161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0278 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  100 
 
 
437 aa  911    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  49.77 
 
 
445 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  49.06 
 
 
425 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  51.27 
 
 
437 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0919  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  49.29 
 
 
442 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.245016  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  47.89 
 
 
444 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0783  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  47.64 
 
 
442 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0711  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucD  47.64 
 
 
442 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  47.64 
 
 
425 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.730683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0586  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  46.06 
 
 
444 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1811  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  42.68 
 
 
426 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3318  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  42.18 
 
 
441 aa  361  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00871217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  42.86 
 
 
442 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.67 
 
 
435 aa  348  8e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  40.14 
 
 
438 aa  341  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1946  hypothetical protein  38.04 
 
 
445 aa  325  8.000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.76 
 
 
452 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0211  L-lysine 6-monooxygenase  40.43 
 
 
427 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606934  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0280  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.98 
 
 
441 aa  306  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2835  monooxygenase  36.87 
 
 
427 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0571  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.25 
 
 
434 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1046  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.71 
 
 
437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0408  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.42 
 
 
431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3275  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.23 
 
 
430 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6320  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.56 
 
 
446 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0659  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.29 
 
 
471 aa  262  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4219  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.78 
 
 
457 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3091  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.56 
 
 
454 aa  249  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.169338  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3333  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.88 
 
 
449 aa  246  6.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.33 
 
 
505 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.6 
 
 
495 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1454  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.36 
 
 
496 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2411  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.28 
 
 
505 aa  227  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1510  siderophore biosynthesis protein  31.53 
 
 
496 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0217  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.84 
 
 
502 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3030  siderophore biosynthesis protein  31.36 
 
 
498 aa  222  9e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0135  siderophore biosynthetis protein  31.13 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2708  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.54 
 
 
501 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02102  hypothetical protein  30.23 
 
 
468 aa  220  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3173  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.23 
 
 
440 aa  219  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.54 
 
 
501 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.242413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0286  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.46 
 
 
455 aa  219  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1817  putative siderophore biosynthesis oxidoreductase protein  33.96 
 
 
462 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1656  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.2 
 
 
501 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130755 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2730  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.3 
 
 
501 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.100586  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0592  lysine/ornithine N-monooxygenase  30.09 
 
 
447 aa  216  9e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301691  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0513  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.3 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2546  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.83 
 
 
432 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2447  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  29.59 
 
 
432 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3189  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  29.59 
 
 
432 aa  209  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.603333  normal  0.0134512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4294  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30 
 
 
432 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093868  hitchhiker  0.0000660921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3460  L-lysine 6-monooxygenase  30.46 
 
 
434 aa  202  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2739  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.34 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1054  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.68 
 
 
463 aa  201  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.3 
 
 
428 aa  199  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1630  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.88 
 
 
445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2840  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.83 
 
 
442 aa  194  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000828048  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1073  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.02 
 
 
502 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118854  normal  0.903474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1810  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.07 
 
 
442 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0197  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.37 
 
 
456 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0156088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1802  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  25 
 
 
496 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000066726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  32.01 
 
 
443 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3723  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.05 
 
 
452 aa  163  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3691  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.34 
 
 
432 aa  163  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4206  L-ornithine 5-monooxygenase oxidoreductase protein  28.11 
 
 
451 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1561  lysine/ornithine N-monooxygenase  28.64 
 
 
458 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000104933  normal  0.191057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  28.64 
 
 
458 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  28.64 
 
 
458 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1618  lysine/ornithine N-monooxygenase  28.57 
 
 
458 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00185713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  27.96 
 
 
438 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4789  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.11 
 
 
458 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00013329  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1825  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.33 
 
 
435 aa  156  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3740  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.27 
 
 
439 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.45 
 
 
455 aa  156  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1540  lysine/ornithine N-monooxygenase  28.64 
 
 
458 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.310035  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4074  L-ornithine 5-monooxygenase  29.13 
 
 
456 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0146729  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  28.47 
 
 
454 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2746  L-lysine 6-monooxygenase, putative  27.53 
 
 
439 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0296167  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.87 
 
 
444 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0367243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5066  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.5 
 
 
442 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2961  L-lysine 6-monooxygenase, putative  27.92 
 
 
440 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.480954  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2654  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.2 
 
 
445 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000731675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4488  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.19 
 
 
422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2660  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.19 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2090  l-ornithine 5-monooxygenase  27.64 
 
 
495 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  29.76 
 
 
458 aa  146  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1179  l-ornithine 5-monooxygenase  28.21 
 
 
468 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0820477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1623  l-ornithine 5-monooxygenase  28.21 
 
 
468 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  28.21 
 
 
468 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0875  l-ornithine 5-monooxygenase  28.21 
 
 
468 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635923  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3060  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.3 
 
 
439 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1944  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  28.21 
 
 
468 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0286  l-ornithine 5-monooxygenase  27.64 
 
 
517 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0287172  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2416  l-ornithine 5-monooxygenase  28.13 
 
 
504 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0539899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0527  l-ornithine 5-monooxygenase  27.03 
 
 
456 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.36 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1345  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  27.42 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865314  normal  0.202415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1869  putative peptide monooxygenase  27.42 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2120  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  26.37 
 
 
444 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0401511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2362  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  27.08 
 
 
421 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.528948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>