118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0408 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0408  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  100 
 
 
431 aa  882    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2835  monooxygenase  58.02 
 
 
427 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3333  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  54.95 
 
 
449 aa  460  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0217  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  53.79 
 
 
502 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0659  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  53.7 
 
 
471 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4219  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50.71 
 
 
457 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  52.05 
 
 
505 aa  420  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1073  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  49.12 
 
 
502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118854  normal  0.903474 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0286  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  47.95 
 
 
455 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  47.75 
 
 
428 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2840  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  45.39 
 
 
442 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000828048  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0513  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  48.62 
 
 
458 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2447  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  43.82 
 
 
432 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3460  L-lysine 6-monooxygenase  47.54 
 
 
434 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2739  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  47.52 
 
 
428 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3189  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  43.82 
 
 
432 aa  391  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.603333  normal  0.0134512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2546  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.82 
 
 
432 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0592  lysine/ornithine N-monooxygenase  45.31 
 
 
447 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301691  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1054  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  46.68 
 
 
463 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4294  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  47.09 
 
 
432 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093868  hitchhiker  0.0000660921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0197  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50.47 
 
 
456 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0156088 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1454  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.59 
 
 
496 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.59 
 
 
495 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1510  siderophore biosynthesis protein  43.46 
 
 
496 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02102  hypothetical protein  44.68 
 
 
468 aa  368  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1817  putative siderophore biosynthesis oxidoreductase protein  47.95 
 
 
462 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3030  siderophore biosynthesis protein  42.69 
 
 
498 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0135  siderophore biosynthetis protein  44.58 
 
 
442 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1630  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.15 
 
 
445 aa  365  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1656  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  44.16 
 
 
501 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130755 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2708  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.93 
 
 
501 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2411  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  42.99 
 
 
505 aa  362  8e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2730  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.69 
 
 
501 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.100586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.69 
 
 
501 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.242413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3173  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.97 
 
 
440 aa  356  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1810  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  48.17 
 
 
442 aa  352  8.999999999999999e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633774 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1802  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.39 
 
 
496 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000066726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.25 
 
 
442 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  35.42 
 
 
437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.28 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0571  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.33 
 
 
434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  37.56 
 
 
438 aa  249  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1946  hypothetical protein  31.43 
 
 
445 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0919  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.45 
 
 
442 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.245016  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0280  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.32 
 
 
441 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.92 
 
 
437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3318  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.95 
 
 
441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00871217 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.49 
 
 
445 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0211  L-lysine 6-monooxygenase  37.29 
 
 
427 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606934  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  34.05 
 
 
425 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1811  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.34 
 
 
426 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0711  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucD  31.89 
 
 
442 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0783  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.89 
 
 
442 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3091  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.99 
 
 
454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.169338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.31 
 
 
425 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.730683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.57 
 
 
444 aa  224  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1046  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.12 
 
 
437 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.14 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0586  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.83 
 
 
444 aa  212  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3275  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.01 
 
 
430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  33.57 
 
 
443 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  33.97 
 
 
438 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4074  L-ornithine 5-monooxygenase  33.8 
 
 
456 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0146729  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4789  lysine/ornithine N-monooxygenase  35.61 
 
 
458 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00013329  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  34.17 
 
 
458 aa  186  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1825  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.16 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1540  lysine/ornithine N-monooxygenase  34.82 
 
 
458 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.310035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6320  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.9 
 
 
446 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4036  lysine/ornithine N-monooxygenase  34.41 
 
 
462 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2095  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  31.81 
 
 
444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3723  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.1 
 
 
452 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1618  lysine/ornithine N-monooxygenase  33.33 
 
 
458 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00185713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1561  lysine/ornithine N-monooxygenase  33.56 
 
 
458 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000104933  normal  0.191057 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1179  l-ornithine 5-monooxygenase  34.72 
 
 
468 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0820477  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2090  l-ornithine 5-monooxygenase  34.49 
 
 
495 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  34.49 
 
 
468 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2120  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  31.81 
 
 
444 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0401511 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  33.96 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  33.96 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1623  l-ornithine 5-monooxygenase  34.72 
 
 
468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0286  l-ornithine 5-monooxygenase  34.72 
 
 
517 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0287172  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1944  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  34.49 
 
 
468 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0875  l-ornithine 5-monooxygenase  34.72 
 
 
468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2654  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.65 
 
 
445 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000731675  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  34.43 
 
 
454 aa  179  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2416  l-ornithine 5-monooxygenase  33.94 
 
 
504 aa  179  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0539899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1859  L-ornithine N5-oxygenase  31.12 
 
 
445 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.886808  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1973  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  32.48 
 
 
444 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0295223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0527  l-ornithine 5-monooxygenase  33.8 
 
 
456 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3796  L-ornithine N5-oxygenase  32.48 
 
 
444 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902122  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3740  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.42 
 
 
439 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2874  L-ornithine N5-oxygenase  29.93 
 
 
443 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  31.16 
 
 
455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.02 
 
 
432 aa  167  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3622  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.25 
 
 
445 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25600  L-ornithine N5-oxygenase-PvdA-like protein  30.02 
 
 
453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2660  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.81 
 
 
448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33810  L-ornithine N5-oxygenase  29.45 
 
 
443 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000120742  normal  0.0105626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1345  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  32.02 
 
 
446 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865314  normal  0.202415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1869  putative peptide monooxygenase  30.37 
 
 
438 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>