136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2809 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  978    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  89.48 
 
 		 486 aa  894    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  65.13 
 
 		 499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  64.39 
 
 		 486 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  61.81 
 
 		 504 aa  582  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  64.92 
 
 		 499 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  65.03 
 
 		 504 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.47 
 
 		 489 aa  542  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  58.11 
 
 		 492 aa  541  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  57.73 
 
 		 493 aa  542  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.11 
 
 		 492 aa  541  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  59.33 
 
 		 491 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  55.79 
 
 		 474 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  55.58 
 
 		 477 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  55.98 
 
 		 486 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  55.77 
 
 		 486 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  55.36 
 
 		 474 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  55.03 
 
 		 498 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.62 
 
 		 496 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  53.62 
 
 		 485 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  48.41 
 
 		 488 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  40.17 
 
 		 478 aa  316  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  40.04 
 
 		 484 aa  299  9e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  38.88 
 
 		 473 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  35.63 
 
 		 480 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  37.5 
 
 		 479 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  35.96 
 
 		 493 aa  236  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  37.67 
 
 		 480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  37.02 
 
 		 505 aa  227  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  35.33 
 
 		 482 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  36.73 
 
 		 482 aa  209  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  44.87 
 
 		 230 aa  108  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.43 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  23.43 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.05 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  28.26 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.32 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.59 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  28.89 
 
 		 610 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.3 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.91 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  26.39 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  26.39 
 
 		 422 aa  57  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4106  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.68 
 
 		 536 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  25.44 
 
 		 640 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.55 
 
 		 435 aa  53.5  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0128  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.81 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000127351  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  23.23 
 
 		 344 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1577  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  28.96 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.975611  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  24.54 
 
 		 425 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1046  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.72 
 
 		 437 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  24.54 
 
 		 445 aa  50.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3472  putative potassium transport flavoprotein  29.29 
 
 		 428 aa  50.4  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1076  putative oxidoreductase  30.05 
 
 		 421 aa  50.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.374205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.84 
 
 		 372 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.84 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3568  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 520 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310917  hitchhiker  0.00379062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.89 
 
 		 399 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.14 
 
 		 367 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.44 
 
 		 369 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  27.88 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  26.72 
 
 		 637 aa  48.5  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  27.1 
 
 		 446 aa  48.5  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2444  K+ transport flavoprotein  23.08 
 
 		 524 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5412  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 520 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  24.51 
 
 		 347 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  27.88 
 
 		 439 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0067  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.11 
 
 		 449 aa  48.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000104201  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.79 
 
 		 515 aa  48.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1887  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.77 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  23.91 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3857  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 530 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.416953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2840  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.89 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000828048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4698  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 530 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3664  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 530 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  25.97 
 
 		 468 aa  47.4  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01611  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  28.18 
 
 		 629 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0641774 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  24.68 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  29.19 
 
 		 573 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1908  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.02 
 
 		 357 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  50 
 
 		 688 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3136  glutamate synthase subunit beta  27.6 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.632002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2142  flavin-containing monooxygenase  26.82 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  normal  0.438077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3091  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  21.99 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.169338  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1221  glutamate synthase subunit beta  27.6 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5044  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.611983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  23.65 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  24.68 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  24.68 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  57.89 
 
 		 465 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03590  monooxygenase protein, putative  26.24 
 
 		 648 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  25.45 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  31.4 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  26.59 
 
 		 381 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  22.88 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  24.68 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>