123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2120 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3796  L-ornithine N5-oxygenase  93.92 
 
 
444 aa  861    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902122  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1973  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  94.37 
 
 
444 aa  867    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0295223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2120  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  100 
 
 
444 aa  914    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0401511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2095  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  91.22 
 
 
444 aa  840    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2874  L-ornithine N5-oxygenase  65.9 
 
 
443 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33810  L-ornithine N5-oxygenase  65.65 
 
 
443 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000120742  normal  0.0105626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1859  L-ornithine N5-oxygenase  64.29 
 
 
445 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.886808  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25600  L-ornithine N5-oxygenase-PvdA-like protein  63.07 
 
 
453 aa  576  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  52.39 
 
 
432 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3740  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50.47 
 
 
439 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  51.68 
 
 
438 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3723  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50.96 
 
 
452 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1825  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50 
 
 
435 aa  422  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  49.52 
 
 
458 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  50.91 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  50.91 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1618  lysine/ornithine N-monooxygenase  50.68 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00185713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4789  lysine/ornithine N-monooxygenase  50.11 
 
 
458 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00013329  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1540  lysine/ornithine N-monooxygenase  50.57 
 
 
458 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.310035  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  51.05 
 
 
454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1561  lysine/ornithine N-monooxygenase  50.11 
 
 
458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000104933  normal  0.191057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4074  L-ornithine 5-monooxygenase  49.08 
 
 
456 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0146729  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0527  l-ornithine 5-monooxygenase  48.28 
 
 
456 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  47.06 
 
 
443 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4036  lysine/ornithine N-monooxygenase  49.77 
 
 
462 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1179  l-ornithine 5-monooxygenase  47.34 
 
 
468 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0820477  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2090  l-ornithine 5-monooxygenase  47.11 
 
 
495 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869348  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2416  l-ornithine 5-monooxygenase  45.81 
 
 
504 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0539899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1623  l-ornithine 5-monooxygenase  47.34 
 
 
468 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0286  l-ornithine 5-monooxygenase  47.34 
 
 
517 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0287172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  47.11 
 
 
468 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1944  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  47.11 
 
 
468 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0875  l-ornithine 5-monooxygenase  47.34 
 
 
468 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1345  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  44.52 
 
 
446 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865314  normal  0.202415 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05823  Ornithine monooxygenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8P5]  39.25 
 
 
498 aa  319  5e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5066  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.18 
 
 
442 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1869  putative peptide monooxygenase  39.72 
 
 
438 aa  295  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3463  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.53 
 
 
444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23385  hitchhiker  0.00214354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2654  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.47 
 
 
445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000731675  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5949  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.91 
 
 
463 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  38.22 
 
 
455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3691  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.2 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4488  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.47 
 
 
422 aa  272  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3060  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.24 
 
 
439 aa  262  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2660  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.68 
 
 
448 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3622  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.35 
 
 
445 aa  256  7e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4206  L-ornithine 5-monooxygenase oxidoreductase protein  35.01 
 
 
451 aa  250  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2151  lysine/ornithine N-monooxygenase  37.47 
 
 
431 aa  245  9e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.115188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.33 
 
 
444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0367243  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3655  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  34.84 
 
 
446 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1425  L-ornithine 5-monooxygenase oxidoreductase protein  35.96 
 
 
445 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.901724  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2746  L-lysine 6-monooxygenase, putative  31.38 
 
 
439 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0296167  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2961  L-lysine 6-monooxygenase, putative  30.65 
 
 
440 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.480954  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2362  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  30.93 
 
 
421 aa  192  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.528948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4362  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  32.72 
 
 
451 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141166  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6165  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  32.26 
 
 
434 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0659  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.21 
 
 
471 aa  186  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2835  monooxygenase  32.08 
 
 
427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0408  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.81 
 
 
431 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1073  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.9 
 
 
502 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118854  normal  0.903474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0280  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.36 
 
 
441 aa  176  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0211  L-lysine 6-monooxygenase  32.34 
 
 
427 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606934  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1946  hypothetical protein  30.14 
 
 
445 aa  172  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3030  siderophore biosynthesis protein  28.57 
 
 
498 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1454  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.74 
 
 
496 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1510  siderophore biosynthesis protein  28.97 
 
 
496 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4219  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.63 
 
 
457 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.81 
 
 
505 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.25 
 
 
495 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.67 
 
 
428 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2739  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.59 
 
 
428 aa  163  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1054  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.52 
 
 
463 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0197  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.26 
 
 
456 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0156088 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2411  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.21 
 
 
505 aa  159  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6320  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.66 
 
 
446 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3333  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.37 
 
 
449 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0217  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.52 
 
 
502 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0919  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.6 
 
 
442 aa  156  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.245016  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2708  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.83 
 
 
501 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2730  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.83 
 
 
501 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.100586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0571  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.36 
 
 
434 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1656  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.83 
 
 
501 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130755 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.61 
 
 
501 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.242413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3460  L-lysine 6-monooxygenase  29.41 
 
 
434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.73 
 
 
442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  28.76 
 
 
438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0286  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.23 
 
 
455 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.28 
 
 
425 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.730683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1811  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.48 
 
 
426 aa  150  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0135  siderophore biosynthetis protein  27.31 
 
 
442 aa  150  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4294  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.66 
 
 
432 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093868  hitchhiker  0.0000660921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.89 
 
 
444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0592  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.93 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301691  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.54 
 
 
435 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2447  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  27.87 
 
 
432 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3189  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  27.87 
 
 
432 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.603333  normal  0.0134512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2546  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.87 
 
 
432 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  28.9 
 
 
425 aa  147  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1046  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.22 
 
 
437 aa  146  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1802  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.48 
 
 
496 aa  146  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000066726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>