178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6240 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
399 aa  792    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00083188  normal  0.623853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4240  putative flavoprotein  51 
 
 
412 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2255  putative flavoprotein  51.38 
 
 
419 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  40.15 
 
 
445 aa  265  8.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  38.56 
 
 
449 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  40.1 
 
 
417 aa  262  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  39.76 
 
 
435 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  37.06 
 
 
419 aa  259  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2709  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
429 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  40.2 
 
 
450 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  39.08 
 
 
459 aa  259  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1414  hypothetical protein  37.72 
 
 
429 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  36.7 
 
 
419 aa  257  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4746  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.56 
 
 
428 aa  257  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137781  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  38.48 
 
 
439 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  39.76 
 
 
450 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.64 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.05 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  37.99 
 
 
439 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.24 
 
 
422 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  39.26 
 
 
446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  40.84 
 
 
423 aa  253  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4567  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 
430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.469601 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  39.05 
 
 
470 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1664  FAD dependent oxidoreductase  40.29 
 
 
425 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.896547  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  36.72 
 
 
439 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  36.72 
 
 
439 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 
422 aa  249  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7583  flavin-containing monooxygenase  35.52 
 
 
423 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0375  flavin-containing monooxygenase FMO  39.71 
 
 
436 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
441 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  38.61 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0841  putative potassium transport flavoprotein  36.36 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0741556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.07 
 
 
427 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  38.2 
 
 
448 aa  242  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  36.76 
 
 
428 aa  242  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2098  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 
430 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3030  hypothetical protein  38.78 
 
 
427 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101073  normal  0.976263 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13111  hypothetical protein  33.75 
 
 
433 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.4 
 
 
435 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3222  potassium transport flavoprotein  37.35 
 
 
416 aa  236  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1106  potassium transport flavoprotein  35.86 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.251507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3466  hypothetical protein  38.56 
 
 
449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2625  hypothetical protein  36.92 
 
 
415 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623222  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1998  putative potassium transport flavoprotein  34.74 
 
 
434 aa  229  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0556  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 
443 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.881432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 
419 aa  226  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1342  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.25 
 
 
466 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.82 
 
 
348 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.91 
 
 
360 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.07 
 
 
361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3468  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.17 
 
 
381 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.07 
 
 
352 aa  142  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.05 
 
 
349 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.07 
 
 
377 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  26.01 
 
 
344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  31.46 
 
 
347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  31.46 
 
 
347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  31.92 
 
 
347 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  31.92 
 
 
347 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  30.99 
 
 
347 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  32.08 
 
 
347 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  31.92 
 
 
347 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  30.52 
 
 
347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.11 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.72 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02550  potassium transporter (Trk family)  30.37 
 
 
343 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.76 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.29 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.78 
 
 
378 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.6 
 
 
358 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4111  Trk family potassium transport protein  34.24 
 
 
352 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.79 
 
 
362 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.65 
 
 
348 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.89 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.51 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  24.62 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  30.54 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26460  predicted flavoprotein involved in K+ transport  33.88 
 
 
396 aa  84  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.57 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  31.02 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4968  putative flavoprotein  28.83 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.71 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.58 
 
 
375 aa  77  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.6 
 
 
361 aa  77  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3826  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  27.67 
 
 
638 aa  73.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.11 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.11 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.11 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3364  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.16 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.94 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  28 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.89 
 
 
427 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2881  flavin-containing monooxygenase FMO  25.12 
 
 
609 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  37.59 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4245  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
393 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1908  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.67 
 
 
357 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2987  putative potassium transport flavoprotein  24 
 
 
226 aa  64.3  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846941  normal  0.819627 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1887  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.08 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>