214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4567 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1414  hypothetical protein  83.08 
 
 
429 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4567  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
430 aa  883    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.469601 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2709  FAD dependent oxidoreductase  81.09 
 
 
429 aa  699    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2098  FAD dependent oxidoreductase  71.14 
 
 
430 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  67.23 
 
 
422 aa  579  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  67.57 
 
 
428 aa  578  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1998  putative potassium transport flavoprotein  67.87 
 
 
434 aa  580  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0556  FAD dependent oxidoreductase  69.46 
 
 
443 aa  576  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.881432  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  67.65 
 
 
422 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  67.23 
 
 
422 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2625  hypothetical protein  60.55 
 
 
415 aa  495  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623222  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7583  flavin-containing monooxygenase  56.45 
 
 
423 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4746  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  59.49 
 
 
428 aa  481  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137781  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.23 
 
 
435 aa  471  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  56.8 
 
 
445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0841  putative potassium transport flavoprotein  52.44 
 
 
446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0741556 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13111  hypothetical protein  49.76 
 
 
433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1106  potassium transport flavoprotein  53.41 
 
 
433 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.251507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.81 
 
 
427 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  40.35 
 
 
419 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  41.4 
 
 
423 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  40.14 
 
 
450 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  39.23 
 
 
450 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  37.62 
 
 
449 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  38.54 
 
 
435 aa  276  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  38.08 
 
 
439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  37.84 
 
 
439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  37.23 
 
 
419 aa  273  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  37.35 
 
 
439 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 
459 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  36.03 
 
 
419 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  37.84 
 
 
439 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  37.98 
 
 
448 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  38.08 
 
 
470 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3222  potassium transport flavoprotein  37.44 
 
 
416 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4240  putative flavoprotein  38.39 
 
 
412 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  38.39 
 
 
446 aa  263  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  38.2 
 
 
417 aa  260  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1664  FAD dependent oxidoreductase  38 
 
 
425 aa  259  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.896547  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.08 
 
 
448 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 
440 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  38 
 
 
441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.44 
 
 
399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00083188  normal  0.623853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3030  hypothetical protein  38.04 
 
 
427 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101073  normal  0.976263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0375  flavin-containing monooxygenase FMO  36.43 
 
 
436 aa  249  5e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3466  hypothetical protein  36.63 
 
 
449 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2255  putative flavoprotein  38.99 
 
 
419 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1342  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.08 
 
 
466 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.57 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.94 
 
 
360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  29.61 
 
 
347 aa  170  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  29.61 
 
 
347 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  29.27 
 
 
347 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  29.37 
 
 
347 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  29.27 
 
 
347 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  30.1 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.8 
 
 
377 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  27.8 
 
 
347 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.05 
 
 
378 aa  143  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.36 
 
 
348 aa  143  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  40.45 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02550  potassium transporter (Trk family)  35.64 
 
 
343 aa  127  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  38.55 
 
 
347 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.33 
 
 
349 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.78 
 
 
372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.23 
 
 
358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.55 
 
 
352 aa  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.94 
 
 
361 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.42 
 
 
348 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.97 
 
 
369 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.8 
 
 
399 aa  96.7  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4111  Trk family potassium transport protein  33.7 
 
 
352 aa  93.6  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.49 
 
 
362 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 
382 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  32.97 
 
 
360 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.11 
 
 
362 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3468  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.31 
 
 
381 aa  86.3  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.61 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.84 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26460  predicted flavoprotein involved in K+ transport  32.32 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  32.22 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  31.28 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.95 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.5 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3826  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  25.98 
 
 
638 aa  69.7  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.11 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  29.19 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  28.57 
 
 
640 aa  68.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  29.89 
 
 
573 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.94 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  28.57 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  30.93 
 
 
378 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.02 
 
 
330 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18210  Predicted flavoprotein involved in K+ transport  33.12 
 
 
401 aa  64.3  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 
380 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>