79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4836 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  963    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  65.68 
 
 		 480 aa  612  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  65.38 
 
 		 480 aa  605  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  65.03 
 
 		 482 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  64 
 
 		 505 aa  558  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  46.14 
 
 		 482 aa  340  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  39.39 
 
 		 484 aa  299  6e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  39.36 
 
 		 488 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  41.37 
 
 		 478 aa  297  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.11 
 
 		 496 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 		 493 aa  289  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  40.8 
 
 		 486 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  39.69 
 
 		 474 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  40.31 
 
 		 477 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 		 485 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  39.91 
 
 		 486 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  38.44 
 
 		 474 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  38.95 
 
 		 493 aa  273  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.54 
 
 		 489 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  37.33 
 
 		 486 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  38.3 
 
 		 486 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  35.18 
 
 		 492 aa  266  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.4 
 
 		 492 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.74 
 
 		 491 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 		 504 aa  257  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  37.67 
 
 		 498 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  36.93 
 
 		 486 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 473 aa  256  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  39.52 
 
 		 504 aa  253  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.99 
 
 		 499 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  38.67 
 
 		 499 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  43.81 
 
 		 230 aa  89.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  23.77 
 
 		 347 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  23.77 
 
 		 347 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.77 
 
 		 417 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  23.77 
 
 		 347 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  25.79 
 
 		 347 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  23.77 
 
 		 347 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  23.77 
 
 		 347 aa  50.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  23.77 
 
 		 347 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  24.32 
 
 		 480 aa  50.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3575  hypothetical protein  31.62 
 
 		 600 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.656903  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  23.32 
 
 		 347 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2120  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  25.78 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0401511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2095  L-ornithine N5-oxygenase PvdA  31.97 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4033  putative monooxygenase protein  26.03 
 
 		 600 aa  47.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  23.68 
 
 		 344 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.09 
 
 		 427 aa  47  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  27.11 
 
 		 650 aa  47  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 494 aa  47  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  25.33 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.75 
 
 		 413 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3323  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  25.31 
 
 		 600 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3171  flavin-containing monooxygenase FMO  30.47 
 
 		 600 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3194  putative monooxygenase  23.92 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.27 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.605553 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3256  putative monooxygenase  23.92 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3203  putative monooxygenase  23.92 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0255813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3796  L-ornithine N5-oxygenase  25.46 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902122  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2511  putative monooxygenase protein  29.69 
 
 		 600 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4569  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 479 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2671  cyclohexanone monooxygenase  25.24 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1973  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  26.27 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0295223 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.37 
 
 		 375 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2143  hypothetical protein  31.25 
 
 		 607 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.941743  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2958  flavin-containing monooxygenase, putative  28.91 
 
 		 600 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11422  monoxygenase  24.12 
 
 		 491 aa  44.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.178527  normal  0.251324 
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  46.15 
 
 		 465 aa  44.3  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4048  putative flavoprotein containing monooxygenase involved in K+ transport  24.9 
 
 		 600 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2746  L-lysine 6-monooxygenase, putative  26.02 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0296167  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00850  flavin-containing monooxygenase, putative  22.22 
 
 		 637 aa  43.9  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.13103  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.61 
 
 		 369 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4607  cyclohexanone monooxygenase  24.41 
 
 		 529 aa  43.5  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4752  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  26.38 
 
 		 601 aa  43.5  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0076  putative potassium transport flavoprotein  24.42 
 
 		 600 aa  43.1  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.6979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3885  flavin-containing monooxygenase  27.24 
 
 		 505 aa  43.1  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>