299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7004 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  100 
 
 
417 aa  860    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  67.88 
 
 
423 aa  573  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  66.01 
 
 
450 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  66.5 
 
 
450 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  64.95 
 
 
459 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  65.69 
 
 
435 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  63.68 
 
 
449 aa  541  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  66.18 
 
 
446 aa  537  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  66.67 
 
 
470 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  63.64 
 
 
439 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  62.26 
 
 
419 aa  534  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  62.65 
 
 
439 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  65.94 
 
 
448 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  62.32 
 
 
439 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  61.89 
 
 
419 aa  528  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  63.07 
 
 
448 aa  531  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  62.32 
 
 
439 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  65.46 
 
 
440 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1664  FAD dependent oxidoreductase  63.35 
 
 
425 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.896547  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  64.98 
 
 
441 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3466  hypothetical protein  65.46 
 
 
449 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0375  flavin-containing monooxygenase FMO  60.83 
 
 
436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3030  hypothetical protein  61.35 
 
 
427 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101073  normal  0.976263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3222  potassium transport flavoprotein  59.61 
 
 
416 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.67 
 
 
422 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 
445 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.37 
 
 
422 aa  272  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  39.07 
 
 
422 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.27 
 
 
435 aa  270  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0841  putative potassium transport flavoprotein  37.62 
 
 
446 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0741556 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1106  potassium transport flavoprotein  35.99 
 
 
433 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.251507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.1 
 
 
399 aa  262  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00083188  normal  0.623853 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4567  FAD dependent oxidoreductase  38.2 
 
 
430 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.469601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.24 
 
 
427 aa  259  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1998  putative potassium transport flavoprotein  38.7 
 
 
434 aa  258  9e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4746  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.08 
 
 
428 aa  256  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137781  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7583  flavin-containing monooxygenase  35.7 
 
 
423 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2098  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13111  hypothetical protein  34.71 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  37.89 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1414  hypothetical protein  37.41 
 
 
429 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2255  putative flavoprotein  38.14 
 
 
419 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4240  putative flavoprotein  37.44 
 
 
412 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2709  FAD dependent oxidoreductase  37.16 
 
 
429 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2625  hypothetical protein  36.39 
 
 
415 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623222  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  36.95 
 
 
428 aa  240  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0556  FAD dependent oxidoreductase  36.6 
 
 
443 aa  232  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.881432  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.71 
 
 
377 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02550  potassium transporter (Trk family)  29.85 
 
 
343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.02 
 
 
349 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.44 
 
 
348 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  28.99 
 
 
347 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1342  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.81 
 
 
466 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.09 
 
 
358 aa  147  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.74 
 
 
361 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.68 
 
 
413 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.74 
 
 
352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.55 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.2 
 
 
378 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  31.64 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  31.64 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  31.64 
 
 
347 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  31.64 
 
 
347 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  31.34 
 
 
347 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  35.56 
 
 
347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  30.83 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  31.27 
 
 
347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.68 
 
 
360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3468  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.19 
 
 
381 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.42 
 
 
399 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.38 
 
 
362 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4111  Trk family potassium transport protein  34.58 
 
 
352 aa  99.8  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.26 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.67 
 
 
369 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.96 
 
 
362 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  32.95 
 
 
364 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.47 
 
 
427 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  32.38 
 
 
371 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  31.28 
 
 
640 aa  87.8  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  32.49 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  33.51 
 
 
573 aa  85.5  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.01 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  35.36 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  30.1 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4391  putative potassium transport flavoprotein  30.16 
 
 
598 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.59 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.17 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08351  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  29.84 
 
 
614 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.66 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2143  hypothetical protein  31.84 
 
 
607 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.941743  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01611  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  29.08 
 
 
629 aa  77  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0641774 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18210  Predicted flavoprotein involved in K+ transport  35.4 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21240  predicted flavoprotein involved in K+ transport  31.46 
 
 
607 aa  76.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284302  normal  0.2026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.26 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4752  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  32.09 
 
 
601 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.22 
 
 
375 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.44 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.44 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.44 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26460  predicted flavoprotein involved in K+ transport  34.57 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.319268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>