144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0532 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  72.45 
 
 
492 aa  712    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  75.82 
 
 
489 aa  733    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  73.06 
 
 
492 aa  717    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  70.87 
 
 
491 aa  660    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
493 aa  992    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  68.6 
 
 
486 aa  627  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  69.07 
 
 
504 aa  622  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  66.88 
 
 
499 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  63.95 
 
 
504 aa  612  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  66.03 
 
 
499 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  58.4 
 
 
486 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  58.44 
 
 
486 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  56.72 
 
 
474 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  56.9 
 
 
486 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  55.86 
 
 
477 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  56.48 
 
 
486 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  56.93 
 
 
474 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.2 
 
 
496 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  52.43 
 
 
485 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  52.58 
 
 
498 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  48.73 
 
 
488 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  41 
 
 
484 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  38.25 
 
 
478 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  40.78 
 
 
473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  36.49 
 
 
480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  37.95 
 
 
479 aa  257  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  36.48 
 
 
493 aa  257  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  36.16 
 
 
505 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  36.67 
 
 
480 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  34.57 
 
 
482 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  36.34 
 
 
482 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  52.94 
 
 
230 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  30.9 
 
 
610 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.52 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.605553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  28.69 
 
 
443 aa  60.1  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 
419 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  31.94 
 
 
573 aa  59.3  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.61 
 
 
399 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
459 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  31.71 
 
 
439 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03590  monooxygenase protein, putative  27.78 
 
 
648 aa  57  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  32.42 
 
 
446 aa  57  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  31.71 
 
 
439 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.91 
 
 
377 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  26.87 
 
 
458 aa  56.6  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  31.71 
 
 
439 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 
439 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 
440 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  30.81 
 
 
419 aa  54.3  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.27 
 
 
417 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2129  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 
517 aa  53.9  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.788233  normal  0.83266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  33.17 
 
 
448 aa  53.9  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 
449 aa  53.9  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 
441 aa  53.5  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.98 
 
 
358 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  26.79 
 
 
446 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  31.05 
 
 
470 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  26.55 
 
 
381 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3222  potassium transport flavoprotein  29.76 
 
 
416 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.24 
 
 
543 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4036  lysine/ornithine N-monooxygenase  26.75 
 
 
462 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  28.78 
 
 
419 aa  51.2  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  30.28 
 
 
450 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  24.37 
 
 
640 aa  50.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.05 
 
 
448 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  28.44 
 
 
417 aa  50.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3266  flavin-containing monooxygenase FMO  29.22 
 
 
435 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130445  normal  0.0359587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  34.33 
 
 
491 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  28.49 
 
 
509 aa  50.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1887  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.02 
 
 
377 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25600  L-ornithine N5-oxygenase-PvdA-like protein  24.47 
 
 
453 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0408  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.06 
 
 
431 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  30.57 
 
 
450 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.5 
 
 
369 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  26 
 
 
344 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.5 
 
 
348 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3466  hypothetical protein  34.01 
 
 
449 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2255  putative flavoprotein  31.79 
 
 
419 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.44 
 
 
428 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  27.78 
 
 
422 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 
445 aa  47.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  28.43 
 
 
637 aa  47  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_31367  predicted protein  24.68 
 
 
819 aa  47  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  25.11 
 
 
310 aa  47  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  25.99 
 
 
454 aa  47  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  27.31 
 
 
422 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.37 
 
 
455 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  30.39 
 
 
455 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1859  L-ornithine N5-oxygenase  24.7 
 
 
445 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.886808  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  23.24 
 
 
653 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  23.24 
 
 
653 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2127  monooxygenase FAD-binding protein  28.7 
 
 
524 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00953551  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.23 
 
 
455 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  28.31 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3885  flavin-containing monooxygenase  29.15 
 
 
505 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  23.24 
 
 
653 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  30.69 
 
 
363 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1073  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.19 
 
 
502 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118854  normal  0.903474 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  25.88 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0875  l-ornithine 5-monooxygenase  25.88 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>