119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2411 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3030  siderophore biosynthesis protein  71.01 
 
 
498 aa  748    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1454  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  73.62 
 
 
496 aa  783    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  73.72 
 
 
495 aa  785    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1510  siderophore biosynthesis protein  73.91 
 
 
496 aa  781    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2708  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  88.91 
 
 
501 aa  946    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2411  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  100 
 
 
505 aa  1059    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2730  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  87.72 
 
 
501 aa  934    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.100586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  88.71 
 
 
501 aa  945    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.242413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1656  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  88.12 
 
 
501 aa  939    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130755 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0135  siderophore biosynthetis protein  56.84 
 
 
442 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2447  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  53.88 
 
 
432 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3189  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  53.88 
 
 
432 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.603333  normal  0.0134512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2546  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  53.88 
 
 
432 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0286  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  54.55 
 
 
455 aa  478  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0513  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  51.47 
 
 
458 aa  458  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1073  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  49.55 
 
 
502 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118854  normal  0.903474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1054  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  51.16 
 
 
463 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  51.41 
 
 
428 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3460  L-lysine 6-monooxygenase  50.83 
 
 
434 aa  451  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4294  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50.47 
 
 
432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093868  hitchhiker  0.0000660921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2739  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50.48 
 
 
428 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2840  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  49.88 
 
 
442 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000828048  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0592  lysine/ornithine N-monooxygenase  46.51 
 
 
447 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301691  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3173  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  46.67 
 
 
440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2835  monooxygenase  44.96 
 
 
427 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0197  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  44.24 
 
 
456 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0156088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1802  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.09 
 
 
496 aa  363  4e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000066726  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0408  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  42.99 
 
 
431 aa  362  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4219  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  42.11 
 
 
457 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3333  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.44 
 
 
449 aa  356  5.999999999999999e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0217  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.47 
 
 
502 aa  351  2e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0659  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.53 
 
 
471 aa  349  5e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.26 
 
 
505 aa  345  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1817  putative siderophore biosynthesis oxidoreductase protein  43.52 
 
 
462 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02102  hypothetical protein  38.36 
 
 
468 aa  310  4e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1810  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.75 
 
 
442 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633774 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1630  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.57 
 
 
445 aa  283  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.37 
 
 
437 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.41 
 
 
435 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.92 
 
 
425 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.730683 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0280  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.58 
 
 
441 aa  228  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  31.28 
 
 
437 aa  227  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0211  L-lysine 6-monooxygenase  32.94 
 
 
427 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606934  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0711  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucD  31.54 
 
 
442 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0783  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.54 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0586  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31 
 
 
444 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.07 
 
 
442 aa  220  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.88 
 
 
445 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  30.99 
 
 
438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0919  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.9 
 
 
442 aa  216  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.245016  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  30.64 
 
 
425 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3318  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30 
 
 
441 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00871217 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1946  hypothetical protein  28.82 
 
 
445 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0571  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.98 
 
 
434 aa  209  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.66 
 
 
444 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1811  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.64 
 
 
426 aa  200  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.74 
 
 
452 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3091  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.27 
 
 
454 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.169338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5066  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30 
 
 
442 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1046  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.05 
 
 
437 aa  177  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  27.79 
 
 
443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2654  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.31 
 
 
445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000731675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  28 
 
 
438 aa  170  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3622  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.19 
 
 
445 aa  170  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3723  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.89 
 
 
452 aa  166  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.33 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4036  lysine/ornithine N-monooxygenase  30.07 
 
 
462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  29 
 
 
454 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4074  L-ornithine 5-monooxygenase  28.54 
 
 
456 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0146729  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3740  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.73 
 
 
439 aa  163  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2660  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.54 
 
 
448 aa  163  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  28.1 
 
 
458 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4789  lysine/ornithine N-monooxygenase  28.57 
 
 
458 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00013329  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3275  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.07 
 
 
430 aa  161  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3796  L-ornithine N5-oxygenase  29.27 
 
 
444 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902122  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  28.8 
 
 
458 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  28.8 
 
 
458 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1973  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  29.04 
 
 
444 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0295223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2120  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  29.21 
 
 
444 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0401511 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1825  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.17 
 
 
435 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5949  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.29 
 
 
463 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1618  lysine/ornithine N-monooxygenase  28.57 
 
 
458 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00185713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1561  lysine/ornithine N-monooxygenase  28.47 
 
 
458 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000104933  normal  0.191057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1345  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  29.34 
 
 
446 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865314  normal  0.202415 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1540  lysine/ornithine N-monooxygenase  28.25 
 
 
458 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.310035  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05823  Ornithine monooxygenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8P5]  27.29 
 
 
498 aa  156  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0527  l-ornithine 5-monooxygenase  27.97 
 
 
456 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6320  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.74 
 
 
446 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.85 
 
 
455 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2095  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  28.27 
 
 
444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2090  l-ornithine 5-monooxygenase  27.51 
 
 
495 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0286  l-ornithine 5-monooxygenase  27.57 
 
 
517 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0287172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  28.1 
 
 
468 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3060  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.34 
 
 
439 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1944  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  27.56 
 
 
468 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1623  l-ornithine 5-monooxygenase  27.56 
 
 
468 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0875  l-ornithine 5-monooxygenase  27.56 
 
 
468 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635923  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1179  l-ornithine 5-monooxygenase  28.17 
 
 
468 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0820477  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3691  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.19 
 
 
432 aa  146  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2416  l-ornithine 5-monooxygenase  27.31 
 
 
504 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0539899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>