More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0619 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0617  hypothetical protein  62.95 
 
 
612 aa  784    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0787  hypothetical protein  63.42 
 
 
610 aa  781    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21240  predicted flavoprotein involved in K+ transport  65.2 
 
 
607 aa  805    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284302  normal  0.2026 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3024  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  70.02 
 
 
600 aa  853    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4033  putative monooxygenase protein  69.08 
 
 
600 aa  846    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1943  flavin-containing monooxygenase, putative  65.77 
 
 
615 aa  771    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3323  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  67 
 
 
600 aa  824    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2143  hypothetical protein  67.23 
 
 
607 aa  810    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.941743  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3171  flavin-containing monooxygenase FMO  69.5 
 
 
600 aa  829    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2542  monooxygenase protein, putative  62.16 
 
 
603 aa  758    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2961  putative potassium transport flavoprotein  69.7 
 
 
600 aa  858    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232599  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0126  hypothetical protein  61.65 
 
 
567 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.622475  normal  0.638978 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7650  flavin-containing monooxygenase  66.72 
 
 
600 aa  833    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611149  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0619  putative potassium transport flavoprotein  100 
 
 
611 aa  1266    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2977  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  67.57 
 
 
607 aa  829    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0089  putative potassium transport flavoprotein  71.5 
 
 
602 aa  869    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00322224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0624  hypothetical protein  62.95 
 
 
633 aa  783    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4391  putative potassium transport flavoprotein  64.65 
 
 
598 aa  835    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4048  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  67.34 
 
 
600 aa  828    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2511  putative monooxygenase protein  68.52 
 
 
600 aa  843    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0076  putative potassium transport flavoprotein  70.05 
 
 
600 aa  885    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.6979  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0879  flavin-containing monooxygenase FMO  64.48 
 
 
596 aa  791    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.191041  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4157  monooxygenase protein, putative  65.88 
 
 
599 aa  775    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316237  normal  0.900537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1896  putative potassium transport flavoprotein  64.37 
 
 
609 aa  844    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3575  hypothetical protein  69.19 
 
 
600 aa  786    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.656903  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0637  hypothetical protein  62.95 
 
 
633 aa  783    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939277  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2407  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  61.08 
 
 
620 aa  702    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2958  flavin-containing monooxygenase, putative  65.96 
 
 
600 aa  806    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  54.17 
 
 
573 aa  620  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08351  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  42.28 
 
 
614 aa  438  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01611  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  40.7 
 
 
629 aa  413  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0641774 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  34.33 
 
 
640 aa  383  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11089  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11650)  36.07 
 
 
624 aa  354  2.9999999999999997e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00144907  normal  0.172126 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01129  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 
556 aa  353  5.9999999999999994e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00253051  normal  0.734558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4752  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  35.53 
 
 
601 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03590  monooxygenase protein, putative  34.68 
 
 
648 aa  311  2e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  31.72 
 
 
637 aa  279  1e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  30.02 
 
 
610 aa  273  6e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4542  putative flavoprotein involved in K+ transport  35.03 
 
 
207 aa  126  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  25.59 
 
 
378 aa  124  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00586  conserved hypothetical protein  25.57 
 
 
536 aa  123  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.793927 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  24.21 
 
 
347 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.81 
 
 
372 aa  93.6  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.79 
 
 
377 aa  90.5  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  22.77 
 
 
347 aa  90.5  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  28.95 
 
 
347 aa  87.8  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  28.95 
 
 
347 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  24.78 
 
 
347 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  28.95 
 
 
347 aa  87.4  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  28.95 
 
 
347 aa  87.4  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.75 
 
 
378 aa  87  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
382 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
382 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.72 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  25.84 
 
 
489 aa  84.3  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  25.21 
 
 
491 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  30.85 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  24.85 
 
 
407 aa  82  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  26.42 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2012  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 
651 aa  81.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  24.57 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.52 
 
 
504 aa  81.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623525  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.62 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.71 
 
 
427 aa  80.1  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.05 
 
 
348 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1789  flavin-binding monooxygenase  24.08 
 
 
531 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000161654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1528  FAD-binding monooxygenase, putative  23.92 
 
 
496 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149589  normal  0.0289416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 
439 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.56 
 
 
485 aa  79  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  29.7 
 
 
439 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  28.07 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  28.27 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  24.32 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
642 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
642 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  28.27 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  22.48 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.54 
 
 
816 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1834  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.71 
 
 
484 aa  77  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.89 
 
 
361 aa  76.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.41 
 
 
399 aa  77  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0558  4-hydroxyacetophenone monooxygenase  23.08 
 
 
529 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0347496  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1347  putative monooxygenase  23.08 
 
 
529 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1270  putative monooxygenase  23.08 
 
 
529 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5565  flavin-containing monooxygenase FMO  25.78 
 
 
539 aa  76.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.192347  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1009  flavin-containing monooxygenase FMO  23.08 
 
 
529 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.87 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
423 aa  76.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2526  flavin-binding monooxygenase-like protein  23.08 
 
 
524 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.27 
 
 
816 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0316  cyclohexanone monooxygenase  24.27 
 
 
656 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140448  normal  0.328483 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.81 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  30.26 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
449 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.11 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4879  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 
533 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491968  normal  0.91768 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.27 
 
 
818 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0114186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>