128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4505 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  72.82 
 
 
491 aa  670    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  80.08 
 
 
492 aa  797    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
489 aa  984    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  80.49 
 
 
492 aa  801    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  76.86 
 
 
493 aa  723    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  67.79 
 
 
499 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  69.57 
 
 
504 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  66.74 
 
 
499 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  64.35 
 
 
504 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  65.52 
 
 
486 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  58.47 
 
 
486 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  58.42 
 
 
486 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  58.17 
 
 
477 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  58.77 
 
 
486 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  58.39 
 
 
474 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  59.02 
 
 
474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  57.93 
 
 
486 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.27 
 
 
496 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  55.13 
 
 
498 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  51.88 
 
 
485 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  49.89 
 
 
488 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  41.67 
 
 
484 aa  320  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  39 
 
 
478 aa  315  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  40.47 
 
 
473 aa  299  6e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  36.1 
 
 
493 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  37.75 
 
 
480 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  36.32 
 
 
479 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  36.14 
 
 
505 aa  239  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  37.7 
 
 
480 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  36.07 
 
 
482 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  35.21 
 
 
482 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  54.33 
 
 
230 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  34.3 
 
 
448 aa  59.7  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.73 
 
 
417 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  32.66 
 
 
419 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 
441 aa  54.3  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.7 
 
 
369 aa  53.5  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  26.34 
 
 
446 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.43 
 
 
399 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.13 
 
 
358 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  29.02 
 
 
610 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  28.99 
 
 
378 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 
440 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 
459 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  33.17 
 
 
446 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  28 
 
 
454 aa  52  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1540  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.85 
 
 
458 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.310035  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  33.67 
 
 
470 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2129  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 
517 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.788233  normal  0.83266 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1561  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.11 
 
 
458 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000104933  normal  0.191057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  32.62 
 
 
443 aa  50.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
448 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 
484 aa  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  31.25 
 
 
439 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
642 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
642 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  31.25 
 
 
439 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  31.88 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.92 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.605553 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  27.59 
 
 
637 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.15 
 
 
458 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.15 
 
 
458 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  30.21 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  26.58 
 
 
310 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2304  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.91 
 
 
572 aa  48.5  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.095773  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  28.14 
 
 
363 aa  47.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 
449 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.54 
 
 
551 aa  47.8  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.7 
 
 
367 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  30.58 
 
 
439 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  26.32 
 
 
468 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.29 
 
 
427 aa  47.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2090  l-ornithine 5-monooxygenase  26.32 
 
 
495 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869348  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0375  flavin-containing monooxygenase FMO  31.03 
 
 
436 aa  47  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3815  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.86 
 
 
505 aa  47  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4789  lysine/ornithine N-monooxygenase  27.57 
 
 
458 aa  46.6  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00013329  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.91 
 
 
377 aa  47  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3466  hypothetical protein  35.57 
 
 
449 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2382  cyclic nucleotide-regulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.55 
 
 
573 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.297747  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3172  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.58 
 
 
562 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  27.33 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  23.61 
 
 
317 aa  46.6  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5196  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.58 
 
 
562 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125456  decreased coverage  0.0027232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  29.53 
 
 
509 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.21 
 
 
348 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  24.81 
 
 
469 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1618  lysine/ornithine N-monooxygenase  26.7 
 
 
458 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00185713 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5081  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.58 
 
 
562 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4036  lysine/ornithine N-monooxygenase  26.2 
 
 
462 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  29.27 
 
 
573 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  28.77 
 
 
438 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
445 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  28.52 
 
 
458 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4245  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.61 
 
 
393 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.12 
 
 
422 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.84 
 
 
378 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  30.07 
 
 
511 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3222  potassium transport flavoprotein  30.05 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>