121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2112 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  100 
 
 		 478 aa  974    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  48.7 
 
 		 484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  42.52 
 
 		 473 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  41.83 
 
 		 488 aa  362  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  43.48 
 
 		 474 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  43.04 
 
 		 486 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  43.23 
 
 		 477 aa  353  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  42.39 
 
 		 486 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  41.9 
 
 		 485 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  41.52 
 
 		 474 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.91 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  40.39 
 
 		 498 aa  320  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  39.96 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  40.17 
 
 		 486 aa  316  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39 
 
 		 489 aa  315  8e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  38.74 
 
 		 492 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.74 
 
 		 492 aa  312  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 		 493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  40.77 
 
 		 504 aa  300  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.86 
 
 		 499 aa  299  8e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  37.78 
 
 		 486 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  39.74 
 
 		 499 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.46 
 
 		 491 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 		 504 aa  284  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  36.4 
 
 		 493 aa  279  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  39.58 
 
 		 480 aa  272  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  41.08 
 
 		 479 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  39.86 
 
 		 482 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  40.28 
 
 		 505 aa  261  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  39.86 
 
 		 480 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  35.15 
 
 		 482 aa  216  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  56.07 
 
 		 230 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.77 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.81 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  28.97 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  28.92 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.57 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2658  putative dimethylaniline monooxygenase  27.22 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1120  putative oxidoreductase  25.88 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.78 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.605553 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  31.09 
 
 		 610 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.95 
 
 		 375 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6485  putative oxidoreductase  25.29 
 
 		 422 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  26.24 
 
 		 438 aa  53.5  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  27.56 
 
 		 573 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.7 
 
 		 362 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3466  hypothetical protein  31.82 
 
 		 449 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1943  flavin-containing monooxygenase, putative  33.06 
 
 		 615 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  28.02 
 
 		 417 aa  50.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.88 
 
 		 362 aa  50.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  30.74 
 
 		 491 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.84 
 
 		 348 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0375  flavin-containing monooxygenase FMO  27.18 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  25.12 
 
 		 443 aa  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  27.19 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1203  thioredoxin reductase  24.53 
 
 		 305 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0940141  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0184  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.85 
 
 		 495 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  28.96 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.86 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2129  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 517 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.788233  normal  0.83266 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2127  monooxygenase FAD-binding protein  27.52 
 
 		 524 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00953551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 449 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4746  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.5 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  28.44 
 
 		 419 aa  48.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  28.86 
 
 		 637 aa  47.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4613  hypothetical protein  26.7 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.83 
 
 		 358 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 439 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  29.7 
 
 		 360 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.19 
 
 		 361 aa  47.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.59 
 
 		 413 aa  47.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2770  hypothetical protein  26.91 
 
 		 641 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.911109  normal  0.95794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  29.66 
 
 		 458 aa  47  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  28.44 
 
 		 439 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3194  putative monooxygenase  26.37 
 
 		 505 aa  47  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16420  predicted flavoprotein involved in K+ transport  30.21 
 
 		 525 aa  47  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3256  putative monooxygenase  26.37 
 
 		 505 aa  47  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1887  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.2 
 
 		 377 aa  47  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3203  putative monooxygenase  26.37 
 
 		 505 aa  47  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0255813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2740  hypothetical protein  26.91 
 
 		 641 aa  47  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2784  hypothetical protein  26.91 
 
 		 641 aa  47  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  28.44 
 
 		 439 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  28.14 
 
 		 650 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3457  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.439481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13150  predicted flavoprotein involved in K+ transport  31.85 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  27.83 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.75 
 
 		 543 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0043  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.2 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0465  thioredoxin reductase  27.57 
 
 		 305 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1825  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  25.6 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4607  cyclohexanone monooxygenase  26.34 
 
 		 529 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.64 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4752  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  29.33 
 
 		 601 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5449  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.61 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 459 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2216  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.32 
 
 		 368 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00232984  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.73 
 
 		 378 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1088  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  34.3 
 
 		 499 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>