More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2368 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  76.15 
 
 
439 aa  686    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  74.77 
 
 
439 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  72.04 
 
 
419 aa  642    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  79.38 
 
 
450 aa  684    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  74.48 
 
 
439 aa  678    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  77.19 
 
 
435 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  83.33 
 
 
446 aa  706    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3466  hypothetical protein  91.09 
 
 
449 aa  796    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
449 aa  917    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  73.11 
 
 
448 aa  634    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  82.23 
 
 
441 aa  688    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  83.06 
 
 
470 aa  708    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  78.29 
 
 
450 aa  694    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  74.54 
 
 
439 aa  679    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  84.4 
 
 
440 aa  707    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  82.82 
 
 
448 aa  701    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  82.18 
 
 
459 aa  754    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  69.95 
 
 
423 aa  620  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3030  hypothetical protein  73.63 
 
 
427 aa  615  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101073  normal  0.976263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  68.43 
 
 
419 aa  600  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1664  FAD dependent oxidoreductase  67.88 
 
 
425 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.896547  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0375  flavin-containing monooxygenase FMO  61.33 
 
 
436 aa  556  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  63.68 
 
 
417 aa  541  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3222  potassium transport flavoprotein  62.65 
 
 
416 aa  531  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
422 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.67 
 
 
422 aa  299  9e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 
445 aa  290  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 
422 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1998  putative potassium transport flavoprotein  39.86 
 
 
434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  37.75 
 
 
428 aa  281  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0841  putative potassium transport flavoprotein  38.39 
 
 
446 aa  280  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0741556 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4567  FAD dependent oxidoreductase  37.62 
 
 
430 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.469601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.11 
 
 
435 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  38.66 
 
 
419 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2098  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 
430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.19 
 
 
427 aa  273  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4746  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.68 
 
 
428 aa  272  8.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137781  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4240  putative flavoprotein  39.76 
 
 
412 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0556  FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 
443 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.881432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.56 
 
 
399 aa  264  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00083188  normal  0.623853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2709  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 
429 aa  262  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7583  flavin-containing monooxygenase  35.21 
 
 
423 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1414  hypothetical protein  36.76 
 
 
429 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13111  hypothetical protein  33.49 
 
 
433 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1106  potassium transport flavoprotein  35.03 
 
 
433 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.251507 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2255  putative flavoprotein  39.6 
 
 
419 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2625  hypothetical protein  36.56 
 
 
415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623222  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 
377 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1342  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.73 
 
 
466 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.27 
 
 
348 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  30.2 
 
 
347 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  30.2 
 
 
347 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.17 
 
 
360 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.77 
 
 
372 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02550  potassium transporter (Trk family)  35.02 
 
 
343 aa  137  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.72 
 
 
352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.3 
 
 
378 aa  126  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.18 
 
 
361 aa  126  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  35.71 
 
 
347 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  35.71 
 
 
347 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  35.71 
 
 
347 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.3 
 
 
413 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  35.87 
 
 
347 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  36.76 
 
 
347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.43 
 
 
358 aa  121  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  35.42 
 
 
347 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.91 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3468  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.47 
 
 
381 aa  117  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  33.91 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4111  Trk family potassium transport protein  36.28 
 
 
352 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.32 
 
 
362 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.67 
 
 
369 aa  97.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.8 
 
 
399 aa  94  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.53 
 
 
362 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.5 
 
 
374 aa  89.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.4 
 
 
427 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  31.02 
 
 
640 aa  89  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.48 
 
 
375 aa  87.8  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  39.25 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  31.22 
 
 
371 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.18 
 
 
358 aa  86.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26460  predicted flavoprotein involved in K+ transport  34.95 
 
 
396 aa  86.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  32.62 
 
 
573 aa  85.5  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.51 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18210  Predicted flavoprotein involved in K+ transport  38.12 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  31.82 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4391  putative potassium transport flavoprotein  30.41 
 
 
598 aa  80.9  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  27.56 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2143  hypothetical protein  30.6 
 
 
607 aa  80.9  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.941743  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.95 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21240  predicted flavoprotein involved in K+ transport  32.26 
 
 
607 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284302  normal  0.2026 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08351  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  28.93 
 
 
614 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2407  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.81 
 
 
620 aa  74.3  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175557  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.7 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1908  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2958  flavin-containing monooxygenase, putative  32.2 
 
 
600 aa  73.6  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.5 
 
 
381 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2881  flavin-containing monooxygenase FMO  25 
 
 
609 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4752  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  31.96 
 
 
601 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>