More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6424 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  76.6 
 
 
439 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  76.36 
 
 
439 aa  680    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  73.22 
 
 
419 aa  649    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  76.85 
 
 
435 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  93.88 
 
 
446 aa  791    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3466  hypothetical protein  84.91 
 
 
449 aa  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  73.35 
 
 
448 aa  650    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  76.83 
 
 
439 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  90.36 
 
 
440 aa  792    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  78.96 
 
 
439 aa  697    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  80.09 
 
 
459 aa  709    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  81.84 
 
 
450 aa  706    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  82.82 
 
 
449 aa  723    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  97.1 
 
 
470 aa  859    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  81.84 
 
 
450 aa  705    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  86.21 
 
 
441 aa  746    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
448 aa  906    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  71.46 
 
 
423 aa  624  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3030  hypothetical protein  73.36 
 
 
427 aa  624  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101073  normal  0.976263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  68.97 
 
 
419 aa  604  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1664  FAD dependent oxidoreductase  67.61 
 
 
425 aa  585  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.896547  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0375  flavin-containing monooxygenase FMO  64.22 
 
 
436 aa  566  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  65.94 
 
 
417 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3222  potassium transport flavoprotein  62.89 
 
 
416 aa  529  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.71 
 
 
422 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  40.92 
 
 
422 aa  296  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0841  putative potassium transport flavoprotein  40.56 
 
 
446 aa  293  3e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0741556 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  41.36 
 
 
445 aa  290  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.08 
 
 
422 aa  289  8e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 
419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4746  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.19 
 
 
428 aa  279  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137781  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.54 
 
 
435 aa  277  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1998  putative potassium transport flavoprotein  40.59 
 
 
434 aa  276  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  39.21 
 
 
428 aa  274  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4240  putative flavoprotein  40 
 
 
412 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.44 
 
 
427 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2098  FAD dependent oxidoreductase  38.11 
 
 
430 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7583  flavin-containing monooxygenase  37.59 
 
 
423 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4567  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 
430 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.469601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.8 
 
 
399 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00083188  normal  0.623853 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1106  potassium transport flavoprotein  37.76 
 
 
433 aa  263  6e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.251507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0556  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 
443 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.881432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1414  hypothetical protein  38.48 
 
 
429 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2255  putative flavoprotein  40.35 
 
 
419 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13111  hypothetical protein  34.07 
 
 
433 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2709  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 
429 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2625  hypothetical protein  37.35 
 
 
415 aa  256  7e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623222  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.99 
 
 
348 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1342  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.95 
 
 
466 aa  187  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.57 
 
 
413 aa  169  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.76 
 
 
377 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3468  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.57 
 
 
381 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.73 
 
 
372 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  37.05 
 
 
347 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02550  potassium transporter (Trk family)  36.7 
 
 
343 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  37.05 
 
 
347 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.71 
 
 
349 aa  143  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.21 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  37.05 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  37.61 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  37.05 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.11 
 
 
352 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.24 
 
 
361 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  35.71 
 
 
347 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  35.71 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  36.16 
 
 
347 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.06 
 
 
358 aa  131  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  35.11 
 
 
347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.94 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.01 
 
 
362 aa  120  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4111  Trk family potassium transport protein  32.78 
 
 
352 aa  118  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.2 
 
 
362 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.29 
 
 
399 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  34.22 
 
 
640 aa  98.2  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.58 
 
 
348 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  39.89 
 
 
407 aa  94  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.3 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.67 
 
 
369 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.69 
 
 
427 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  33.18 
 
 
364 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  33.49 
 
 
371 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.37 
 
 
374 aa  89  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  33.16 
 
 
378 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.26 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.4 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  33.66 
 
 
360 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26460  predicted flavoprotein involved in K+ transport  34.97 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18210  Predicted flavoprotein involved in K+ transport  37.5 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2407  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 
620 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175557  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  31.38 
 
 
573 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08351  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  30.46 
 
 
614 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2143  hypothetical protein  30.05 
 
 
607 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.941743  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  25.14 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
610 aa  73.9  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.66 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.66 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.66 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>