124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4057 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  100 
 
 
505 aa  1010    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0659  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  69.77 
 
 
471 aa  637    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0408  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  52.05 
 
 
431 aa  420  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2835  monooxygenase  44.62 
 
 
427 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0217  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  46.84 
 
 
502 aa  388  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3333  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  47.95 
 
 
449 aa  374  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1810  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  48.67 
 
 
442 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1073  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  45.87 
 
 
502 aa  360  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118854  normal  0.903474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4219  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.2 
 
 
457 aa  360  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1817  putative siderophore biosynthesis oxidoreductase protein  46.71 
 
 
462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0286  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.92 
 
 
455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1630  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.73 
 
 
445 aa  349  5e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02102  hypothetical protein  42.44 
 
 
468 aa  348  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0592  lysine/ornithine N-monooxygenase  41.38 
 
 
447 aa  347  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301691  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0135  siderophore biosynthetis protein  38.27 
 
 
442 aa  346  5e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1510  siderophore biosynthesis protein  41 
 
 
496 aa  346  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1054  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.64 
 
 
463 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1454  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.04 
 
 
496 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2411  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.26 
 
 
505 aa  345  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.14 
 
 
495 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3030  siderophore biosynthesis protein  39.68 
 
 
498 aa  343  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1656  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39 
 
 
501 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130755 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2708  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.78 
 
 
501 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.78 
 
 
501 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.242413 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0513  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  42.7 
 
 
458 aa  339  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2730  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.34 
 
 
501 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.100586  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3460  L-lysine 6-monooxygenase  41.91 
 
 
434 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0197  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  48.19 
 
 
456 aa  331  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0156088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1802  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  42.73 
 
 
496 aa  329  6e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000066726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4294  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.5 
 
 
432 aa  323  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093868  hitchhiker  0.0000660921 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2447  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  37.05 
 
 
432 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3189  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  37.05 
 
 
432 aa  320  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.603333  normal  0.0134512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2546  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.05 
 
 
432 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2739  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  42.6 
 
 
428 aa  318  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.69 
 
 
428 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3173  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.55 
 
 
440 aa  303  7.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2840  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.95 
 
 
442 aa  299  8e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000828048  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.72 
 
 
437 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.78 
 
 
445 aa  260  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  34.71 
 
 
425 aa  260  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0711  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucD  34.35 
 
 
442 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0783  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.35 
 
 
442 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  36.26 
 
 
438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0919  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.73 
 
 
442 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.245016  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34 
 
 
444 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.18 
 
 
425 aa  246  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.730683 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.97 
 
 
435 aa  246  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.17 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  33.33 
 
 
437 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0586  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.66 
 
 
444 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3318  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.02 
 
 
441 aa  232  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00871217 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0280  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.54 
 
 
441 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1946  hypothetical protein  31.87 
 
 
445 aa  231  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0211  L-lysine 6-monooxygenase  34.94 
 
 
427 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0571  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.25 
 
 
434 aa  209  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1811  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.65 
 
 
426 aa  206  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3091  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.88 
 
 
454 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.169338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6320  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.87 
 
 
446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.56 
 
 
452 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1046  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.39 
 
 
437 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4074  L-ornithine 5-monooxygenase  35.33 
 
 
456 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0146729  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4036  lysine/ornithine N-monooxygenase  35.01 
 
 
462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3275  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.59 
 
 
430 aa  190  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2416  l-ornithine 5-monooxygenase  34.08 
 
 
504 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0539899  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  35.16 
 
 
454 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2654  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.92 
 
 
445 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000731675  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0286  l-ornithine 5-monooxygenase  34.36 
 
 
517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0287172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  33.8 
 
 
443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1179  l-ornithine 5-monooxygenase  34.36 
 
 
468 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0820477  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2090  l-ornithine 5-monooxygenase  34.07 
 
 
495 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1623  l-ornithine 5-monooxygenase  34.36 
 
 
468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0875  l-ornithine 5-monooxygenase  34.36 
 
 
468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1944  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  34.14 
 
 
468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  34.07 
 
 
468 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0527  l-ornithine 5-monooxygenase  34.27 
 
 
456 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4789  lysine/ornithine N-monooxygenase  34.09 
 
 
458 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00013329  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2660  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.41 
 
 
448 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  34.54 
 
 
458 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  34.54 
 
 
458 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1618  lysine/ornithine N-monooxygenase  34.31 
 
 
458 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00185713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1561  lysine/ornithine N-monooxygenase  34.09 
 
 
458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000104933  normal  0.191057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2095  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  33.49 
 
 
444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1859  L-ornithine N5-oxygenase  33.1 
 
 
445 aa  173  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.886808  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1540  lysine/ornithine N-monooxygenase  33.86 
 
 
458 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.310035  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  32.24 
 
 
438 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3740  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.9 
 
 
439 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2874  L-ornithine N5-oxygenase  31.6 
 
 
443 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2120  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  31.81 
 
 
444 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0401511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5066  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.37 
 
 
442 aa  166  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.32 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  33.64 
 
 
458 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33810  L-ornithine N5-oxygenase  31.31 
 
 
443 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000120742  normal  0.0105626 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3723  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.15 
 
 
452 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3796  L-ornithine N5-oxygenase  31.7 
 
 
444 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902122  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1973  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  32.26 
 
 
444 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0295223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25600  L-ornithine N5-oxygenase-PvdA-like protein  30.72 
 
 
453 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3622  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.49 
 
 
445 aa  161  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1825  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.54 
 
 
435 aa  160  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5949  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.48 
 
 
463 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  31.64 
 
 
455 aa  159  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>