169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0417 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  71.15 
 
 		 504 aa  639    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  71.04 
 
 		 492 aa  677    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  72.82 
 
 		 489 aa  701    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  71.04 
 
 		 492 aa  676    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  67.98 
 
 		 499 aa  654    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 491 aa  992    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  71.46 
 
 		 493 aa  677    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  67.7 
 
 		 499 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  68.24 
 
 		 486 aa  626  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  64.33 
 
 		 504 aa  613  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  59.33 
 
 		 486 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  58.44 
 
 		 486 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  58.37 
 
 		 474 aa  525  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  56.87 
 
 		 477 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  57.73 
 
 		 486 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  56.87 
 
 		 474 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  56.87 
 
 		 486 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  54.68 
 
 		 485 aa  472  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.07 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  52.9 
 
 		 498 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  46.27 
 
 		 488 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  43.47 
 
 		 484 aa  351  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 		 473 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  36.46 
 
 		 478 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  36.28 
 
 		 493 aa  277  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  36.24 
 
 		 480 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  36.6 
 
 		 505 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  36.88 
 
 		 479 aa  253  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  34.56 
 
 		 482 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  36.69 
 
 		 480 aa  230  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  36.58 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  53.54 
 
 		 230 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.03 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.35 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.75 
 
 		 399 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.605553 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  25.97 
 
 		 610 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03590  monooxygenase protein, putative  27.31 
 
 		 648 aa  53.9  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  28.99 
 
 		 439 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  29.95 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2382  cyclic nucleotide-regulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.32 
 
 		 573 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  28.5 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  30.49 
 
 		 550 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3815  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.15 
 
 		 505 aa  52.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  31.03 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  28.5 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  28.02 
 
 		 419 aa  52  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.7 
 
 		 358 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.09 
 
 		 427 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  27 
 
 		 674 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.28 
 
 		 427 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 439 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  30.45 
 
 		 363 aa  50.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  28.25 
 
 		 667 aa  50.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28157  putative flavin-containing monooxygenase  23.43 
 
 		 640 aa  50.4  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  26.03 
 
 		 472 aa  50.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0128  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.99 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000127351  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.65 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  28.14 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  26.03 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  26.46 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  26.03 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  25 
 
 		 659 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  26.96 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  29.81 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.33 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  26.96 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  26.96 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.33 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.28 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3657  glutamate synthase subunit beta  26.05 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  25 
 
 		 659 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4345  glutamate synthase subunit beta  24.89 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0056621  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  27.03 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0768743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  25 
 
 		 659 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2304  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.08 
 
 		 572 aa  48.5  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.095773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  25 
 
 		 659 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.69 
 
 		 505 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  26.96 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  26.46 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  25 
 
 		 659 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  25 
 
 		 659 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  25 
 
 		 659 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  26.14 
 
 		 653 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  25 
 
 		 659 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  29.39 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  26.14 
 
 		 653 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  29.63 
 
 		 550 aa  48.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  28.02 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.5 
 
 		 375 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  26.14 
 
 		 653 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  26.15 
 
 		 344 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0251  flavin-containing monooxygenase FMO  28.91 
 
 		 573 aa  47.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  26.05 
 
 		 472 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  26.97 
 
 		 674 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  25.73 
 
 		 653 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6873  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.02 
 
 		 420 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>