273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3468 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3468  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
381 aa  766    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4111  Trk family potassium transport protein  55.62 
 
 
352 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.83 
 
 
348 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.29 
 
 
349 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  37.97 
 
 
347 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  37.97 
 
 
347 aa  255  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  37.97 
 
 
347 aa  255  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  37.97 
 
 
347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  38.26 
 
 
344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  37.97 
 
 
347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  37.68 
 
 
347 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.64 
 
 
377 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  37.5 
 
 
347 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  36.71 
 
 
347 aa  236  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.94 
 
 
360 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.53 
 
 
378 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.89 
 
 
372 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.42 
 
 
358 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02550  potassium transporter (Trk family)  31.82 
 
 
343 aa  186  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.86 
 
 
352 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.57 
 
 
361 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  35.02 
 
 
446 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.76 
 
 
413 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.57 
 
 
448 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  33.09 
 
 
470 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.17 
 
 
399 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00083188  normal  0.623853 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 
440 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  34.27 
 
 
364 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2255  putative flavoprotein  33.01 
 
 
419 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2987  putative potassium transport flavoprotein  37.44 
 
 
226 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846941  normal  0.819627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3030  hypothetical protein  33.17 
 
 
427 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101073  normal  0.976263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.73 
 
 
362 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  30.52 
 
 
448 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
439 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0375  flavin-containing monooxygenase FMO  32.27 
 
 
436 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.38 
 
 
362 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  40 
 
 
450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3222  potassium transport flavoprotein  29.61 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 
419 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.28 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  39.56 
 
 
450 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.33 
 
 
369 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 
449 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.09 
 
 
348 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2098  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  40.28 
 
 
435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  38.94 
 
 
439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4240  putative flavoprotein  38.6 
 
 
412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.21 
 
 
427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0841  putative potassium transport flavoprotein  29.24 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0741556 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.56 
 
 
435 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  38.94 
 
 
439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  38.94 
 
 
439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  27.88 
 
 
419 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 
423 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 
459 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  39.91 
 
 
441 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3466  hypothetical protein  41.23 
 
 
449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.07 
 
 
348 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  37.44 
 
 
419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13111  hypothetical protein  27.48 
 
 
433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  36.4 
 
 
417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  28.68 
 
 
428 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4746  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.91 
 
 
428 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137781  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1664  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 
425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.896547  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  28.07 
 
 
360 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 
445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1106  potassium transport flavoprotein  36.15 
 
 
433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.251507 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.12 
 
 
367 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26460  predicted flavoprotein involved in K+ transport  28.91 
 
 
396 aa  107  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2709  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 
429 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  31.56 
 
 
363 aa  106  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1414  hypothetical protein  34.34 
 
 
429 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1342  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.06 
 
 
466 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.16 
 
 
422 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4567  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 
430 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.469601 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7583  flavin-containing monooxygenase  25.36 
 
 
423 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.2 
 
 
399 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.38 
 
 
422 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0556  FAD dependent oxidoreductase  33.84 
 
 
443 aa  100  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.881432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 
422 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1998  putative potassium transport flavoprotein  32.98 
 
 
434 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4968  putative flavoprotein  30.87 
 
 
357 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2625  hypothetical protein  30.15 
 
 
415 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623222  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  27.76 
 
 
371 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4752  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  33.33 
 
 
601 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18210  Predicted flavoprotein involved in K+ transport  29.51 
 
 
401 aa  90.5  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.59 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1416  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  26.79 
 
 
428 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0583  flavin-containing monooxygenase FMO  26.73 
 
 
449 aa  86.7  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.38 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.37 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11089  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11650)  32.8 
 
 
624 aa  82.8  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00144907  normal  0.172126 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08351  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  30.35 
 
 
614 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4856  Flavin-containing monooxygenase  23.81 
 
 
447 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1908  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.88 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2384  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.87 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0867216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.31 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>