92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3851 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  1000    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  53.11 
 
 		 485 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  51.59 
 
 		 477 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  51.26 
 
 		 486 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  51.59 
 
 		 474 aa  465  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  51.16 
 
 		 486 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  50.21 
 
 		 492 aa  450  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  50.32 
 
 		 474 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.49 
 
 		 496 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.58 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  48.51 
 
 		 498 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.89 
 
 		 489 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  48.71 
 
 		 493 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  51.37 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  48.41 
 
 		 486 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  51.69 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  48.09 
 
 		 486 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  46.58 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  47.39 
 
 		 504 aa  391  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.27 
 
 		 491 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  41.83 
 
 		 478 aa  362  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  43.35 
 
 		 484 aa  356  5.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 473 aa  297  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  39.55 
 
 		 480 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  39.34 
 
 		 479 aa  272  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  40.32 
 
 		 480 aa  270  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  34.38 
 
 		 493 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  37.47 
 
 		 482 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  36.29 
 
 		 505 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  32.82 
 
 		 482 aa  219  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  41.29 
 
 		 230 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.05 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.605553 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  27.23 
 
 		 637 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03590  monooxygenase protein, putative  28.02 
 
 		 648 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.86 
 
 		 417 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  24.31 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.86 
 
 		 360 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  28.97 
 
 		 573 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  27.48 
 
 		 610 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1908  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.44 
 
 		 357 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  24.75 
 
 		 347 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  24.75 
 
 		 347 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  24.75 
 
 		 347 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  24.75 
 
 		 347 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.6 
 
 		 362 aa  50.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  24.26 
 
 		 347 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.61 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  30.19 
 
 		 364 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3795  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  28.26 
 
 		 326 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000252573  hitchhiker  0.00000000266911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4569  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 479 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3870  putative monooxygenase  30.3 
 
 		 499 aa  48.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.06 
 
 		 367 aa  47.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1834  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.12 
 
 		 484 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2048  flavin-containing monooxygenase FMO  30.5 
 
 		 484 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  24.51 
 
 		 347 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  28 
 
 		 422 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.19 
 
 		 381 aa  47  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.19 
 
 		 381 aa  47  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.19 
 
 		 381 aa  47  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2542  monooxygenase protein, putative  28.95 
 
 		 603 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05338  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14280)  26.97 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3012  Cyclohexanone monooxygenase  26.69 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  25.74 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5449  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.32 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3575  hypothetical protein  32.33 
 
 		 600 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.656903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0962  monooxygenase, flavin-binding family protein  23.55 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4506  cyclohexanone monooxygenase  28.18 
 
 		 661 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.51 
 
 		 377 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.64 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  28.64 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  28 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  26.96 
 
 		 419 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  26.03 
 
 		 455 aa  45.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  24.51 
 
 		 347 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2958  flavin-containing monooxygenase, putative  30.61 
 
 		 600 aa  45.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.71 
 
 		 348 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3359  Cyclohexanone monooxygenase  27.03 
 
 		 548 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.24 
 
 		 358 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.27 
 
 		 420 aa  44.3  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  40.62 
 
 		 469 aa  44.3  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2127  monooxygenase FAD-binding protein  25.89 
 
 		 524 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00953551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  28.7 
 
 		 344 aa  44.3  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.19 
 
 		 543 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2407  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.47 
 
 		 620 aa  43.9  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4106  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.89 
 
 		 536 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  26.47 
 
 		 524 aa  43.9  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.5 
 
 		 506 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.685298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2977  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  37.37 
 
 		 607 aa  43.5  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5683  hypothetical protein  29.55 
 
 		 491 aa  43.5  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00144248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  24.71 
 
 		 381 aa  43.1  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>