76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0093 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  71.19 
 
 
486 aa  672    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  70.7 
 
 
474 aa  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  100 
 
 
498 aa  1002    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  70.7 
 
 
477 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  71.55 
 
 
474 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  70.34 
 
 
486 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.81 
 
 
496 aa  571  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  58.96 
 
 
486 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  55.58 
 
 
486 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.66 
 
 
499 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  58.19 
 
 
485 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  54.99 
 
 
504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  55.93 
 
 
486 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  60.68 
 
 
504 aa  512  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  58.09 
 
 
499 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.6 
 
 
489 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  52.58 
 
 
493 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  52.84 
 
 
492 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.92 
 
 
491 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.21 
 
 
492 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  48.73 
 
 
488 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  43.76 
 
 
484 aa  352  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  40.95 
 
 
478 aa  342  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  39.61 
 
 
473 aa  313  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  37.94 
 
 
480 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  35.07 
 
 
493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  38.1 
 
 
505 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  37.38 
 
 
479 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  40.09 
 
 
480 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  34.93 
 
 
482 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  35.29 
 
 
482 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  44.91 
 
 
230 aa  128  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.69 
 
 
417 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  25.96 
 
 
438 aa  57  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.02 
 
 
420 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.02 
 
 
369 aa  53.5  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03590  monooxygenase protein, putative  25.68 
 
 
648 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  28.04 
 
 
637 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.85 
 
 
435 aa  52  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4033  putative monooxygenase protein  32.64 
 
 
600 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  29.57 
 
 
573 aa  51.2  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7650  flavin-containing monooxygenase  32.03 
 
 
600 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  26.77 
 
 
347 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  27.56 
 
 
347 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  27.56 
 
 
347 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  27.56 
 
 
347 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  27.56 
 
 
347 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.37 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0615  cyclohexanone monooxygenase  28.05 
 
 
489 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464865  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1918  hypothetical protein  27.19 
 
 
411 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  26.77 
 
 
347 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0619  putative potassium transport flavoprotein  28.86 
 
 
611 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  26.77 
 
 
347 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3575  hypothetical protein  28.38 
 
 
600 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.656903  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.44 
 
 
543 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2958  flavin-containing monooxygenase, putative  31.72 
 
 
600 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  33.59 
 
 
446 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  25.28 
 
 
444 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  30.99 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.7 
 
 
377 aa  45.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08351  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  25.48 
 
 
614 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.23 
 
 
504 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623525  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
484 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  26.55 
 
 
514 aa  44.3  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.85 
 
 
367 aa  44.3  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4048  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  28.38 
 
 
600 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 
427 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.5 
 
 
348 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 
419 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05338  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14280)  25.42 
 
 
519 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  22.35 
 
 
445 aa  44.3  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.07 
 
 
348 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  23.5 
 
 
425 aa  43.9  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.21 
 
 
399 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.605553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  30.19 
 
 
364 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1908  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.44 
 
 
357 aa  43.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>