59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1848 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  100 
 
 
480 aa  960    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  66.95 
 
 
480 aa  625  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  66.67 
 
 
482 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  65.68 
 
 
479 aa  592  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  66.46 
 
 
505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  45.31 
 
 
482 aa  323  5e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  41.76 
 
 
484 aa  302  8.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  40.32 
 
 
488 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  39.91 
 
 
474 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  40.09 
 
 
477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  41.41 
 
 
486 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  39.86 
 
 
478 aa  273  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  40.94 
 
 
486 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 
493 aa  269  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  41.63 
 
 
474 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.58 
 
 
496 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  37.67 
 
 
486 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  37.07 
 
 
504 aa  259  9e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.7 
 
 
489 aa  259  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  38.81 
 
 
486 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  37.56 
 
 
492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.1 
 
 
492 aa  252  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.14 
 
 
499 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  40.58 
 
 
485 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  38.84 
 
 
499 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  38.85 
 
 
486 aa  246  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  40.09 
 
 
498 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  36.41 
 
 
473 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  34.62 
 
 
493 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.68 
 
 
491 aa  238  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  39.77 
 
 
504 aa  237  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  43.44 
 
 
230 aa  100  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.69 
 
 
427 aa  57.4  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.79 
 
 
417 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  26.18 
 
 
480 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.32 
 
 
413 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  25.85 
 
 
610 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3256  putative monooxygenase  25.89 
 
 
505 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3194  putative monooxygenase  25.89 
 
 
505 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3203  putative monooxygenase  25.89 
 
 
505 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0255813  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  31.69 
 
 
446 aa  47.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 
494 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9081  Foxred2; FAD-dependent oxidoreductase domain containing 2  27.27 
 
 
532 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.646835  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3323  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  29.1 
 
 
600 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2671  cyclohexanone monooxygenase  25.13 
 
 
498 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4048  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  28.36 
 
 
600 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  25.81 
 
 
320 aa  45.1  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.22 
 
 
362 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6282  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  27.02 
 
 
495 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
543 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2127  monooxygenase FAD-binding protein  25.21 
 
 
524 aa  43.9  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00953551  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4607  cyclohexanone monooxygenase  25 
 
 
529 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  23.5 
 
 
347 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  23.5 
 
 
347 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  25 
 
 
438 aa  43.5  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  23.5 
 
 
347 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  23.5 
 
 
347 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  24.62 
 
 
347 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.82 
 
 
399 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.605553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>