271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1414 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1414  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  882    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2709  FAD dependent oxidoreductase  94.64 
 
 
429 aa  846    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4567  FAD dependent oxidoreductase  81.16 
 
 
430 aa  708    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.469601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2098  FAD dependent oxidoreductase  68.24 
 
 
430 aa  600  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  69.14 
 
 
428 aa  598  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  65.87 
 
 
422 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  65.38 
 
 
422 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0556  FAD dependent oxidoreductase  68.29 
 
 
443 aa  578  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.881432  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1998  putative potassium transport flavoprotein  67.57 
 
 
434 aa  579  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  66.83 
 
 
422 aa  567  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7583  flavin-containing monooxygenase  56.01 
 
 
423 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4746  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.73 
 
 
428 aa  488  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137781  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2625  hypothetical protein  56.62 
 
 
415 aa  479  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623222  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  55.4 
 
 
445 aa  476  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.9 
 
 
435 aa  465  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13111  hypothetical protein  51.96 
 
 
433 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0841  putative potassium transport flavoprotein  52.61 
 
 
446 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0741556 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1106  potassium transport flavoprotein  55.28 
 
 
433 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.251507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.24 
 
 
427 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  40.39 
 
 
419 aa  305  9.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 
423 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  37.1 
 
 
419 aa  277  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4240  putative flavoprotein  38.39 
 
 
412 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  39.46 
 
 
450 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  38.82 
 
 
450 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  37.03 
 
 
448 aa  266  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  37.35 
 
 
439 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  37.35 
 
 
439 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  36.61 
 
 
419 aa  260  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 
449 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 
439 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  37.23 
 
 
435 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  38.73 
 
 
446 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.72 
 
 
399 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00083188  normal  0.623853 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  34.8 
 
 
459 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.48 
 
 
448 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  37.99 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3222  potassium transport flavoprotein  36.72 
 
 
416 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3030  hypothetical protein  37.47 
 
 
427 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101073  normal  0.976263 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  36.12 
 
 
439 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  37.41 
 
 
417 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 
441 aa  250  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 
440 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1664  FAD dependent oxidoreductase  36.5 
 
 
425 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.896547  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0375  flavin-containing monooxygenase FMO  36.39 
 
 
436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2255  putative flavoprotein  39.09 
 
 
419 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3466  hypothetical protein  37.25 
 
 
449 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1342  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.27 
 
 
466 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.59 
 
 
360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  28.82 
 
 
344 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  28.01 
 
 
347 aa  173  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  28.01 
 
 
347 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  27.76 
 
 
347 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  27.83 
 
 
347 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  27.83 
 
 
347 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.81 
 
 
377 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.44 
 
 
349 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  27.59 
 
 
347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.38 
 
 
348 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.05 
 
 
372 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.4 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  38.2 
 
 
347 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02550  potassium transporter (Trk family)  36.7 
 
 
343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.43 
 
 
413 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  37.43 
 
 
347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4111  Trk family potassium transport protein  27.79 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.14 
 
 
352 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.51 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.02 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.88 
 
 
369 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.79 
 
 
358 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.55 
 
 
399 aa  92.8  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.61 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.05 
 
 
381 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.05 
 
 
381 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3468  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.34 
 
 
381 aa  90.1  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.12 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26460  predicted flavoprotein involved in K+ transport  31.82 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  30.69 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.18 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.83 
 
 
362 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  30.89 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.25 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.21 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  24.7 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2881  flavin-containing monooxygenase FMO  25.24 
 
 
609 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3826  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  25.49 
 
 
638 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  29.05 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.21 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  27.66 
 
 
640 aa  70.5  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  29.69 
 
 
363 aa  70.1  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1908  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.89 
 
 
357 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.62 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4546  Cyclohexanone monooxygenase  30.16 
 
 
503 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18210  Predicted flavoprotein involved in K+ transport  32.7 
 
 
401 aa  66.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  26.6 
 
 
558 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4690  Cyclohexanone monooxygenase  28.57 
 
 
490 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.557659  normal  0.132484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>