118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0659 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  69.77 
 
 
505 aa  637    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0659  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  100 
 
 
471 aa  936    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0408  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  53.7 
 
 
431 aa  432  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2835  monooxygenase  46.65 
 
 
427 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0217  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  47.21 
 
 
502 aa  392  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3333  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  50.23 
 
 
449 aa  389  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0286  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  45.56 
 
 
455 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4219  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  46.4 
 
 
457 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0513  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  44.86 
 
 
458 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1810  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  49.66 
 
 
442 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633774 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1817  putative siderophore biosynthesis oxidoreductase protein  47.56 
 
 
462 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02102  hypothetical protein  43.42 
 
 
468 aa  363  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1073  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  44.33 
 
 
502 aa  362  8e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118854  normal  0.903474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1630  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.42 
 
 
445 aa  361  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1054  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.59 
 
 
463 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1454  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.43 
 
 
496 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0135  siderophore biosynthetis protein  39.86 
 
 
442 aa  353  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3030  siderophore biosynthesis protein  40.65 
 
 
498 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1510  siderophore biosynthesis protein  39.51 
 
 
496 aa  353  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2708  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.09 
 
 
501 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.85 
 
 
495 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.09 
 
 
501 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.242413 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2730  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.09 
 
 
501 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.100586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1656  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.09 
 
 
501 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130755 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2411  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.53 
 
 
505 aa  349  5e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0592  lysine/ornithine N-monooxygenase  39.55 
 
 
447 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301691  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4294  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.06 
 
 
432 aa  336  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093868  hitchhiker  0.0000660921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3460  L-lysine 6-monooxygenase  41.16 
 
 
434 aa  334  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0197  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  47.56 
 
 
456 aa  325  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0156088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  42.33 
 
 
428 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3173  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.7 
 
 
440 aa  324  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2739  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  42.3 
 
 
428 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2840  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38 
 
 
442 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000828048  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2447  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  35.96 
 
 
432 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3189  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  35.96 
 
 
432 aa  317  4e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.603333  normal  0.0134512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2546  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.96 
 
 
432 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1802  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.35 
 
 
496 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000066726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.84 
 
 
437 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  34.29 
 
 
437 aa  262  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.73 
 
 
442 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0919  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.56 
 
 
442 aa  252  9.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.245016  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0783  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.03 
 
 
442 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0280  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.19 
 
 
441 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0711  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucD  33.03 
 
 
442 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.94 
 
 
445 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.11 
 
 
435 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.01 
 
 
425 aa  244  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.730683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0586  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.26 
 
 
444 aa  242  9e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  33.57 
 
 
425 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.73 
 
 
444 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  34.26 
 
 
438 aa  236  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1946  hypothetical protein  29.12 
 
 
445 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3318  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.21 
 
 
441 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00871217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0211  L-lysine 6-monooxygenase  34.57 
 
 
427 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606934  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1811  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.87 
 
 
426 aa  226  9e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.25 
 
 
452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1046  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.83 
 
 
437 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3091  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.78 
 
 
454 aa  209  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.169338  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0571  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.65 
 
 
434 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6320  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.32 
 
 
446 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4074  L-ornithine 5-monooxygenase  36.92 
 
 
456 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0146729  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2654  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.64 
 
 
445 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000731675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  35.15 
 
 
443 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  38.05 
 
 
454 aa  194  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  37.25 
 
 
458 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  37.25 
 
 
458 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2416  l-ornithine 5-monooxygenase  35.92 
 
 
504 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0539899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4789  lysine/ornithine N-monooxygenase  37.35 
 
 
458 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00013329  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1618  lysine/ornithine N-monooxygenase  36.59 
 
 
458 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00185713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3275  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32 
 
 
430 aa  190  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2095  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  34.78 
 
 
444 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  34.37 
 
 
438 aa  189  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1561  lysine/ornithine N-monooxygenase  36.71 
 
 
458 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000104933  normal  0.191057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3723  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.33 
 
 
452 aa  187  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1540  lysine/ornithine N-monooxygenase  36.59 
 
 
458 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.310035  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4036  lysine/ornithine N-monooxygenase  35.94 
 
 
462 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2120  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  35.21 
 
 
444 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0401511 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1179  l-ornithine 5-monooxygenase  36.7 
 
 
468 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0820477  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0527  l-ornithine 5-monooxygenase  35.01 
 
 
456 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0286  l-ornithine 5-monooxygenase  36.59 
 
 
517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0287172  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1623  l-ornithine 5-monooxygenase  36.7 
 
 
468 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0875  l-ornithine 5-monooxygenase  36.7 
 
 
468 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1944  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  36.47 
 
 
468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  34.89 
 
 
458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2090  l-ornithine 5-monooxygenase  36.07 
 
 
495 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  36.18 
 
 
468 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  34.35 
 
 
455 aa  179  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1825  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.13 
 
 
435 aa  179  9e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3740  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.64 
 
 
439 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1973  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  32.7 
 
 
444 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0295223 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3796  L-ornithine N5-oxygenase  33.25 
 
 
444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902122  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1859  L-ornithine N5-oxygenase  33.73 
 
 
445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.886808  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5066  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.71 
 
 
442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2874  L-ornithine N5-oxygenase  32.66 
 
 
443 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4488  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.25 
 
 
422 aa  170  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33810  L-ornithine N5-oxygenase  31.68 
 
 
443 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000120742  normal  0.0105626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.79 
 
 
432 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25600  L-ornithine N5-oxygenase-PvdA-like protein  30.37 
 
 
453 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2660  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.61 
 
 
448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3691  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.8 
 
 
432 aa  159  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>