127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0919 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0711  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucD  87.44 
 
 
442 aa  808    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0919  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  100 
 
 
442 aa  927    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.245016  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  75.29 
 
 
425 aa  689    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.730683 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0783  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  87.21 
 
 
442 aa  806    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  61.36 
 
 
445 aa  590  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  61.59 
 
 
444 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  61.94 
 
 
425 aa  580  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  52.69 
 
 
437 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  49.29 
 
 
437 aa  448  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0586  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.78 
 
 
444 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.55 
 
 
442 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3318  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.94 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00871217 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  43.13 
 
 
438 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.9 
 
 
435 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1811  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.08 
 
 
426 aa  326  5e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1946  hypothetical protein  37.74 
 
 
445 aa  326  6e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.76 
 
 
452 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0280  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.82 
 
 
441 aa  299  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0571  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.88 
 
 
434 aa  288  9e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0211  L-lysine 6-monooxygenase  36.34 
 
 
427 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1046  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.56 
 
 
437 aa  278  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3275  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  37.82 
 
 
430 aa  277  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6320  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.08 
 
 
446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.73 
 
 
505 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0659  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.56 
 
 
471 aa  252  8.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2835  monooxygenase  31.55 
 
 
427 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0217  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.34 
 
 
502 aa  249  8e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4219  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.1 
 
 
457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0408  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.45 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1073  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.72 
 
 
502 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118854  normal  0.903474 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0135  siderophore biosynthetis protein  30.3 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3091  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.83 
 
 
454 aa  239  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.169338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4294  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.62 
 
 
432 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093868  hitchhiker  0.0000660921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3460  L-lysine 6-monooxygenase  31.12 
 
 
434 aa  235  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1817  putative siderophore biosynthesis oxidoreductase protein  34.01 
 
 
462 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.87 
 
 
428 aa  229  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0286  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.43 
 
 
455 aa  229  7e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2739  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.56 
 
 
428 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0513  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.81 
 
 
458 aa  226  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0592  lysine/ornithine N-monooxygenase  31.74 
 
 
447 aa  225  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301691  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.04 
 
 
495 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3030  siderophore biosynthesis protein  31.46 
 
 
498 aa  219  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1510  siderophore biosynthesis protein  29.69 
 
 
496 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2411  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.9 
 
 
505 aa  216  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1454  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.82 
 
 
496 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1656  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.07 
 
 
501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130755 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3333  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.9 
 
 
449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2708  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.83 
 
 
501 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2730  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.25 
 
 
501 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.100586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.83 
 
 
501 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.242413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3173  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.04 
 
 
440 aa  206  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1054  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.28 
 
 
463 aa  206  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2840  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.18 
 
 
442 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000828048  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1630  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.84 
 
 
445 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02102  hypothetical protein  28.54 
 
 
468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1810  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.24 
 
 
442 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2447  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  26.74 
 
 
432 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3189  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  26.74 
 
 
432 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.603333  normal  0.0134512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2546  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.74 
 
 
432 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5066  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.86 
 
 
442 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1802  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.1 
 
 
496 aa  188  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000066726  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0197  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.05 
 
 
456 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0156088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2654  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.31 
 
 
445 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000731675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  30.35 
 
 
438 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3463  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.47 
 
 
444 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23385  hitchhiker  0.00214354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5949  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.61 
 
 
463 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4789  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.86 
 
 
458 aa  166  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00013329  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1540  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.38 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.310035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.41 
 
 
458 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.41 
 
 
458 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  30.37 
 
 
443 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.62 
 
 
454 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3723  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.26 
 
 
452 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1973  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  30.8 
 
 
444 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0295223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1345  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  31 
 
 
446 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865314  normal  0.202415 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1618  lysine/ornithine N-monooxygenase  28.94 
 
 
458 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00185713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3740  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.85 
 
 
439 aa  160  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1561  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.15 
 
 
458 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000104933  normal  0.191057 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05823  Ornithine monooxygenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z8P5]  28.2 
 
 
498 aa  159  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4488  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.38 
 
 
422 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3796  L-ornithine N5-oxygenase  29.84 
 
 
444 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902122  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2874  L-ornithine N5-oxygenase  28.38 
 
 
443 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2120  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  29.6 
 
 
444 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0401511 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2090  l-ornithine 5-monooxygenase  28.83 
 
 
495 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  28.83 
 
 
468 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1944  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  28.83 
 
 
468 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2095  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  30.68 
 
 
444 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1179  l-ornithine 5-monooxygenase  28.83 
 
 
468 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0820477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1623  l-ornithine 5-monooxygenase  28.83 
 
 
468 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0286  l-ornithine 5-monooxygenase  28.83 
 
 
517 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0287172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0875  l-ornithine 5-monooxygenase  28.83 
 
 
468 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635923  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3060  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.65 
 
 
439 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2660  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.05 
 
 
448 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0527  l-ornithine 5-monooxygenase  29.21 
 
 
456 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4074  L-ornithine 5-monooxygenase  28.74 
 
 
456 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0146729  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1869  putative peptide monooxygenase  28.31 
 
 
438 aa  150  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4036  lysine/ornithine N-monooxygenase  30.21 
 
 
462 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25600  L-ornithine N5-oxygenase-PvdA-like protein  27.44 
 
 
453 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2416  l-ornithine 5-monooxygenase  27.69 
 
 
504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0539899  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  28.74 
 
 
455 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>