299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3457 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  72.62 
 
 
450 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  72.86 
 
 
450 aa  634    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
423 aa  855    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  69.95 
 
 
449 aa  620  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  70.02 
 
 
435 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  72.45 
 
 
446 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  71.29 
 
 
470 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  71.46 
 
 
448 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  67.7 
 
 
439 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  69.76 
 
 
448 aa  600  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  66.27 
 
 
439 aa  597  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  67.7 
 
 
459 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  66.27 
 
 
439 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  70.71 
 
 
440 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  66.03 
 
 
439 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1664  FAD dependent oxidoreductase  69.81 
 
 
425 aa  588  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.896547  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  70.55 
 
 
441 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  64.76 
 
 
419 aa  580  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  64.58 
 
 
419 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0375  flavin-containing monooxygenase FMO  65.78 
 
 
436 aa  573  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3466  hypothetical protein  69.1 
 
 
449 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  67.88 
 
 
417 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3030  hypothetical protein  65.08 
 
 
427 aa  557  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101073  normal  0.976263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3222  potassium transport flavoprotein  61.02 
 
 
416 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.22 
 
 
422 aa  296  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  41.79 
 
 
445 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4567  FAD dependent oxidoreductase  41.4 
 
 
430 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.469601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  40.24 
 
 
428 aa  290  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.63 
 
 
422 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4746  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.89 
 
 
428 aa  286  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137781  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  41.08 
 
 
422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.29 
 
 
435 aa  278  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1414  hypothetical protein  39.95 
 
 
429 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0556  FAD dependent oxidoreductase  42.14 
 
 
443 aa  276  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.881432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2709  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 
429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.08 
 
 
427 aa  274  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  41.4 
 
 
419 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0841  putative potassium transport flavoprotein  38.66 
 
 
446 aa  272  9e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0741556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4240  putative flavoprotein  41.35 
 
 
412 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2098  FAD dependent oxidoreductase  39.27 
 
 
430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1106  potassium transport flavoprotein  37.95 
 
 
433 aa  259  6e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.251507 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7583  flavin-containing monooxygenase  36.34 
 
 
423 aa  259  9e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1998  putative potassium transport flavoprotein  38.61 
 
 
434 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.84 
 
 
399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00083188  normal  0.623853 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13111  hypothetical protein  34.71 
 
 
433 aa  252  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2255  putative flavoprotein  41.42 
 
 
419 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2625  hypothetical protein  34.96 
 
 
415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623222  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.43 
 
 
377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1342  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.8 
 
 
466 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 
348 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02550  potassium transporter (Trk family)  36.07 
 
 
343 aa  146  8.000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.95 
 
 
361 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.05 
 
 
358 aa  144  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  35.35 
 
 
347 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.21 
 
 
372 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  35.35 
 
 
347 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  35.09 
 
 
347 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  35.35 
 
 
347 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  35.35 
 
 
347 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.87 
 
 
349 aa  137  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.74 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.31 
 
 
413 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.1 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.9 
 
 
378 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.88 
 
 
362 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  35.08 
 
 
347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  34.42 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  33.95 
 
 
344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  35.33 
 
 
347 aa  122  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3468  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.36 
 
 
381 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4111  Trk family potassium transport protein  34.24 
 
 
352 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.01 
 
 
369 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.73 
 
 
399 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.27 
 
 
362 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.02 
 
 
348 aa  96.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  33.33 
 
 
364 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18210  Predicted flavoprotein involved in K+ transport  40.96 
 
 
401 aa  93.6  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.45 
 
 
348 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.83 
 
 
374 aa  87  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  34.4 
 
 
371 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26460  predicted flavoprotein involved in K+ transport  34.36 
 
 
396 aa  86.7  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  31.41 
 
 
573 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  39.34 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  29.53 
 
 
640 aa  85.5  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.59 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.12 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.18 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  31.09 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  32.08 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  29.95 
 
 
363 aa  77  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2143  hypothetical protein  28.02 
 
 
607 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.941743  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.04 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.04 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.04 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4391  putative potassium transport flavoprotein  26.94 
 
 
598 aa  73.6  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  25.13 
 
 
610 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2958  flavin-containing monooxygenase, putative  29.55 
 
 
600 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2881  flavin-containing monooxygenase FMO  24.39 
 
 
609 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>