62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0114 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  100 
 
 		 482 aa  964    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  84.62 
 
 		 505 aa  771    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  66.67 
 
 		 480 aa  596  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  63.45 
 
 		 480 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  65.03 
 
 		 479 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  45.7 
 
 		 482 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  41.33 
 
 		 484 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  39.86 
 
 		 478 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  37.55 
 
 		 477 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  38.56 
 
 		 474 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  39.43 
 
 		 486 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  38.56 
 
 		 486 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  37.47 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  37.91 
 
 		 474 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  39.68 
 
 		 485 aa  266  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 493 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.07 
 
 		 489 aa  259  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.34 
 
 		 496 aa  256  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 504 aa  255  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.06 
 
 		 491 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 		 473 aa  249  9e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  39.39 
 
 		 504 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.09 
 
 		 492 aa  247  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  34.93 
 
 		 498 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  35.67 
 
 		 493 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 		 492 aa  244  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.26 
 
 		 499 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  35.33 
 
 		 486 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  34.64 
 
 		 486 aa  239  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  38.21 
 
 		 499 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  36.08 
 
 		 486 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  35.62 
 
 		 230 aa  97.8  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2746  L-lysine 6-monooxygenase, putative  28.4 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0296167  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1869  putative peptide monooxygenase  26.91 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.67 
 
 		 420 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.48 
 
 		 348 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2961  L-lysine 6-monooxygenase, putative  26.46 
 
 		 440 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.480954  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.28 
 
 		 417 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  24.38 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.59 
 
 		 375 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0586  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.17 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 382 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.63 
 
 		 413 aa  47  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.75 
 
 		 427 aa  47  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.69 
 
 		 543 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  31.16 
 
 		 381 aa  46.6  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  26.21 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.18 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  27.23 
 
 		 347 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  23.68 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  23.01 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  23.18 
 
 		 352 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.09 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.73 
 
 		 372 aa  45.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1859  L-ornithine N5-oxygenase  24.77 
 
 		 445 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.886808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0659  putative oxidoreductase  34.48 
 
 		 485 aa  44.3  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1418  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  26.67 
 
 		 341 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4269  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 		 512 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0844717  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  23.01 
 
 		 422 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  24.39 
 
 		 347 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>