675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3463  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.36 
 
 
444 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23385  hitchhiker  0.00214354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5066  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.76 
 
 
442 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5949  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.23 
 
 
463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  36.94 
 
 
455 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4488  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.42 
 
 
422 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3622  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.63 
 
 
445 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2660  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.38 
 
 
448 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.32 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0367243  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2151  lysine/ornithine N-monooxygenase  36.34 
 
 
431 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.115188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3060  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.08 
 
 
439 aa  239  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2961  L-lysine 6-monooxygenase, putative  33.93 
 
 
440 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.480954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3655  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  34.92 
 
 
446 aa  229  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2746  L-lysine 6-monooxygenase, putative  33.11 
 
 
439 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0296167  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1425  L-ornithine 5-monooxygenase oxidoreductase protein  34.54 
 
 
445 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.901724  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4206  L-ornithine 5-monooxygenase oxidoreductase protein  31.96 
 
 
451 aa  211  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2362  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  32.55 
 
 
421 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.528948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4362  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  33.41 
 
 
451 aa  203  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141166  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1946  hypothetical protein  32.95 
 
 
445 aa  189  8e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0211  L-lysine 6-monooxygenase  31.63 
 
 
427 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606934  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1073  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.56 
 
 
502 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118854  normal  0.903474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6165  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  30.11 
 
 
434 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573981 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0197  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.87 
 
 
456 aa  170  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0156088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0659  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.68 
 
 
471 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0280  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.84 
 
 
441 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0408  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.45 
 
 
431 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.31 
 
 
505 aa  163  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3333  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.17 
 
 
449 aa  163  7e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2835  monooxygenase  29.41 
 
 
427 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6320  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.94 
 
 
446 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0217  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.31 
 
 
502 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.39 
 
 
428 aa  161  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.52 
 
 
444 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.26 
 
 
425 aa  156  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.730683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2739  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.5 
 
 
428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  30.41 
 
 
438 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.96 
 
 
435 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4219  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.7 
 
 
457 aa  152  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0592  lysine/ornithine N-monooxygenase  28.5 
 
 
447 aa  150  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301691  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3030  siderophore biosynthesis protein  30.1 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1046  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.93 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3460  L-lysine 6-monooxygenase  29.18 
 
 
434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3275  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.58 
 
 
430 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4294  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.14 
 
 
432 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093868  hitchhiker  0.0000660921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0919  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.04 
 
 
442 aa  147  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.245016  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0286  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.3 
 
 
455 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1811  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.17 
 
 
426 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0571  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.05 
 
 
434 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3091  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.14 
 
 
454 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.169338  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1510  siderophore biosynthesis protein  30.3 
 
 
496 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1054  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.27 
 
 
463 aa  143  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1454  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.3 
 
 
496 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.05 
 
 
495 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1802  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.03 
 
 
496 aa  140  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000066726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.73 
 
 
442 aa  140  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.05 
 
 
445 aa  139  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0513  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30 
 
 
458 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2708  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.12 
 
 
501 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2730  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.78 
 
 
501 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.100586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  29.29 
 
 
425 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.12 
 
 
501 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.242413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1656  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.78 
 
 
501 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130755 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1817  putative siderophore biosynthesis oxidoreductase protein  26.44 
 
 
462 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>