69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3939 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  91.98 
 
 
474 aa  860    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  98.15 
 
 
486 aa  955    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  95.36 
 
 
474 aa  904    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  70.3 
 
 
498 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  94.13 
 
 
477 aa  896    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
486 aa  973    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.17 
 
 
496 aa  558  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  59.91 
 
 
499 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  59.48 
 
 
486 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  59.03 
 
 
485 aa  521  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  57.26 
 
 
486 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.93 
 
 
489 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  61.28 
 
 
504 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  56.34 
 
 
493 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  57.48 
 
 
504 aa  509  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  60.13 
 
 
499 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  55.77 
 
 
486 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  57.05 
 
 
492 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56 
 
 
492 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.87 
 
 
491 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  51.16 
 
 
488 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  42.39 
 
 
478 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  42.46 
 
 
484 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  41.24 
 
 
473 aa  312  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  40.14 
 
 
480 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  36.2 
 
 
493 aa  271  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  40.54 
 
 
479 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  39.68 
 
 
505 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  40.94 
 
 
480 aa  243  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  37.99 
 
 
482 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  36.17 
 
 
482 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  45.51 
 
 
230 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  30.05 
 
 
637 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.1 
 
 
417 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  30.59 
 
 
573 aa  54.7  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  34.78 
 
 
443 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  28.85 
 
 
422 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  30.22 
 
 
610 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  28.71 
 
 
422 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03590  monooxygenase protein, putative  26.85 
 
 
648 aa  50.8  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.17 
 
 
348 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0977  putative flavin-binding monooxygenase  27.54 
 
 
499 aa  50.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.321633 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08351  flavin-binding monooxygenase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_4G09220)  27.31 
 
 
614 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.97 
 
 
420 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  28.05 
 
 
491 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.05 
 
 
543 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.43 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  30.22 
 
 
381 aa  47.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  28.04 
 
 
446 aa  47  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2958  flavin-containing monooxygenase, putative  29.25 
 
 
600 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  30.92 
 
 
448 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.39 
 
 
427 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0615  cyclohexanone monooxygenase  29.03 
 
 
489 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464865  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
419 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  22.22 
 
 
425 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  22.22 
 
 
445 aa  45.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3323  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  29.14 
 
 
600 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5449  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.2 
 
 
488 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  29.09 
 
 
450 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2301  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  25.66 
 
 
496 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  23.46 
 
 
444 aa  44.3  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2542  monooxygenase protein, putative  26.53 
 
 
603 aa  44.3  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4506  cyclohexanone monooxygenase  27.68 
 
 
661 aa  43.9  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569378  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4048  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  29.14 
 
 
600 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5081  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.52 
 
 
562 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5196  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.52 
 
 
562 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125456  decreased coverage  0.0027232 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3172  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.52 
 
 
562 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.38 
 
 
369 aa  43.1  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0074  monooxygenase flavin-binding family protein  29.85 
 
 
484 aa  43.1  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>